More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0862 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 231 aa  475  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  45.38 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  42.92 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  44.73 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  43.7 
 
 		 274 aa  175  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  41.11 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  36.8 
 
 		 247 aa  122  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  38.3 
 
 		 216 aa  121  8e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 		 216 aa  118  9e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  33.04 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  34.98 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  34.33 
 
 		 210 aa  110  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  35.59 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  36.86 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  34.68 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  29.61 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  30.26 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  30.26 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  31.56 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  31.95 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  32.4 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  47.47 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  48.48 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  38.93 
 
 		 212 aa  93.6  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  48.48 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  47.47 
 
 		 210 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  32.64 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  32.8 
 
 		 225 aa  92  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  32.89 
 
 		 223 aa  91.7  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  31.67 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  30.13 
 
 		 223 aa  90.9  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  46.22 
 
 		 197 aa  90.1  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  43.52 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 226 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  41.74 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  41.58 
 
 		 220 aa  88.6  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  31.03 
 
 		 243 aa  88.6  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  31.6 
 
 		 227 aa  88.2  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  43.4 
 
 		 244 aa  88.2  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  42.45 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  43.93 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  30.13 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  39.66 
 
 		 195 aa  87.4  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  40.83 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  47.06 
 
 		 217 aa  85.9  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  47.06 
 
 		 217 aa  85.5  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  33.04 
 
 		 232 aa  85.5  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  40.68 
 
 		 202 aa  85.5  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  28.99 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  28.99 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  30.54 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  28.99 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  28.99 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  29.29 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  28.99 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  29.29 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  45.54 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  30.9 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  29.29 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  28.99 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  28.99 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  42.16 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  28.99 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0935  hypothetical protein  28.99 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000274693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  29.29 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  41.58 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  29.29 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  29.29 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  29.29 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  29.29 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  39.09 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  38.98 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  44.44 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  29.87 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  45.63 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0220  hypothetical protein  26.34 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  37.61 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  32.52 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  30.54 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000624181  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  37.21 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  37.61 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  31.46 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  29.44 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  31.47 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1899  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  31.47 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  41.12 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  41.12 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  28.81 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  40.2 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  36.75 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  41.58 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  31.18 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  39.6 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7690  hypothetical protein  36.3 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  26.45 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  41 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  36.75 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>