More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4372 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4372  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 501 aa  984    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  65.99 
 
 		 477 aa  595  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  53.07 
 
 		 440 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  49.8 
 
 		 435 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  52.24 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6131  glutamyl-tRNA reductase  50.4 
 
 		 476 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0485  glutamyl-tRNA reductase  50.41 
 
 		 473 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.472188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  49.5 
 
 		 440 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  45.79 
 
 		 443 aa  365  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  45.33 
 
 		 445 aa  358  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  45.04 
 
 		 458 aa  351  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  43.67 
 
 		 455 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  43.58 
 
 		 457 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  43.15 
 
 		 468 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0238  glutamyl-tRNA reductase  42.74 
 
 		 473 aa  336  5e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.264008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  43.47 
 
 		 456 aa  333  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  43.47 
 
 		 447 aa  332  9e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  43.47 
 
 		 447 aa  332  9e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  43.47 
 
 		 447 aa  332  9e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  47.06 
 
 		 430 aa  329  7e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  44.26 
 
 		 438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  47.19 
 
 		 442 aa  327  4.0000000000000003e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  44.02 
 
 		 455 aa  325  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  43.33 
 
 		 455 aa  318  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  42.12 
 
 		 448 aa  313  5.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  42.77 
 
 		 456 aa  305  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  35.49 
 
 		 446 aa  251  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  31.24 
 
 		 464 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  30.96 
 
 		 464 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  31.2 
 
 		 444 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  31.17 
 
 		 444 aa  237  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  30.99 
 
 		 444 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  30.99 
 
 		 444 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  30.99 
 
 		 444 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  30.99 
 
 		 444 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  30.99 
 
 		 444 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  30.99 
 
 		 444 aa  236  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  35.01 
 
 		 441 aa  232  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  30.58 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  30.58 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  32.59 
 
 		 434 aa  230  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  32.99 
 
 		 443 aa  230  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  31.8 
 
 		 454 aa  229  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  30.96 
 
 		 443 aa  229  7e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  32.51 
 
 		 443 aa  226  8e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  30.29 
 
 		 458 aa  223  6e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  35.05 
 
 		 436 aa  223  6e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  29.92 
 
 		 443 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  32.29 
 
 		 436 aa  220  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  28.81 
 
 		 441 aa  219  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  32.08 
 
 		 434 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  30.72 
 
 		 434 aa  217  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  33.4 
 
 		 465 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  30.77 
 
 		 434 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  30.77 
 
 		 434 aa  211  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  30.19 
 
 		 438 aa  210  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  29.88 
 
 		 428 aa  203  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  31.45 
 
 		 425 aa  202  8e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  32.91 
 
 		 414 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  29.17 
 
 		 431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  30.75 
 
 		 438 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  33.2 
 
 		 440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  30.27 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.48 
 
 		 461 aa  197  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  30.91 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  28.12 
 
 		 428 aa  194  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  33.69 
 
 		 422 aa  194  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  30.33 
 
 		 420 aa  193  6e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1549  glutamyl-tRNA reductase  32.92 
 
 		 428 aa  193  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.214578  normal  0.338338 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3200  glutamyl-tRNA reductase  32.92 
 
 		 450 aa  193  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  29.44 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  32.77 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  32.77 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  32.77 
 
 		 446 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  28.12 
 
 		 428 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  32.15 
 
 		 451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  29.2 
 
 		 432 aa  190  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  33.06 
 
 		 443 aa  189  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  33.06 
 
 		 443 aa  189  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  32.5 
 
 		 434 aa  188  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  30.98 
 
 		 436 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  28.95 
 
 		 422 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  30.18 
 
 		 450 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  31.66 
 
 		 442 aa  187  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  32.9 
 
 		 432 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  32.9 
 
 		 432 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  32.9 
 
 		 434 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  32.9 
 
 		 434 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  32.9 
 
 		 434 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  32.9 
 
 		 434 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  31.21 
 
 		 426 aa  186  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  28.63 
 
 		 448 aa  186  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1254  glutamyl-tRNA reductase  29.79 
 
 		 432 aa  186  8e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.094771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  32.29 
 
 		 425 aa  186  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  28.63 
 
 		 448 aa  186  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  32.68 
 
 		 434 aa  186  9e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  31.29 
 
 		 464 aa  186  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  31.52 
 
 		 458 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  32.11 
 
 		 432 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>