More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3172 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3172  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  492  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1700  hypothetical protein  45.87 
 
 		 234 aa  199  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18190  hypothetical protein  45.45 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2928  hypothetical protein  44.63 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3517  hypothetical protein  44.08 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000201859  normal  0.326196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0382  hypothetical protein  44.9 
 
 		 237 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3178  hypothetical protein  43.62 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.235776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2550  hypothetical protein  45.45 
 
 		 237 aa  187  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  decreased coverage  0.00627186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3165  hypothetical protein  45.45 
 
 		 237 aa  187  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2376  hypothetical protein  44.76 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2221  hypothetical protein  45.31 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3366  hypothetical protein  44.63 
 
 		 237 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699657  normal  0.467325 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3028  hypothetical protein  45.71 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.154556 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3561  hypothetical protein  40.49 
 
 		 237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3677  hypothetical protein  43.27 
 
 		 234 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3162  hypothetical protein  44.9 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0308091  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  38.21 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  37.18 
 
 		 247 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  37.18 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  38.03 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  37.61 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  37.18 
 
 		 247 aa  141  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  36.51 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  38.46 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  41.85 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  37.5 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  35.9 
 
 		 247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  37.34 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  37.34 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  37.34 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  36.67 
 
 		 247 aa  138  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  38.86 
 
 		 248 aa  138  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  36.91 
 
 		 246 aa  138  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  36.91 
 
 		 246 aa  138  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  36.91 
 
 		 246 aa  138  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  36.91 
 
 		 246 aa  138  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  36.91 
 
 		 246 aa  138  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  36.91 
 
 		 246 aa  138  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  36.25 
 
 		 247 aa  138  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  36.71 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  37.34 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  37.34 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  37.34 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  36.14 
 
 		 246 aa  138  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  37.34 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12622  hypothetical protein  36.67 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2570  hypothetical protein  35.86 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2424  hypothetical protein  36.67 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.079823  normal  0.460299 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1368  hypothetical protein  36.29 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2146  hypothetical protein  36.67 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  41.05 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  36.67 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  37.08 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  41.05 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  36.02 
 
 		 249 aa  135  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  37.08 
 
 		 248 aa  135  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  37.08 
 
 		 248 aa  135  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  38.16 
 
 		 248 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5147  hypothetical protein  37.13 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000302619  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  35.17 
 
 		 251 aa  135  7.000000000000001e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  36.91 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  37.04 
 
 		 247 aa  135  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  34.89 
 
 		 249 aa  135  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  35.42 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  39.91 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  36.48 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  36.67 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  36.67 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  36.67 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  40.53 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  36.63 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2629  hypothetical protein  36.51 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  36.82 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6116  hypothetical protein  35.74 
 
 		 250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal  0.165467 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  36.25 
 
 		 247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  37.45 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  35.83 
 
 		 248 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  36.36 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  39.21 
 
 		 248 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  35.83 
 
 		 248 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0825  protein of unknown function DUF28  36.71 
 
 		 249 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  0.0381393 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15350  conserved hypothetical protein TIGR01033  36.29 
 
 		 251 aa  132  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  35.86 
 
 		 250 aa  132  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2351  protein of unknown function DUF28  36.13 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1932  protein of unknown function DUF28  36.13 
 
 		 251 aa  131  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487076  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1779  hypothetical protein  33.76 
 
 		 249 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  37.89 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  34.17 
 
 		 248 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  41.39 
 
 		 246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  35.83 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  35.83 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1249  hypothetical protein  34.02 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13930  conserved hypothetical protein TIGR01033  37.13 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0487372  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3030  hypothetical protein  35.54 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.248633  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  36.32 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1792  hypothetical protein  33.76 
 
 		 249 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  35.83 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3828  hypothetical protein  35.29 
 
 		 251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  35.42 
 
 		 248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0661  hypothetical protein  38.77 
 
 		 248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135239  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>