More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0302 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0302  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 333 aa  679    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.323775  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1775  LacI family transcription regulator  45.18 
 
 		 330 aa  315  8e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2079  transcriptional regulator, LacI family  43.84 
 
 		 341 aa  252  6e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275805  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1372  galactose operon repressor  40 
 
 		 331 aa  249  4e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0539  transcriptional regulator, LacI family  43.58 
 
 		 340 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1547  LacI family transcription regulator  35.42 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0111532  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1340  LacI family transcription regulator  35.42 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000460933  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0714  transcriptional regulator, LacI family  35.15 
 
 		 334 aa  199  7e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02944  DNA-binding transcriptional repressor  33.01 
 
 		 327 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0626  transcriptional regulator, LacI family  33.01 
 
 		 327 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02894  hypothetical protein  33.01 
 
 		 327 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3542  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  33.01 
 
 		 327 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3369  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  33.33 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3257  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  33.01 
 
 		 327 aa  186  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0625  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  33.01 
 
 		 327 aa  186  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4389  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  32.69 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002659  beta-D-galactosidase transcriptional repressor  33.13 
 
 		 328 aa  172  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.443693  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1087  LacI family transcription regulator  31.74 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.42902  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4137  regulatory protein LacI  32.07 
 
 		 359 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03334  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  33.13 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1972  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  29.82 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0103522 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0793  transcriptional regulator, LacI family  29.08 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.137474  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1063  LacI family transcription regulator  28.61 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1949  LacR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 336 aa  145  9e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.721622  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1323  transcription regulator of beta-galactosidase gene  30.63 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1454  LacI family transcription regulator  32.25 
 
 		 334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0012728  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0977  transcriptional regulator, LacI family  25.71 
 
 		 343 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0741  transcriptional regulator, LacI family  24.93 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0909  LacI family transcription regulator  28.49 
 
 		 339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000295634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  29.23 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0881  LacI family transcription regulator  30.99 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000659595  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  28.82 
 
 		 333 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  28.98 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  28.29 
 
 		 340 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  29.11 
 
 		 339 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  28.41 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  26.4 
 
 		 338 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.94 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1913  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.05 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000592501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1526  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.05 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1563  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.05 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00208837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.02 
 
 		 341 aa  110  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  27.67 
 
 		 337 aa  109  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2456  LacI family transcription regulator  27.61 
 
 		 352 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  28.74 
 
 		 341 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  28.74 
 
 		 341 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.74 
 
 		 341 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  28.74 
 
 		 341 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.74 
 
 		 341 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.74 
 
 		 341 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.07 
 
 		 341 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.74 
 
 		 341 aa  108  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.74 
 
 		 341 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1744  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.77 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000285436  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1540  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.77 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000065632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1789  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.02 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0286691 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.48 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.19 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  27.01 
 
 		 333 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  27.79 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  26.63 
 
 		 344 aa  106  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 335 aa  105  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.89 
 
 		 339 aa  105  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.95 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  26.54 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  27.92 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  27.7 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  25.99 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  29.13 
 
 		 335 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.92 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  27.14 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  29.23 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  26.43 
 
 		 332 aa  102  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  26.05 
 
 		 346 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2808  LacI family transcription regulator  28.29 
 
 		 345 aa  102  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0294888  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  26.97 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  26.05 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5365  transcriptional regulator, LacI family  25.41 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000864241  normal  0.850622 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5085  transcriptional regulator, LacI family  24.86 
 
 		 359 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.127627 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  27.22 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.91 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1019  LacI family transcription regulator  27.22 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  25.36 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  26.78 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01670  transcriptional regulator  25.5 
 
 		 348 aa  99.8  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.02 
 
 		 336 aa  99.8  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  26.45 
 
 		 340 aa  99.4  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4504  regulatory protein, LacI  28.21 
 
 		 365 aa  99.8  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.87 
 
 		 341 aa  99.4  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5756  transcriptional regulator, LacI family  25.14 
 
 		 347 aa  99.4  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0420  LacI family transcription regulator  27.82 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130171  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  26.69 
 
 		 361 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  27.27 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  27.43 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  26.59 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  24.63 
 
 		 341 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  27.25 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0568  LacI family transcription regulator  26.2 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000865309  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.59 
 
 		 341 aa  97.8  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  29.46 
 
 		 342 aa  97.4  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>