More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1062 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  82.91 
 
 		 784 aa  1283    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 783 aa  1576    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 		 796 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  35.34 
 
 		 602 aa  257  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.94 
 
 		 610 aa  249  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  40.59 
 
 		 531 aa  249  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  33.56 
 
 		 632 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  36.05 
 
 		 632 aa  246  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  36.97 
 
 		 1275 aa  244  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 		 1486 aa  243  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  34.42 
 
 		 586 aa  238  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  33.03 
 
 		 731 aa  237  6e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  37.99 
 
 		 717 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  38.32 
 
 		 717 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  42.41 
 
 		 808 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  38.62 
 
 		 710 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  34.3 
 
 		 1509 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  37.58 
 
 		 723 aa  231  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  34.87 
 
 		 733 aa  230  7e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  38.3 
 
 		 728 aa  229  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 		 958 aa  226  9e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  40.53 
 
 		 526 aa  226  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 		 658 aa  224  6e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.92 
 
 		 809 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  33.72 
 
 		 765 aa  221  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  33.92 
 
 		 1359 aa  219  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  40.2 
 
 		 625 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  40.2 
 
 		 625 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 880 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  32.3 
 
 		 832 aa  218  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 		 1759 aa  218  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 		 653 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  37.8 
 
 		 551 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  34.55 
 
 		 652 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.82 
 
 		 1561 aa  214  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  38.06 
 
 		 635 aa  213  9e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  36.55 
 
 		 775 aa  213  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 		 709 aa  213  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 		 709 aa  213  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 		 746 aa  211  3e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  37.21 
 
 		 721 aa  211  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  43.4 
 
 		 625 aa  210  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  40.45 
 
 		 576 aa  209  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 		 555 aa  207  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  35.56 
 
 		 1334 aa  208  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  37.01 
 
 		 551 aa  207  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  38.94 
 
 		 539 aa  207  8e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 684 aa  206  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  41.22 
 
 		 670 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  44.15 
 
 		 662 aa  205  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  29.89 
 
 		 1152 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  29.89 
 
 		 1152 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 		 790 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  32.01 
 
 		 617 aa  197  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  30.55 
 
 		 810 aa  196  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 		 1067 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  33.25 
 
 		 958 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 		 1991 aa  191  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 		 729 aa  189  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  33.46 
 
 		 684 aa  188  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  30.66 
 
 		 857 aa  177  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  31.98 
 
 		 1182 aa  176  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 		 988 aa  171  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 		 556 aa  169  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 		 794 aa  168  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  31.64 
 
 		 748 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 		 996 aa  158  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 		 1193 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 		 1213 aa  152  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 		 734 aa  151  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  30.27 
 
 		 983 aa  150  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 		 1188 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 		 742 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 		 1198 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 		 1084 aa  145  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.45 
 
 		 1191 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  38.15 
 
 		 1003 aa  142  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 		 1177 aa  142  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3633  glycosyl transferase, group 1  39.2 
 
 		 510 aa  141  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.015452  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  31.55 
 
 		 742 aa  140  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 		 974 aa  138  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0638  glycosyltransferase  36.36 
 
 		 972 aa  138  4e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.770569  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  36.6 
 
 		 725 aa  138  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  31.24 
 
 		 742 aa  137  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  26.16 
 
 		 1644 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  26.16 
 
 		 1644 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 		 1297 aa  135  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.99 
 
 		 968 aa  134  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 		 968 aa  134  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 		 1190 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  36.23 
 
 		 725 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  28.83 
 
 		 1694 aa  132  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  35.64 
 
 		 732 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0194  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  31.97 
 
 		 1030 aa  131  6e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.478179  normal  0.202033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 		 1386 aa  130  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  32.15 
 
 		 1162 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1974  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 		 853 aa  128  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  28.76 
 
 		 1171 aa  126  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  25.4 
 
 		 2046 aa  124  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.66 
 
 		 1173 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>