More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0150 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0150  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 336 aa  692    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  28.83 
 
 		 348 aa  139  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  28.07 
 
 		 340 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.7 
 
 		 341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.7 
 
 		 341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.7 
 
 		 341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  31.2 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1559  alanine racemase  29.57 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000066632  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  27.78 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  28.61 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  29.74 
 
 		 338 aa  123  5e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.84 
 
 		 333 aa  122  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4373  regulatory protein LacI  29.91 
 
 		 354 aa  122  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  30.84 
 
 		 333 aa  122  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  29.87 
 
 		 352 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  30.38 
 
 		 340 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.51 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  27.27 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4307  transcriptional regulator, LacI family  28.21 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.19442  normal  0.853045 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1540  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.11 
 
 		 341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000065632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2505  LacI family transcription regulator  28.41 
 
 		 342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1744  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.11 
 
 		 341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000285436  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0892  LacI family transcription regulator  27.81 
 
 		 346 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00803151  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  28.26 
 
 		 336 aa  119  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1526  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.11 
 
 		 341 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1563  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.11 
 
 		 341 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00208837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1913  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.11 
 
 		 341 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000592501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3000  transcriptional regulator, LacI family  27.13 
 
 		 346 aa  119  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114429  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  26.73 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  26.73 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2210  transcriptional regulator, LacI family  27.35 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  27.22 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  27.22 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  27.22 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.22 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.22 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.22 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.22 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.22 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.22 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  27.81 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  31.08 
 
 		 343 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  26.79 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  28.74 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2556  transcriptional regulator, LacI family  26.38 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000904675  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  27.43 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  27.89 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  27.25 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  26.73 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1789  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.65 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0286691 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  26.87 
 
 		 334 aa  113  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  26.54 
 
 		 335 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.07 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  25.66 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0352  transcriptional regulator, LacI family  27.51 
 
 		 339 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  26.38 
 
 		 334 aa  110  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  28.53 
 
 		 332 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  28.26 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  28.21 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2894  transcriptional regulator, LacI family  30.29 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0177  transcriptional regulator, LacI family  27.75 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0763  regulatory protein, LacI  26.59 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  29.78 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  26.39 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  28.78 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  26.04 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1601  alanine racemase  26.98 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.520299  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1547  LacI family transcription regulator  28.12 
 
 		 337 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0111532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  28.32 
 
 		 368 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1340  LacI family transcription regulator  27.84 
 
 		 337 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000460933  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  29.97 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  29.71 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2238  transcriptional regulator, LacI family  29.3 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1062  DNA-binding transcriptional regulator GalS  26.97 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  27.09 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0819  transcriptional regulator, LacI family  29.97 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  27.14 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.19 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0941  alanine racemase  27.79 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00393533  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.84 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  30.62 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3252  transcriptional regulator, LacI family  27.17 
 
 		 351 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2999  transcriptional regulator, LacI family  24.2 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  29.81 
 
 		 351 aa  102  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.34 
 
 		 332 aa  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4844  transcriptional regulator, LacI family  26.71 
 
 		 344 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0280353  hitchhiker  0.000467686 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01670  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 348 aa  102  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1962  transcriptional regulator, LacI family  27.89 
 
 		 352 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4598  transcriptional regulator, LacI family  27.6 
 
 		 367 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  29.09 
 
 		 336 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1078  transcriptional regulator, LacI family  27.81 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3324  LacI family transcription regulator  30.77 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370251  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3331  regulatory protein LacI  27.81 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  27.48 
 
 		 346 aa  100  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  28.75 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  29.11 
 
 		 332 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0748  transcriptional regulator, LacI family  34.36 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1014  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.68 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  30.29 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  29.65 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>