106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0070 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  516  1e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  88.33 
 
 
257 aa  432  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  76.47 
 
 
265 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  76.71 
 
 
261 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  75.1 
 
 
265 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  75.29 
 
 
264 aa  362  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  73.52 
 
 
261 aa  358  5e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  66.25 
 
 
258 aa  288  5e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  59.3 
 
 
255 aa  285  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  55.02 
 
 
259 aa  275  7e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  55.42 
 
 
263 aa  272  4e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  56.2 
 
 
647 aa  271  7e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  55.64 
 
 
277 aa  265  6e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  51.81 
 
 
259 aa  265  6e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  55.95 
 
 
257 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  55.73 
 
 
274 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  55.56 
 
 
272 aa  254  1e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  58.09 
 
 
271 aa  253  2e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  58.09 
 
 
283 aa  253  2e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  52.31 
 
 
272 aa  252  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  52.57 
 
 
269 aa  249  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  54 
 
 
252 aa  247  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  52.11 
 
 
264 aa  243  2e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  51.79 
 
 
290 aa  239  5e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  56.28 
 
 
252 aa  238  7e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  57.02 
 
 
265 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  49.8 
 
 
249 aa  218  8e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  48.33 
 
 
254 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  46.59 
 
 
249 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  48.33 
 
 
248 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  48.95 
 
 
248 aa  204  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  44.62 
 
 
247 aa  203  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  46.55 
 
 
256 aa  200  2e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  51.09 
 
 
252 aa  200  2e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  38.08 
 
 
253 aa  179  4e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  43.1 
 
 
251 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  38.43 
 
 
257 aa  176  4e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  41.96 
 
 
254 aa  176  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  35.95 
 
 
260 aa  174  1e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  42.24 
 
 
248 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  35.2 
 
 
279 aa  156  3e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  44.92 
 
 
244 aa  155  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  32.41 
 
 
276 aa  86.3  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  1.40392e-07  hitchhiker  9.02529e-10 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  32.41 
 
 
276 aa  86.3  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.67 
 
 
259 aa  57  3e-07  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  25.77 
 
 
259 aa  55.5  8e-07  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  25.87 
 
 
274 aa  53.9  2e-06  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.87 
 
 
261 aa  52.4  7e-06  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  29.23 
 
 
410 aa  52  9e-06  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.34 
 
 
370 aa  52  9e-06  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  24.23 
 
 
258 aa  52  9e-06  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  25.96 
 
 
258 aa  52  1e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  27.61 
 
 
260 aa  50.8  2e-05  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  3.26151e-06  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  21.7 
 
 
257 aa  51.2  2e-05  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.42 
 
 
368 aa  50.8  2e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  38.46 
 
 
218 aa  50.1  4e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  26.45 
 
 
239 aa  49.7  4e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2205  hypothetical protein  24.88 
 
 
260 aa  49.3  6e-05  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00108131  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.27 
 
 
370 aa  48.9  7e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.41 
 
 
248 aa  48.9  8e-05  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  23.87 
 
 
254 aa  48.5  9e-05  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.34 
 
 
370 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.75 
 
 
368 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.75 
 
 
368 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  26.71 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  28.79 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  3.37661e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.28 
 
 
371 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  25.38 
 
 
255 aa  46.6  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  36.73 
 
 
275 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  36.26 
 
 
260 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0776  protein of unknown function UPF0227  27.62 
 
 
213 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.18 
 
 
370 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  36.05 
 
 
294 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.28 
 
 
371 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
258 aa  46.2  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.28 
 
 
371 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1379  protein of unknown function UPF0227  27.97 
 
 
214 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  27.85 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.87 
 
 
371 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  24.32 
 
 
408 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  28.64 
 
 
246 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.34 
 
 
370 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  27.32 
 
 
397 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 
360 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.06 
 
 
370 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  23.46 
 
 
287 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02872e-13 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  35.06 
 
 
415 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  1.34708e-05  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  35.29 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  36.76 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1573  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
281 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  39.68 
 
 
413 aa  43.5  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  35.82 
 
 
402 aa  43.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  37.68 
 
 
674 aa  43.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  38.82 
 
 
362 aa  42.7  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1087  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.78 
 
 
389 aa  42.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.607916  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 
283 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>