More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2079 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2079  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 
341 aa  706    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0539  transcriptional regulator, LacI family  81.95 
 
 
340 aa  592  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1547  LacI family transcription regulator  49.4 
 
 
337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0111532  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1340  LacI family transcription regulator  49.11 
 
 
337 aa  323  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000460933  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0714  transcriptional regulator, LacI family  44.55 
 
 
334 aa  302  6.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3369  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  43.11 
 
 
327 aa  263  4e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3257  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  42.51 
 
 
327 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0625  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  42.51 
 
 
327 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4389  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  42.81 
 
 
327 aa  260  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02944  DNA-binding transcriptional repressor  42.22 
 
 
327 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0626  transcriptional regulator, LacI family  42.22 
 
 
327 aa  260  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02894  hypothetical protein  42.22 
 
 
327 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3542  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  42.22 
 
 
327 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4137  regulatory protein LacI  40.36 
 
 
359 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1372  galactose operon repressor  41.32 
 
 
331 aa  253  3e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0302  LacI family transcription regulator  43.84 
 
 
333 aa  252  6e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.323775  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002659  beta-D-galactosidase transcriptional repressor  39.7 
 
 
328 aa  252  8.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.443693  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1972  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  40.36 
 
 
326 aa  251  9.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0103522 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03334  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  40 
 
 
328 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1775  LacI family transcription regulator  37.84 
 
 
330 aa  238  8e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0977  transcriptional regulator, LacI family  34.87 
 
 
343 aa  209  8e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0741  transcriptional regulator, LacI family  35.06 
 
 
343 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0793  transcriptional regulator, LacI family  35.1 
 
 
340 aa  205  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.137474  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1087  LacI family transcription regulator  33.83 
 
 
339 aa  181  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.42902  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1063  LacI family transcription regulator  35.01 
 
 
337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1949  LacR family transcriptional regulator  32.45 
 
 
336 aa  170  3e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.721622  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1323  transcription regulator of beta-galactosidase gene  30.45 
 
 
333 aa  164  3e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  33.82 
 
 
330 aa  159  7e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  31.62 
 
 
341 aa  159  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1454  LacI family transcription regulator  31.9 
 
 
334 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0012728  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  32.76 
 
 
337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.71 
 
 
328 aa  155  9e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0568  LacI family transcription regulator  28.78 
 
 
339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000865309  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  34.12 
 
 
328 aa  153  5e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0881  LacI family transcription regulator  31.94 
 
 
335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000659595  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0909  LacI family transcription regulator  32.06 
 
 
339 aa  150  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000295634  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  31.36 
 
 
346 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  32.84 
 
 
336 aa  149  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  31.07 
 
 
346 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  32.77 
 
 
353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1559  alanine racemase  30.09 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000066632  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  30.7 
 
 
347 aa  142  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  30.21 
 
 
340 aa  142  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  31.07 
 
 
355 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0524  alanine racemase  31.09 
 
 
339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0285  alanine racemase  32.35 
 
 
337 aa  140  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  31.25 
 
 
337 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  29.11 
 
 
342 aa  139  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  30.12 
 
 
333 aa  139  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  29.15 
 
 
331 aa  139  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  31.58 
 
 
342 aa  139  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 
357 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1875  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.36 
 
 
331 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.398277  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.79 
 
 
330 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1277  LacI family transcription regulator  29.97 
 
 
344 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0780915  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  30.37 
 
 
343 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.1 
 
 
341 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  31.01 
 
 
332 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  30.81 
 
 
341 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.81 
 
 
341 aa  137  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  30.81 
 
 
341 aa  137  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.81 
 
 
341 aa  137  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.81 
 
 
341 aa  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.81 
 
 
341 aa  137  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  29.12 
 
 
328 aa  137  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  30.81 
 
 
341 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.81 
 
 
341 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  32.17 
 
 
341 aa  136  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1870  LacI family transcription regulator  29.91 
 
 
342 aa  136  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  29.03 
 
 
338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.57 
 
 
335 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.57 
 
 
337 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.849116  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.97 
 
 
341 aa  135  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  29.29 
 
 
337 aa  135  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1540  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.43 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000065632  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  29.71 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1789  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.72 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0286691 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.31 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  28.41 
 
 
362 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1744  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.43 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000285436  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  32.27 
 
 
343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1913  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.14 
 
 
341 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000592501  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6650  transcriptional regulator, LacI family  32.38 
 
 
364 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1526  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.14 
 
 
341 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580264  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1563  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.14 
 
 
341 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00208837  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  28.99 
 
 
337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  29.79 
 
 
335 aa  133  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.97 
 
 
341 aa  133  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  31.18 
 
 
339 aa  132  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  29.01 
 
 
337 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2196  LacI family transcription regulator  28.03 
 
 
340 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0908748  hitchhiker  0.000488625 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  31.14 
 
 
344 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  30.37 
 
 
347 aa  132  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  29.94 
 
 
340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  27.49 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  30.03 
 
 
342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.68 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  28.41 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  30.9 
 
 
336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.15 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>