243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3046 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 403 aa  793    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  59.4 
 
 		 403 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  60.56 
 
 		 396 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  54.66 
 
 		 625 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  56.53 
 
 		 427 aa  435  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  56.36 
 
 		 401 aa  437  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  58.23 
 
 		 396 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  59.34 
 
 		 406 aa  425  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  53.7 
 
 		 427 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  54.83 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  51.79 
 
 		 409 aa  388  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  53.76 
 
 		 399 aa  385  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  54.8 
 
 		 412 aa  385  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  53.26 
 
 		 399 aa  371  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  54.69 
 
 		 408 aa  365  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  50.12 
 
 		 442 aa  357  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  51.3 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  46.49 
 
 		 398 aa  348  7e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  43.44 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  43.64 
 
 		 399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  43.19 
 
 		 402 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  43.41 
 
 		 404 aa  342  8e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  50.38 
 
 		 394 aa  333  3e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  41.6 
 
 		 407 aa  332  5e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  45.29 
 
 		 400 aa  332  7.000000000000001e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  50.26 
 
 		 390 aa  330  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  47.52 
 
 		 396 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  42.39 
 
 		 409 aa  325  7e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  41 
 
 		 407 aa  325  8.000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  44.42 
 
 		 404 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  47.52 
 
 		 396 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  47.98 
 
 		 406 aa  322  8e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  42.64 
 
 		 410 aa  320  3e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  42.05 
 
 		 398 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  51.59 
 
 		 395 aa  318  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  44.02 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  41.48 
 
 		 397 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  42.13 
 
 		 397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  42.13 
 
 		 410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  39.47 
 
 		 400 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  49.09 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  36.53 
 
 		 400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  42.42 
 
 		 398 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  38.74 
 
 		 408 aa  301  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  38.9 
 
 		 410 aa  299  7e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  43.54 
 
 		 400 aa  298  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1130  hydroxyglutarate oxidase  38.68 
 
 		 403 aa  296  3e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2738  hydroxyglutarate oxidase  35.49 
 
 		 416 aa  292  8e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368642  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  37.63 
 
 		 399 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  39.95 
 
 		 416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  39.95 
 
 		 416 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  39.43 
 
 		 416 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  41.51 
 
 		 425 aa  282  6.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  40.51 
 
 		 400 aa  273  5.000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  39.79 
 
 		 422 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  40.05 
 
 		 422 aa  267  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  38.9 
 
 		 422 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  38.9 
 
 		 422 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  39.26 
 
 		 422 aa  266  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  39.79 
 
 		 422 aa  266  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582782 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  39.52 
 
 		 422 aa  266  7e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  39.52 
 
 		 422 aa  266  7e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  39.26 
 
 		 422 aa  263  4.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  38.73 
 
 		 422 aa  262  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3091  hydroxyglutarate oxidase  38.73 
 
 		 422 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2970  hydroxyglutarate oxidase  38.99 
 
 		 422 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0184807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2987  hydroxyglutarate oxidase  38.99 
 
 		 422 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.154389 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  38.73 
 
 		 422 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  33.5 
 
 		 409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  34.34 
 
 		 403 aa  189  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  36.22 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26830  hypothetical protein  40.76 
 
 		 245 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  35.47 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 		 405 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 406 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  32.83 
 
 		 364 aa  156  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  30.92 
 
 		 366 aa  150  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 		 374 aa  149  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  31.06 
 
 		 367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 371 aa  146  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 369 aa  146  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  35.41 
 
 		 368 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 375 aa  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 		 368 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 367 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 		 380 aa  143  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 		 370 aa  142  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  33.16 
 
 		 366 aa  140  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.08 
 
 		 373 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  33.08 
 
 		 373 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  29.3 
 
 		 383 aa  139  7.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.33 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>