89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4315 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 445 aa  910    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4314  glycoside hydrolase family protein  57.64 
 
 		 412 aa  425  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  43.41 
 
 		 477 aa  343  4e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  43.55 
 
 		 1748 aa  319  7e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3868  glycoside hydrolase family protein  40.1 
 
 		 430 aa  275  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3207  glycoside hydrolase family protein  40.68 
 
 		 381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1409  glycoside hydrolase family 8  38.6 
 
 		 432 aa  267  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0686478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2684  glycoside hydrolase family protein  47.43 
 
 		 292 aa  239  5.999999999999999e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1258  glycoside hydrolase family 8  35.47 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  34.58 
 
 		 912 aa  216  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1432  endoglucanase Y  36.58 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  26.48 
 
 		 460 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  28.83 
 
 		 477 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  25.62 
 
 		 465 aa  70.1  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  24.36 
 
 		 1152 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2263  glycoside hydrolase family protein  26.96 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.374897  normal  0.190888 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  27.08 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2687  xylanase Y  33.33 
 
 		 106 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  27.44 
 
 		 1223 aa  63.5  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  39.78 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 		 1140 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 		 1140 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  27.74 
 
 		 1140 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0086  chitosanase  25.75 
 
 		 463 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4861  glycoside hydrolase family protein  27.49 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.181594  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  25.65 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0293  glycoside hydrolase family protein  22.86 
 
 		 511 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.240918  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1569  Cellulase  25.93 
 
 		 429 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.153059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1369  cellulase  25.92 
 
 		 419 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140068  normal  0.0392414 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  26.56 
 
 		 337 aa  53.5  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1589  endo-1,4-D-glucanase  28.06 
 
 		 514 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390235  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2145  endo-1,4-D-glucanase  28.06 
 
 		 520 aa  53.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246354  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2008  endo-1,4-D-glucanase  30.2 
 
 		 508 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2231  endo-1,4-D-glucanase  28.06 
 
 		 506 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161113  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0686  endo-1,4-D-glucanase  30.2 
 
 		 437 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0792  endo-1,4-D-glucanase  26.25 
 
 		 493 aa  53.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.127237  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3739  glycoside hydrolase family 8  40.7 
 
 		 468 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  28.12 
 
 		 332 aa  52.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1314  Cellulase  38.46 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1259  endo-1,4-D-glucanase  28 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0277614  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1292  endo-1,4-D-glucanase  28 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0452609  normal  0.0578777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2042  endo-1,4-D-glucanase  34.55 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361945  normal  0.401714 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0632  endo-1,4-D-glucanase  28.06 
 
 		 506 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.585544  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4526  endo-1,4-D-glucanase  28.77 
 
 		 409 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00393653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 		 1129 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4797  cellulase  29.41 
 
 		 367 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0273  cellulase  26.53 
 
 		 384 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1380  endo-1,4-D-glucanase  29.19 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532451  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1358  endo-1,4-D-glucanase  29.19 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0962234  normal  0.162374 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0898  endo-1,4-D-glucanase  29.19 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000507081  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1029  endoglucanase  39.6 
 
 		 403 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1925  endo-1,4-D-glucanase  27.49 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0105  cellulase  31.29 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535219  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5838  endo-1,4-D-glucanase  33.64 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.35562 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  26.83 
 
 		 332 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  28.38 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  34.04 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  26.83 
 
 		 543 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5210  cellulase  28.38 
 
 		 344 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2687  chitosanase  26.12 
 
 		 453 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128394 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3254  endo-1,4-D-glucanase  37.8 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2490  chitosanase  26.12 
 
 		 453 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2421  chitosanase  24.72 
 
 		 453 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00349071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2673  chitosanase  26.12 
 
 		 453 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2695  chitosanase  24.91 
 
 		 453 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.855226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2615  chitosanase  35.29 
 
 		 453 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.978313  hitchhiker  0.00000219507 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  23.58 
 
 		 2690 aa  47.4  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3936  cellulase  33.71 
 
 		 330 aa  47  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0186  endo-1,4-D-glucanase  36.67 
 
 		 368 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0074  endo-1,4-D-glucanase  30.97 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4803  Cellulase  25.29 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2251  endo-1,4-D-glucanase  25.35 
 
 		 387 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0570  endo-1,4-D-glucanase  35.11 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1206  Cellulase  28.14 
 
 		 347 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364245  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03379  endo-1,4-D-glucanase  33.71 
 
 		 368 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3993  endo-1,4-D-glucanase  26.92 
 
 		 369 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.985148  normal  0.495711 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3937  endo-1,4-D-glucanase  33.71 
 
 		 365 aa  43.5  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0936967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03332  hypothetical protein  33.71 
 
 		 368 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3840  endo-1,4-D-glucanase  33.71 
 
 		 370 aa  43.9  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.634821 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3933  endo-1,4-D-glucanase  27.43 
 
 		 369 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3825  endo-1,4-D-glucanase  27.43 
 
 		 369 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4896  endo-1,4-D-glucanase  33.71 
 
 		 370 aa  43.9  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2138  endo-1,4-D-glucanase  36.25 
 
 		 367 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3812  endo-1,4-D-glucanase  27.43 
 
 		 369 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.370483 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2071  endo-1,4-D-glucanase  25.13 
 
 		 379 aa  43.5  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124631 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2378  endo-1,4-D-glucanase  27.4 
 
 		 388 aa  43.5  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3714  licheninase  25.15 
 
 		 417 aa  43.5  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0071  endo-1,4-D-glucanase  28.95 
 
 		 371 aa  43.5  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2637  endo-1,4-D-glucanase  36.25 
 
 		 370 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>