More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1949 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1949  LacR family transcriptional regulator  100 
 
 		 336 aa  678    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.721622  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1087  LacI family transcription regulator  45.24 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.42902  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1323  transcription regulator of beta-galactosidase gene  43.41 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1063  LacI family transcription regulator  30.65 
 
 		 337 aa  176  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2079  transcriptional regulator, LacI family  32.45 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0539  transcriptional regulator, LacI family  34.12 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0302  LacI family transcription regulator  31.14 
 
 		 333 aa  145  9e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.323775  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1372  galactose operon repressor  30.95 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1547  LacI family transcription regulator  26.67 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0111532  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03334  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  32.06 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0625  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  30.97 
 
 		 327 aa  143  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3257  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  30.97 
 
 		 327 aa  143  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3369  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  30.86 
 
 		 327 aa  143  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002659  beta-D-galactosidase transcriptional repressor  32.45 
 
 		 328 aa  143  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.443693  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02944  DNA-binding transcriptional repressor  30.97 
 
 		 327 aa  142  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0626  transcriptional regulator, LacI family  30.97 
 
 		 327 aa  142  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4389  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  30.97 
 
 		 327 aa  142  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02894  hypothetical protein  30.97 
 
 		 327 aa  142  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3542  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  30.97 
 
 		 327 aa  142  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0714  transcriptional regulator, LacI family  30.06 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1340  LacI family transcription regulator  26.38 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000460933  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1775  LacI family transcription regulator  30.82 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4137  regulatory protein LacI  30.14 
 
 		 359 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1972  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  30.86 
 
 		 326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0103522 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0977  transcriptional regulator, LacI family  27.15 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0741  transcriptional regulator, LacI family  26.32 
 
 		 343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0881  LacI family transcription regulator  29.33 
 
 		 335 aa  125  7e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000659595  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0793  transcriptional regulator, LacI family  29.5 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.137474  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1454  LacI family transcription regulator  25.58 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0012728  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0909  LacI family transcription regulator  26.38 
 
 		 339 aa  106  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000295634  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2290  transcriptional regulator, LacI family  30.75 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.950174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0568  LacI family transcription regulator  25.21 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000865309  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002664  LacI-family regulatory protein  25.94 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3252  transcriptional regulator, LacI family  27.67 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20530  transcriptional regulator, LacI family  25.69 
 
 		 341 aa  96.3  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  31.18 
 
 		 340 aa  95.9  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.57 
 
 		 337 aa  95.1  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  27.27 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2808  LacI family transcription regulator  27.42 
 
 		 345 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0294888  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  25.87 
 
 		 355 aa  94  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  24.86 
 
 		 386 aa  93.2  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  27.64 
 
 		 326 aa  93.2  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2877  transcriptional regulator, LacI family  30.06 
 
 		 372 aa  92.8  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1769  LacI family transcription regulator  25.94 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5093  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  25.51 
 
 		 325 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  26.78 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  23.92 
 
 		 332 aa  90.5  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  23.92 
 
 		 332 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  23.92 
 
 		 332 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  25.29 
 
 		 333 aa  89.4  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  23.63 
 
 		 332 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  23.63 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0198  periplasmic-binding protein/LacI transcriptional regulator  25 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0329  LacI family transcription regulator  26.33 
 
 		 347 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16025  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0182  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.31 
 
 		 347 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  24.64 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  23.63 
 
 		 332 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0234  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.762891  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  23.63 
 
 		 332 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1038  Alanine racemase  29.74 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.255953  normal  0.612025 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  26.84 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  28.49 
 
 		 357 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  28.97 
 
 		 352 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  23.63 
 
 		 332 aa  87  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0194  periplasmic-binding protein/LacI transcriptional regulator  24.71 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0227  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  24.71 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0208  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  24.71 
 
 		 325 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0216  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  24.71 
 
 		 325 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01891  putative sugar-binding protein  26.54 
 
 		 343 aa  87  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0103851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6650  transcriptional regulator, LacI family  28.89 
 
 		 364 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2498  transcriptional regulator, LacI family  29.49 
 
 		 336 aa  86.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2507  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  23.94 
 
 		 338 aa  86.3  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.445797  normal  0.20531 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01670  transcriptional regulator  28.9 
 
 		 348 aa  86.3  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  27.22 
 
 		 341 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  27.22 
 
 		 341 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  23.19 
 
 		 332 aa  85.9  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  27.22 
 
 		 341 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0210  LacI family transcription regulator  24.29 
 
 		 353 aa  85.9  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000188149  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  27.24 
 
 		 340 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  27.22 
 
 		 341 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  27.22 
 
 		 341 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  27.22 
 
 		 341 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0975  transcriptional regulator, LacI family  27.12 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818441  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1440  maltose operon repressor MalR, putative  25.3 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0132709  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  27.22 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0998  LacI family transcription regulator  27.12 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190797 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.89 
 
 		 335 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  23.34 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  23.34 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  27.22 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2445  LacI family transcription regulator  28.21 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0193  transcriptional regulator, LacI family  28.28 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0168  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.74 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3918  LacI family transcription regulator  29.86 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  26.44 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  27.25 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2999  transcriptional regulator AscG  26.87 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  26.01 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>