More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1972 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
415 aa  835    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  58.67 
 
 
413 aa  425  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  50.61 
 
 
417 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  51.76 
 
 
411 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 
425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  35.59 
 
 
439 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  37.22 
 
 
417 aa  206  9e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  36.18 
 
 
409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  36.39 
 
 
409 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 
398 aa  176  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
396 aa  167  4e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.15 
 
 
401 aa  163  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  29 
 
 
378 aa  160  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 
394 aa  155  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  33.97 
 
 
388 aa  150  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 
401 aa  143  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2071  glycosyl transferase, group 1  34.02 
 
 
391 aa  140  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
394 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 
386 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 
386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
395 aa  130  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
421 aa  130  6e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
409 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 
410 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
381 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
455 aa  116  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  31.19 
 
 
452 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 
404 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
360 aa  113  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 
390 aa  114  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  35.19 
 
 
371 aa  110  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 
377 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 
391 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
388 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 
403 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  29.18 
 
 
382 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  29.97 
 
 
650 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 
386 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
387 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 
381 aa  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 
440 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
396 aa  107  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  31.16 
 
 
383 aa  106  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  37.14 
 
 
770 aa  106  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.37 
 
 
419 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 
384 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  36.41 
 
 
439 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 
439 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  33.65 
 
 
388 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 
439 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 
411 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 
439 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
408 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
419 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  31.84 
 
 
466 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
378 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
388 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
388 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
388 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
414 aa  103  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
388 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
388 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
396 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
389 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
395 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 
398 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  31.7 
 
 
406 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  33.02 
 
 
377 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  34.34 
 
 
388 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
419 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 
384 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
399 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
402 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1166  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 
370 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.27899 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0307  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
396 aa  100  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.813373  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 
422 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0957  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
397 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.599861  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0579  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
398 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  32.94 
 
 
412 aa  100  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  38.19 
 
 
370 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
365 aa  100  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 
360 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 
412 aa  100  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
404 aa  100  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 
422 aa  100  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  35.1 
 
 
401 aa  99.8  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
378 aa  99.8  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.98 
 
 
382 aa  99  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 
371 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.74 
 
 
427 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
378 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  34.74 
 
 
430 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1964  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
388 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
435 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  33.58 
 
 
421 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  28.06 
 
 
358 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 
389 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
375 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
402 aa  97.1  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>