More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2034 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2034  peptidase S49  100 
 
 		 262 aa  530  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.12066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0102  S49 family peptidase  31.22 
 
 		 326 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.89 
 
 		 325 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0059  peptidase S49, SppA  30.37 
 
 		 327 aa  107  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0430254  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0396  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.41 
 
 		 325 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2929  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.66 
 
 		 324 aa  106  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  32.43 
 
 		 322 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0618  signal peptide peptidase A  26.72 
 
 		 288 aa  105  9e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.33 
 
 		 371 aa  104  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1739  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.14 
 
 		 319 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000870898  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0193  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.64 
 
 		 326 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0639  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.64 
 
 		 321 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0663368 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  30.77 
 
 		 320 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  28.95 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0401  signal peptide peptidase SppA  28.3 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2220  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.09 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.73 
 
 		 335 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.99 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.51 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0219029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  29.11 
 
 		 297 aa  99.8  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.94 
 
 		 382 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.94 
 
 		 382 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.07 
 
 		 321 aa  99  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0122  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.07 
 
 		 321 aa  99  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0143  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.37 
 
 		 324 aa  98.2  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.35 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0068  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.19 
 
 		 326 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0824847  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4371  peptidase S49  32.74 
 
 		 287 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2445  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.67 
 
 		 320 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.29 
 
 		 339 aa  94  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.19 
 
 		 366 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0020  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.49 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  28.57 
 
 		 361 aa  93.6  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30 
 
 		 342 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  28.11 
 
 		 269 aa  92.8  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.41 
 
 		 297 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  26.61 
 
 		 270 aa  92.4  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.52 
 
 		 298 aa  92  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.82 
 
 		 323 aa  92  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.5 
 
 		 313 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  27.57 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.22 
 
 		 296 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0044  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.38 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316268  normal  0.230689 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.76 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.76 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.27 
 
 		 324 aa  90.9  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  27.57 
 
 		 269 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.24 
 
 		 348 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  28.81 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0060  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.38 
 
 		 316 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.77 
 
 		 290 aa  89.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.57 
 
 		 274 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  27.4 
 
 		 301 aa  88.6  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2523  peptidase S49  31.19 
 
 		 265 aa  89  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.01 
 
 		 321 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2757  peptidase S49  30.93 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  27.88 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  25.82 
 
 		 273 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.13 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.22 
 
 		 290 aa  88.2  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.51 
 
 		 321 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  27.19 
 
 		 360 aa  88.2  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  27.88 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1937  signal peptide peptidase A  27.23 
 
 		 410 aa  86.7  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.003866  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2796  peptidase, U7 family protein  28.08 
 
 		 333 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0383302  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2486  peptidase, U7 family protein  28.22 
 
 		 333 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00952675  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2798  peptidase, U7 family protein  28.22 
 
 		 333 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0524  peptidase, U7 family protein  28.22 
 
 		 333 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2915  peptidase  28.22 
 
 		 333 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0641289  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2859  peptidase, U7 family protein  28.22 
 
 		 333 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  27.44 
 
 		 288 aa  86.3  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1809  peptidase, U7 family protein  28.22 
 
 		 333 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  25.84 
 
 		 270 aa  85.9  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2436  peptidase S49  29.5 
 
 		 387 aa  85.9  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1962  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.32 
 
 		 329 aa  85.9  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  26.56 
 
 		 270 aa  85.5  8e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.41 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  28.28 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  25.79 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2271  peptidase S49  29.5 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0588  peptidase S49  26.54 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0721247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.32 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0392  peptidase S49  27.54 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.09 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  28.5 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.86 
 
 		 626 aa  83.2  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  27.03 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  27.03 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2494  signal peptide peptidase A  25.12 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3297  peptidase S49  30.14 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.49449 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.48 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  28.57 
 
 		 316 aa  82  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  26.85 
 
 		 290 aa  82  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1565  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.99 
 
 		 350 aa  82  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0230449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0399  peptidase S49  27.05 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.673483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3424  peptidase S49  29.46 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  25.95 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  28.18 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  26.24 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>