More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0933 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0933  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 		 500 aa  1002    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.262242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  48.3 
 
 		 500 aa  434  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  41.77 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  41.4 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.01 
 
 		 442 aa  355  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  41.47 
 
 		 435 aa  354  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  42.98 
 
 		 437 aa  352  7e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  41.13 
 
 		 443 aa  351  2e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  43.56 
 
 		 435 aa  350  4e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  42.86 
 
 		 445 aa  348  9e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  40.39 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  42.12 
 
 		 435 aa  345  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  39.48 
 
 		 437 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  41.08 
 
 		 435 aa  341  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  41.25 
 
 		 435 aa  340  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  40.43 
 
 		 443 aa  340  5e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  42.58 
 
 		 448 aa  338  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  40.81 
 
 		 441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  40.82 
 
 		 435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  41.81 
 
 		 447 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  40.39 
 
 		 435 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  41.81 
 
 		 447 aa  335  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  41.04 
 
 		 435 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  39.74 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  40.56 
 
 		 441 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  40.56 
 
 		 441 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  40.56 
 
 		 441 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  38.19 
 
 		 437 aa  332  9e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  41.3 
 
 		 445 aa  332  9e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  40.09 
 
 		 443 aa  332  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  40.81 
 
 		 443 aa  332  1e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  40.38 
 
 		 443 aa  332  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  40.09 
 
 		 443 aa  332  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  41.58 
 
 		 438 aa  330  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  38.45 
 
 		 463 aa  330  5.0000000000000004e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  40.93 
 
 		 441 aa  329  9e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  41.21 
 
 		 437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  41.59 
 
 		 447 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  38.03 
 
 		 431 aa  327  3e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  40.77 
 
 		 443 aa  327  3e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  40.77 
 
 		 443 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  40.13 
 
 		 441 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  41.05 
 
 		 445 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  38.44 
 
 		 437 aa  326  5e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  41.05 
 
 		 446 aa  325  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  39.83 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  40.86 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  40.3 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  38.92 
 
 		 444 aa  324  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  39.7 
 
 		 420 aa  323  4e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  38.92 
 
 		 437 aa  323  5e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  39.3 
 
 		 439 aa  322  7e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  41.05 
 
 		 445 aa  322  7e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  39.61 
 
 		 431 aa  322  7e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1918  preprotein translocase subunit SecY  39.87 
 
 		 446 aa  322  8e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  40.91 
 
 		 445 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  39.96 
 
 		 440 aa  322  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  41.39 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  40.22 
 
 		 437 aa  320  3e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  39.83 
 
 		 438 aa  320  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4363  preprotein translocase subunit SecY  39.69 
 
 		 437 aa  319  7e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120386  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  38.99 
 
 		 446 aa  319  7.999999999999999e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  38.7 
 
 		 430 aa  319  9e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  39.35 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  38.13 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  41.63 
 
 		 440 aa  318  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  hitchhiker  0.00000321163 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  41.34 
 
 		 438 aa  318  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  40.13 
 
 		 442 aa  317  3e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  39.91 
 
 		 444 aa  317  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  38.34 
 
 		 441 aa  317  4e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  40.38 
 
 		 457 aa  317  4e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  37.72 
 
 		 448 aa  316  5e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  39.87 
 
 		 448 aa  316  5e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  39.61 
 
 		 428 aa  316  7e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1312  preprotein translocase subunit SecY  37.61 
 
 		 431 aa  316  7e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000457849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  40.74 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  40.74 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  39.87 
 
 		 447 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  39.87 
 
 		 447 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  39.7 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0776  preprotein translocase subunit SecY  39.69 
 
 		 455 aa  313  4.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  0.028717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  39 
 
 		 447 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  38.7 
 
 		 430 aa  312  6.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  40.52 
 
 		 443 aa  312  9e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  38.58 
 
 		 442 aa  312  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  40.26 
 
 		 418 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  41.68 
 
 		 442 aa  312  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  39.01 
 
 		 424 aa  312  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  38.17 
 
 		 452 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  38.17 
 
 		 452 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2599  preprotein translocase subunit SecY  40.47 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0785292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  40.74 
 
 		 443 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  38.12 
 
 		 436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  39.52 
 
 		 437 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1399  preprotein translocase, SecY subunit  40.31 
 
 		 446 aa  310  2.9999999999999997e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  38.65 
 
 		 446 aa  310  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  38.72 
 
 		 453 aa  310  5.9999999999999995e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2887  preprotein translocase, SecY subunit  40.81 
 
 		 441 aa  310  5.9999999999999995e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0626195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0275  preprotein translocase subunit SecY  37.64 
 
 		 454 aa  309  6.999999999999999e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0794912  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1206  preprotein translocase SecY subunit  39.09 
 
 		 457 aa  309  9e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533641  normal  0.0165275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>