More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1823 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1823  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
241 aa  466  1e-130  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  58.3 
 
 
237 aa  249  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  60 
 
 
233 aa  248  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.47 
 
 
240 aa  242  4e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  58.01 
 
 
235 aa  238  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.21 
 
 
235 aa  236  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  54.43 
 
 
234 aa  236  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  53.97 
 
 
239 aa  235  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  53.97 
 
 
239 aa  235  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  53.97 
 
 
239 aa  235  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  55.95 
 
 
233 aa  233  2e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  57.89 
 
 
234 aa  233  2e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  55.95 
 
 
233 aa  232  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  54.89 
 
 
236 aa  232  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  53.51 
 
 
236 aa  232  5e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  54.89 
 
 
238 aa  232  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.85 
 
 
242 aa  231  6e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  3.87016e-06 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.08 
 
 
236 aa  230  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  53.39 
 
 
247 aa  230  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.88 
 
 
243 aa  229  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.47 
 
 
239 aa  226  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.65 
 
 
244 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  53.3 
 
 
271 aa  224  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  53.28 
 
 
239 aa  220  2e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.52 
 
 
273 aa  219  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  53.71 
 
 
406 aa  219  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.78 
 
 
236 aa  219  4e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.47 
 
 
241 aa  219  5e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  50.85 
 
 
236 aa  218  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  52.42 
 
 
241 aa  218  6e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52.77 
 
 
239 aa  218  7e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  53.54 
 
 
248 aa  217  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 
246 aa  216  3e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  54.26 
 
 
251 aa  215  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  53.1 
 
 
252 aa  215  6e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  54.26 
 
 
252 aa  213  2e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  54.46 
 
 
229 aa  213  2e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  51.08 
 
 
239 aa  212  4e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.38 
 
 
237 aa  211  8e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  53.95 
 
 
254 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  53.95 
 
 
254 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  53.95 
 
 
254 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  54.02 
 
 
242 aa  210  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52.65 
 
 
238 aa  210  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  53.33 
 
 
286 aa  209  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 
246 aa  209  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.09 
 
 
258 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  52.68 
 
 
229 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.71 
 
 
236 aa  205  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  49.58 
 
 
243 aa  204  9e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  50 
 
 
241 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 
231 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  51.1 
 
 
250 aa  203  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  53.91 
 
 
231 aa  203  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  51.53 
 
 
246 aa  201  1e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  51.98 
 
 
249 aa  200  2e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  44.49 
 
 
246 aa  199  3e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.98 
 
 
243 aa  198  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 
239 aa  196  2e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  46.85 
 
 
257 aa  195  6e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.02 
 
 
252 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.56 
 
 
242 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 
270 aa  192  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.12 
 
 
244 aa  191  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 
230 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  48.44 
 
 
255 aa  185  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.46 
 
 
254 aa  182  4e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 
233 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 
227 aa  178  8e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 
225 aa  176  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2095  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.03 
 
 
256 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2336  two component transcriptional regulator  44.87 
 
 
244 aa  172  4e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.019228 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  44.89 
 
 
230 aa  172  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.88235e-09  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0569  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 
248 aa  172  6e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4670  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 
235 aa  171  8e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.96 
 
 
254 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  45 
 
 
246 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 
224 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.39 
 
 
242 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3577  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 
232 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 
228 aa  166  3e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 
231 aa  166  3e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 
224 aa  166  3e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 
230 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 
230 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0821  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 
232 aa  166  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 
230 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 
228 aa  165  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  44.54 
 
 
237 aa  165  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 
231 aa  165  6e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  40.62 
 
 
227 aa  164  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  40.62 
 
 
227 aa  164  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  40.62 
 
 
227 aa  164  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 
228 aa  164  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  40.62 
 
 
227 aa  164  2e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2316  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  43.95 
 
 
230 aa  163  2e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 
238 aa  164  2e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 
233 aa  163  2e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17451  two-component response regulator  42.8 
 
 
269 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 
229 aa  162  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>