More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0067 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 
325 aa  653  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0059  peptidase S49, SppA  86.46 
 
 
327 aa  572  1e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0430254  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0102  S49 family peptidase  76.69 
 
 
326 aa  516  1e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0396  signal peptide peptidase SppA, 36K type  77.54 
 
 
325 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0639  signal peptide peptidase SppA, 36K type  76.54 
 
 
321 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0663368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0068  signal peptide peptidase SppA, 36K type  75.23 
 
 
326 aa  451  1e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0824847  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0193  signal peptide peptidase SppA, 36K type  76 
 
 
326 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116765  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2220  signal peptide peptidase SppA, 36K type  54.66 
 
 
323 aa  325  6e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2929  signal peptide peptidase SppA, 36K type  52.19 
 
 
324 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359605  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2445  signal peptide peptidase SppA, 36K type  52.36 
 
 
320 aa  288  8e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0143  signal peptide peptidase SppA, 36K type  50.93 
 
 
324 aa  282  4e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  51.99 
 
 
321 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0122  signal peptide peptidase SppA, 36K type  52.48 
 
 
321 aa  276  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  51.31 
 
 
321 aa  275  9e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  56.91 
 
 
322 aa  272  6e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0219029  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  50.31 
 
 
321 aa  271  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.04 
 
 
323 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0020  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.38 
 
 
319 aa  241  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184229 
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  43.38 
 
 
331 aa  234  1e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  43.38 
 
 
331 aa  234  1e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  43.75 
 
 
322 aa  232  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.67 
 
 
314 aa  229  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0060  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.74 
 
 
316 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0044  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.99 
 
 
316 aa  221  1e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316268  normal  0.230689 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.11 
 
 
313 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216895  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0618  signal peptide peptidase A  36.15 
 
 
288 aa  169  7e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0401  signal peptide peptidase SppA  33.08 
 
 
288 aa  161  1e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0409  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.06 
 
 
308 aa  159  5e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.927346  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.74 
 
 
299 aa  148  1e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.84 
 
 
296 aa  131  2e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  40.11 
 
 
316 aa  131  2e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.11 
 
 
382 aa  131  2e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.11 
 
 
382 aa  131  2e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.71 
 
 
371 aa  130  4e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  41.11 
 
 
269 aa  129  5e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  36.17 
 
 
303 aa  129  5e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  40.56 
 
 
269 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  38.1 
 
 
269 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.47 
 
 
383 aa  129  7e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.66 
 
 
335 aa  129  8e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.22 
 
 
296 aa  128  1e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.89 
 
 
296 aa  127  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  2.44919e-05  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.24 
 
 
366 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  37.76 
 
 
269 aa  126  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  37.76 
 
 
269 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  38.14 
 
 
269 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  35.78 
 
 
269 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  33.61 
 
 
280 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  38.71 
 
 
297 aa  122  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.55 
 
 
595 aa  122  7e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.38 
 
 
298 aa  121  2e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.71573e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  36.32 
 
 
273 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.69 
 
 
336 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.27 
 
 
274 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  34.52 
 
 
270 aa  119  6e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.89 
 
 
270 aa  118  1e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  1.08216e-08 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2494  signal peptide peptidase A  35.82 
 
 
272 aa  118  1e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641741  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.24 
 
 
313 aa  118  1e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  4.48923e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 
274 aa  118  1e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  36.11 
 
 
273 aa  118  1e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0228  protease IV  35.05 
 
 
297 aa  118  2e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.38 
 
 
272 aa  117  2e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.38 
 
 
272 aa  118  2e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  36.36 
 
 
270 aa  117  2e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.06 
 
 
297 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.63 
 
 
348 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.45 
 
 
626 aa  116  4e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.18 
 
 
311 aa  116  5e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.5 
 
 
290 aa  115  1e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.89 
 
 
323 aa  115  1e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0288  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.72 
 
 
286 aa  114  2e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.39 
 
 
295 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.65 
 
 
299 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  2.6819e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2255  signal peptide peptidase SppA  34.5 
 
 
273 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.221521  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2009  peptidase S49  29.77 
 
 
320 aa  113  4e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.44 
 
 
339 aa  113  4e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  33.5 
 
 
301 aa  112  1e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.47 
 
 
342 aa  111  2e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.33 
 
 
605 aa  111  2e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.65 
 
 
335 aa  111  2e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1739  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.88 
 
 
319 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  8.70898e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.35 
 
 
260 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.28 
 
 
617 aa  110  4e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  4.37439e-05  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.42 
 
 
327 aa  110  4e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  2.1867e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.14 
 
 
625 aa  109  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  33.17 
 
 
270 aa  110  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.79 
 
 
615 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  9.44101e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  36.69 
 
 
612 aa  109  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  3.17657e-06  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.79 
 
 
615 aa  109  8e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  8.73335e-11 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.25 
 
 
290 aa  108  8e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  9.86804e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.79 
 
 
615 aa  108  9e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.00228e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.79 
 
 
615 aa  108  9e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  7.5558e-06  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2034  peptidase S49  30.89 
 
 
262 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.12066  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.74 
 
 
357 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.37 
 
 
338 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.58 
 
 
611 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.72 
 
 
605 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  8.52075e-06 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.72 
 
 
605 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  36.09 
 
 
340 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0373  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.6 
 
 
287 aa  107  4e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0119133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>