More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0010 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  100 
 
 
146 aa  295  1e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000437004  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  73.68 
 
 
98 aa  151  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  63.16 
 
 
95 aa  135  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  60 
 
 
96 aa  133  7.000000000000001e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0007  30S ribosomal protein S6  61.96 
 
 
98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  58.33 
 
 
97 aa  124  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  54.35 
 
 
98 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  55.43 
 
 
95 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  51.02 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  51.02 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  55.43 
 
 
95 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  52.17 
 
 
96 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  52.17 
 
 
96 aa  107  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  52.17 
 
 
96 aa  107  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  52.17 
 
 
96 aa  107  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  51.09 
 
 
96 aa  105  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  51.09 
 
 
96 aa  105  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  51.09 
 
 
96 aa  105  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  51.09 
 
 
96 aa  105  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  51.09 
 
 
96 aa  105  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  51.09 
 
 
96 aa  105  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  51.09 
 
 
95 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  45.92 
 
 
98 aa  104  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  41.3 
 
 
95 aa  90.1  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 
98 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  42.39 
 
 
95 aa  84.7  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 
95 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  37.89 
 
 
94 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  36.17 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  36.96 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 
95 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  33.68 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  32.79 
 
 
117 aa  74.7  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 
95 aa  74.3  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  35.87 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  35.42 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  33.7 
 
 
96 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  30.09 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  33.7 
 
 
97 aa  67.4  0.00000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  34.78 
 
 
97 aa  67  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  31.4 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  31.4 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  26.36 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0024  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  36.73 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  26.67 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0420  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000077892  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  35.23 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  28.91 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  27.21 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 
153 aa  62.8  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  27.27 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  27.27 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  32.2 
 
 
112 aa  62.8  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  27.91 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  33.7 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  33.68 
 
 
155 aa  62  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  27.91 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  32.61 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 
125 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 
117 aa  61.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  28.36 
 
 
122 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  26.67 
 
 
126 aa  61.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0428  30S ribosomal protein S6  26.87 
 
 
124 aa  60.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.531029 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 
156 aa  60.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  29.47 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0645  30S ribosomal protein S6  31.93 
 
 
160 aa  60.8  0.000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.501453  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  32.63 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 
148 aa  60.8  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  24.09 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  31.87 
 
 
96 aa  60.5  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3482  30S ribosomal protein S6  31.63 
 
 
113 aa  60.1  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676473  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  29.35 
 
 
98 aa  60.1  0.000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  25.74 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  37.5 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  31.68 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2569  30S ribosomal protein S6  25.74 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  31.68 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>