More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1087 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1087  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 339 aa  694    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.42902  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1323  transcription regulator of beta-galactosidase gene  57.31 
 
 		 333 aa  391  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1949  LacR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.721622  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1063  LacI family transcription regulator  38.19 
 
 		 337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2079  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0539  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0302  LacI family transcription regulator  31.74 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.323775  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1372  galactose operon repressor  31.18 
 
 		 331 aa  162  9e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1547  LacI family transcription regulator  29.81 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0111532  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002659  beta-D-galactosidase transcriptional repressor  30.65 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.443693  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03334  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  31.63 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1972  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  33.23 
 
 		 326 aa  149  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0103522 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1340  LacI family transcription regulator  29.49 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000460933  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0714  transcriptional regulator, LacI family  29.65 
 
 		 334 aa  139  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0741  transcriptional regulator, LacI family  28.29 
 
 		 343 aa  135  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1775  LacI family transcription regulator  25.9 
 
 		 330 aa  135  8e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3369  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  28.39 
 
 		 327 aa  135  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02944  DNA-binding transcriptional repressor  28.3 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0626  transcriptional regulator, LacI family  28.3 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0625  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  28.62 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02894  hypothetical protein  28.3 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0793  transcriptional regulator, LacI family  29.57 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.137474  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3257  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  28.62 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3542  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  28.3 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4389  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  27.99 
 
 		 327 aa  132  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4137  regulatory protein LacI  29.77 
 
 		 359 aa  129  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0909  LacI family transcription regulator  28.95 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000295634  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0977  transcriptional regulator, LacI family  26.89 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0881  LacI family transcription regulator  28.28 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000659595  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  27.83 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  28.88 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  27.79 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0568  LacI family transcription regulator  25.37 
 
 		 339 aa  99.8  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000865309  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  27.64 
 
 		 337 aa  99.8  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  25.71 
 
 		 341 aa  99.8  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  25.58 
 
 		 339 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  26.55 
 
 		 374 aa  96.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  27.41 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2808  LacI family transcription regulator  26.36 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0294888  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  24.2 
 
 		 331 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  23.91 
 
 		 326 aa  94.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1454  LacI family transcription regulator  22.97 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0012728  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  25.28 
 
 		 336 aa  93.6  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0210  LacI family transcription regulator  26.94 
 
 		 353 aa  93.2  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000188149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  25.14 
 
 		 336 aa  92.8  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0629  LacI family transcription regulator  23.92 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.409769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  25.21 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4438  transcriptional regulator, LacI family  26.91 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  25.73 
 
 		 341 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  28.24 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.86 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  26.5 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  26.04 
 
 		 337 aa  90.5  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  25.36 
 
 		 333 aa  90.1  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  23.82 
 
 		 328 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  26.69 
 
 		 362 aa  89.4  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5075  transcriptional regulator, LacI family  24.54 
 
 		 350 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0329  LacI family transcription regulator  24.86 
 
 		 347 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16025  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5410  LacI family transcription regulator  26.27 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  25.29 
 
 		 355 aa  87.8  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  28.15 
 
 		 349 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  24.78 
 
 		 339 aa  87  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11680  transcriptional regulator  23.62 
 
 		 336 aa  86.3  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  24.77 
 
 		 339 aa  86.3  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  25.42 
 
 		 334 aa  86.3  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  25 
 
 		 333 aa  86.3  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  25.86 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0150  transcriptional regulator, LacI family  25.65 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.93 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.945809  hitchhiker  0.0011577 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4373  regulatory protein LacI  25.93 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20530  transcriptional regulator, LacI family  23.5 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.96 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3799  transcriptional regulator, LacI family  27.7 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  28.22 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1440  maltose operon repressor MalR, putative  24.54 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0132709  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  23.92 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0777  transcriptional regulator, LacI family  26.52 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000623929 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002664  LacI-family regulatory protein  25.21 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0397  LacI family transcription regulator  26.53 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1087  transcriptional regulator, LacI family  24.76 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  23.32 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  25.22 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2790  LacI family transcription regulator  26.36 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  24.38 
 
 		 332 aa  82.4  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  29.51 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2877  transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  24.57 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  25.23 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  22.95 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6650  transcriptional regulator, LacI family  25.55 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  24.64 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  26.01 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1623  transcriptional regulator, LacI family  27.43 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1769  LacI family transcription regulator  25.14 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5756  transcriptional regulator, LacI family  25.56 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  24.64 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  24.71 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  23.03 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  25.97 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  26.35 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>