166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0613 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  79.86 
 
 		 456 aa  637    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  100 
 
 		 419 aa  852    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  71.64 
 
 		 422 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  70.53 
 
 		 422 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  70.42 
 
 		 414 aa  544  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  67.89 
 
 		 415 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  63.92 
 
 		 413 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  53.83 
 
 		 422 aa  388  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  50.96 
 
 		 420 aa  365  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  46.21 
 
 		 422 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  44.44 
 
 		 409 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  44.3 
 
 		 423 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  44.76 
 
 		 412 aa  260  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  41.18 
 
 		 420 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  40.92 
 
 		 463 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  42 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  40.62 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  39.29 
 
 		 424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  40.49 
 
 		 425 aa  222  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  37.25 
 
 		 419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  34.02 
 
 		 480 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  32.47 
 
 		 474 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  33.74 
 
 		 476 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  32.28 
 
 		 469 aa  156  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  32.4 
 
 		 485 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  34.55 
 
 		 504 aa  151  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  33.02 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  33.83 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  31.59 
 
 		 445 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  27.4 
 
 		 495 aa  136  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  27.17 
 
 		 495 aa  136  8e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  38.14 
 
 		 439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  33.8 
 
 		 442 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  30.09 
 
 		 479 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  29.44 
 
 		 466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  26.83 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  32.35 
 
 		 442 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  33.94 
 
 		 450 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  33.66 
 
 		 476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  28.2 
 
 		 463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  32.71 
 
 		 427 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  34.05 
 
 		 458 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  33.15 
 
 		 438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  28 
 
 		 450 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  27.27 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  31.47 
 
 		 457 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  32.34 
 
 		 434 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  29.63 
 
 		 470 aa  106  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  28.15 
 
 		 433 aa  106  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  27.73 
 
 		 463 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  25.18 
 
 		 422 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  26.64 
 
 		 536 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  28.85 
 
 		 418 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  26.65 
 
 		 418 aa  97.1  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  27.07 
 
 		 481 aa  97.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  28.7 
 
 		 468 aa  96.3  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  29.6 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  29.51 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  29.19 
 
 		 429 aa  83.2  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  26.26 
 
 		 628 aa  80.5  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  28.33 
 
 		 1274 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  28.03 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  27.25 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  26.74 
 
 		 1199 aa  76.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  31.15 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  26.74 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  27.08 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  25.24 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  24.22 
 
 		 494 aa  67  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  22.81 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  26.86 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  26.86 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46399  predicted protein  26.17 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  25.79 
 
 		 543 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  26.05 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  27.16 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44106  predicted protein  27.53 
 
 		 577 aa  59.7  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.287897  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  41.86 
 
 		 465 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  44.44 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  44.12 
 
 		 657 aa  56.6  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  22.08 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28515  corticosteroid- binding protein  24.35 
 
 		 477 aa  55.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  26.5 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  22.2 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  22.2 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  24.47 
 
 		 456 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  24.36 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  24.5 
 
 		 427 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  24.44 
 
 		 999 aa  54.3  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  23.92 
 
 		 492 aa  53.9  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  23.58 
 
 		 492 aa  53.5  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  51.79 
 
 		 462 aa  53.5  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  47.37 
 
 		 367 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  48.28 
 
 		 463 aa  53.1  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  27.65 
 
 		 487 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  26.65 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  51.79 
 
 		 463 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  29.55 
 
 		 510 aa  51.6  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  42.25 
 
 		 492 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  47.37 
 
 		 454 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>