231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1662 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1662  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 
146 aa  296  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.503488  normal  0.167313 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2285  anti-sigma F factor  56.2 
 
 
141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0477  anti-sigma F factor  54.29 
 
 
157 aa  161  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.899963  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2251  anti-sigma F factor  57.55 
 
 
146 aa  161  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2021  anti-sigma F factor  55.4 
 
 
140 aa  160  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2306  anti-sigma F factor  54.68 
 
 
140 aa  159  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0119  anti-sigma F factor  54.74 
 
 
149 aa  159  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0373  anti-sigma F factor  55.32 
 
 
146 aa  158  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2772  anti-sigma F factor  57.45 
 
 
146 aa  158  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1745  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  51.8 
 
 
153 aa  158  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4143  anti-sigma F factor  55.4 
 
 
146 aa  156  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3984  anti-sigma F factor  55.4 
 
 
146 aa  156  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3814  anti-sigma F factor  55.4 
 
 
146 aa  156  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3830  anti-sigma F factor  55.4 
 
 
146 aa  156  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4206  anti-sigma F factor  55.4 
 
 
146 aa  156  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000134887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4295  anti-sigma F factor  55.4 
 
 
146 aa  156  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3904  anti-sigma F factor  55.4 
 
 
146 aa  156  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4095  anti-sigma F factor  55.4 
 
 
146 aa  156  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69426e-22 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1055  anti-sigma F factor  55.4 
 
 
146 aa  155  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0411626 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4183  anti-sigma F factor  55.4 
 
 
146 aa  155  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0790038  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1558  anti-sigma F factor  56.2 
 
 
143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1681  anti-sigma F factor  55.3 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0862  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.36 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1497  anti-sigma F factor  42.54 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07010  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.36 
 
 
143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0614  anti-sigma F factor  37.96 
 
 
148 aa  107  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1225  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.68 
 
 
148 aa  103  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00856956  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1104  anti-sigma F factor  38.52 
 
 
148 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.860331  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3441  anti-sigma F factor  36.23 
 
 
145 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2065  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.72 
 
 
146 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202652  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  29.63 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  29.63 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  29.63 
 
 
160 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  29.63 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  28.89 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  28.89 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  28.89 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  29.58 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  29.63 
 
 
160 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  28.89 
 
 
160 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  29.41 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1678  serine-protein kinase RsbW  31.72 
 
 
159 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2139  serine-protein kinase RsbW  30.56 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2102  serine-protein kinase RsbW  30.56 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178488  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0664  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.29 
 
 
543 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4563  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.54 
 
 
286 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3738  Na+/proline symporter-like protein  32.26 
 
 
950 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3034  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.57 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000275353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4099  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256347  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2102  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.98 
 
 
143 aa  52.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3337  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.13 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 
250 aa  52  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0731  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.993652  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.62 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.477606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4100  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.28 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39959  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3187  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.98 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00310168  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 
269 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2515  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.19 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538602  normal  0.204677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0315  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.39 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3162  sensor histidine kinase  32.99 
 
 
453 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2553  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.81 
 
 
324 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2248  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
936 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.237382  normal  0.945372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3290  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.55 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.018648  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1486  histidine kinase  33.68 
 
 
473 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5807  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 
990 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3015  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.03 
 
 
762 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 
588 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0474386 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 
589 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5111  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 
589 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0179  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.07 
 
 
142 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
536 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000503711  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5588  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
773 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0334  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
453 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6671  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.67 
 
 
357 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.314942  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2525  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
449 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
494 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3787  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
560 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  33.33 
 
 
1187 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.36 
 
 
154 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
602 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 
408 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0508  histidine kinase  29.6 
 
 
632 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
781 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3013  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
453 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4239  hypothetical protein  44.83 
 
 
335 aa  45.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477161  unclonable  0.000000000051793 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4780  histidine kinase  36.11 
 
 
742 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1360  cellulose binding, type IV  31.58 
 
 
544 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
589 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
594 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
589 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0915  histidine kinase  35.82 
 
 
176 aa  44.7  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.932987  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
553 aa  44.3  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1337  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
453 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.154373  hitchhiker  0.00314731 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1402  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
453 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0512  histidine kinase  31.71 
 
 
489 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2838  putative anti-sigma regulatory factor serine/threonine protein kinase  28.43 
 
 
147 aa  44.3  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2939  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
360 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.924574  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1673  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.36 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.11126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3002  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 
1234 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>