162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1438 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  100 
 
 		 767 aa  1481    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  49.81 
 
 		 748 aa  589  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  50.32 
 
 		 766 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  47.97 
 
 		 759 aa  532  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  47.12 
 
 		 813 aa  528  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  46.83 
 
 		 832 aa  524  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  48.25 
 
 		 795 aa  516  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  48.69 
 
 		 754 aa  514  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  45.43 
 
 		 741 aa  511  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  48.31 
 
 		 786 aa  505  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  44.69 
 
 		 829 aa  495  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  42.69 
 
 		 742 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  43.14 
 
 		 742 aa  489  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  44.42 
 
 		 804 aa  484  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  43.36 
 
 		 902 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  42.45 
 
 		 746 aa  482  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  44.24 
 
 		 734 aa  479  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  45.81 
 
 		 724 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  46.66 
 
 		 776 aa  482  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  45.55 
 
 		 724 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  45.55 
 
 		 724 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  44.81 
 
 		 733 aa  478  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.86 
 
 		 747 aa  467  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  42.89 
 
 		 735 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  44.99 
 
 		 757 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  47.8 
 
 		 765 aa  466  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  46.67 
 
 		 874 aa  464  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  41.15 
 
 		 759 aa  460  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.29 
 
 		 788 aa  456  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  42.53 
 
 		 771 aa  459  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  46.27 
 
 		 726 aa  457  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  45.05 
 
 		 758 aa  448  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  40.78 
 
 		 732 aa  437  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  37.5 
 
 		 758 aa  431  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  49.34 
 
 		 750 aa  421  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  44.19 
 
 		 685 aa  406  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.13 
 
 		 691 aa  343  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.15 
 
 		 693 aa  339  9e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  38.83 
 
 		 726 aa  332  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  36.12 
 
 		 799 aa  325  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  38.98 
 
 		 703 aa  324  4e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  39.26 
 
 		 706 aa  320  7e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  36.45 
 
 		 742 aa  308  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  39.36 
 
 		 705 aa  306  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  37.42 
 
 		 761 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  37.26 
 
 		 717 aa  300  6e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.44 
 
 		 705 aa  298  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  35.73 
 
 		 716 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.9 
 
 		 715 aa  287  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  33.29 
 
 		 715 aa  282  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.38 
 
 		 728 aa  280  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.33 
 
 		 764 aa  280  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  33.08 
 
 		 706 aa  270  8e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.64 
 
 		 732 aa  261  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  36.84 
 
 		 710 aa  261  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.21 
 
 		 755 aa  261  5.0000000000000005e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  32.94 
 
 		 680 aa  247  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  34.68 
 
 		 666 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.1 
 
 		 659 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  33.29 
 
 		 692 aa  236  8e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.25 
 
 		 695 aa  236  1.0000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.24 
 
 		 670 aa  215  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.78 
 
 		 645 aa  210  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  31.24 
 
 		 792 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.82 
 
 		 724 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  37.71 
 
 		 695 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  31.9 
 
 		 717 aa  189  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  36.68 
 
 		 679 aa  187  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  37 
 
 		 710 aa  182  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.53 
 
 		 672 aa  180  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  34.84 
 
 		 719 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  34.2 
 
 		 727 aa  174  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  37.78 
 
 		 684 aa  171  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.69 
 
 		 861 aa  170  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  26.43 
 
 		 753 aa  156  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  22.8 
 
 		 780 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  35.96 
 
 		 755 aa  133  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  36.32 
 
 		 706 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  36.32 
 
 		 706 aa  131  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  37.04 
 
 		 785 aa  131  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1680  superfamily I DNA/RNA helicase  31.56 
 
 		 764 aa  129  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.119697  hitchhiker  0.00309861 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  31.65 
 
 		 787 aa  128  5e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  31.31 
 
 		 1048 aa  127  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  36.7 
 
 		 689 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  36.7 
 
 		 689 aa  124  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  36.7 
 
 		 689 aa  124  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  36.7 
 
 		 689 aa  124  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  36.7 
 
 		 689 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.61 
 
 		 716 aa  123  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.3 
 
 		 763 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  36.24 
 
 		 691 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  36.24 
 
 		 691 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  29.25 
 
 		 778 aa  122  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  36.24 
 
 		 689 aa  122  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  37.16 
 
 		 778 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  36.24 
 
 		 689 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.77 
 
 		 763 aa  121  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  36.24 
 
 		 691 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  29.3 
 
 		 777 aa  121  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  33.64 
 
 		 760 aa  121  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>