More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0207 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 		 500 aa  992    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  46.85 
 
 		 435 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0933  preprotein translocase, SecY subunit  48.3 
 
 		 500 aa  412  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.262242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  46.74 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  45.99 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  45.32 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  44.88 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  44.57 
 
 		 435 aa  395  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  44.64 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  46 
 
 		 445 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  44.23 
 
 		 435 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  44.23 
 
 		 435 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  46.68 
 
 		 442 aa  388  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  45.58 
 
 		 443 aa  385  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  45.58 
 
 		 443 aa  385  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  45.64 
 
 		 447 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  45.64 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  44.76 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  45.64 
 
 		 447 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  45.35 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  44.9 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  42.89 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  44.73 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  43.01 
 
 		 437 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  42.79 
 
 		 437 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  43.54 
 
 		 443 aa  368  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  45.35 
 
 		 421 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  44.15 
 
 		 443 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  43.17 
 
 		 435 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  45.5 
 
 		 439 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  44.49 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  45 
 
 		 448 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  45.94 
 
 		 439 aa  369  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  45.5 
 
 		 439 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  44.32 
 
 		 440 aa  365  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  42.27 
 
 		 443 aa  365  1e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1042  preprotein translocase subunit SecY  45.22 
 
 		 439 aa  365  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  44.42 
 
 		 443 aa  364  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  43.82 
 
 		 441 aa  364  2e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  42.98 
 
 		 444 aa  364  3e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  45.22 
 
 		 436 aa  363  4e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  43.81 
 
 		 421 aa  363  4e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  42.73 
 
 		 437 aa  363  4e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  43.62 
 
 		 437 aa  362  8e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  41.83 
 
 		 443 aa  362  1e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  44.15 
 
 		 430 aa  361  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1635  preprotein translocase subunit SecY  44.59 
 
 		 447 aa  360  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  42.45 
 
 		 444 aa  360  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  42.98 
 
 		 443 aa  360  4e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  43.82 
 
 		 441 aa  360  4e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  43.14 
 
 		 442 aa  359  5e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2305  preprotein translocase subunit SecY  44.63 
 
 		 437 aa  359  8e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  41.41 
 
 		 424 aa  359  8e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  41.08 
 
 		 463 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  42.7 
 
 		 443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  43.33 
 
 		 445 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  43.26 
 
 		 442 aa  356  5e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  42.98 
 
 		 445 aa  356  5.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  43.78 
 
 		 436 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.81 
 
 		 428 aa  355  7.999999999999999e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  43.27 
 
 		 441 aa  355  1e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  43.05 
 
 		 420 aa  355  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0495  preprotein translocase subunit SecY  44.52 
 
 		 439 aa  355  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  45.14 
 
 		 436 aa  353  4e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  42.47 
 
 		 437 aa  353  4e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  42.51 
 
 		 444 aa  353  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  43.88 
 
 		 445 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  42.11 
 
 		 438 aa  352  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  43.23 
 
 		 441 aa  352  1e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  42.57 
 
 		 440 aa  351  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0340  preprotein translocase subunit SecY  44.07 
 
 		 435 aa  351  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670272  hitchhiker  0.000594925 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  41.59 
 
 		 446 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  43.17 
 
 		 436 aa  350  3e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  42.36 
 
 		 437 aa  349  6e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  42.6 
 
 		 430 aa  349  7e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001722  preprotein translocase SecY subunit  42.32 
 
 		 444 aa  349  7e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000228975  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  43.49 
 
 		 440 aa  349  8e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  hitchhiker  0.00000321163 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  41.11 
 
 		 446 aa  348  1e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  42.3 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  43.3 
 
 		 453 aa  348  1e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  42 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  42.09 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  41.83 
 
 		 435 aa  348  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  42.07 
 
 		 443 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  41.74 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2154  preprotein translocase subunit SecY  41.87 
 
 		 444 aa  347  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000317062  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  43.6 
 
 		 449 aa  347  3e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  41.26 
 
 		 444 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  41.26 
 
 		 444 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  42.07 
 
 		 446 aa  347  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  42.17 
 
 		 441 aa  346  4e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  43.14 
 
 		 431 aa  347  4e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00750  preprotein translocase subunit SecY  42.32 
 
 		 444 aa  346  5e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  42.63 
 
 		 444 aa  346  6e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  43.68 
 
 		 447 aa  345  8e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  40.8 
 
 		 446 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  41.03 
 
 		 443 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  41.03 
 
 		 443 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  41.26 
 
 		 443 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0377  preprotein translocase subunit SecY  42.21 
 
 		 448 aa  345  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>