More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4063 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 228 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  56.52 
 
 		 211 aa  193  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  56.83 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  56.83 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  56.28 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  54.41 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  50.53 
 
 		 207 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  51.69 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  51.74 
 
 		 213 aa  161  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  48.09 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  45.79 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  47.66 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  49.44 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  46.7 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 208 aa  148  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3156  NUDIX hydrolase  47.14 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.38817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  51.11 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  44.16 
 
 		 199 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  46.2 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  42.54 
 
 		 178 aa  135  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 		 178 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  40.57 
 
 		 177 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  47.19 
 
 		 210 aa  128  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1755  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  hitchhiker  0.000762275 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  45.4 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 		 193 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  45.99 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1133  NUDIX hydrolase  42.93 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  42.79 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 		 184 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 		 183 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1519  NUDIX hydrolase  40.57 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000389624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  41.29 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22070  NTP pyrophosphohydrolase  45.78 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  36.87 
 
 		 180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  37.85 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4431  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 		 179 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 179 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 177 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3089  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 177 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 		 281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  39.57 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  39.57 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  39.57 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  39.57 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 172 aa  108  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  39.57 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  39.57 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  39.57 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14200  NUDIX family protein  37.96 
 
 		 235 aa  108  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0659704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  38.96 
 
 		 179 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 		 179 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  38.96 
 
 		 179 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  38.13 
 
 		 186 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1348  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.841772  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  32.6 
 
 		 177 aa  104  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 		 199 aa  101  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  31.4 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 		 176 aa  100  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  40.56 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 		 186 aa  98.2  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 179 aa  98.2  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12410  NUDIX family protein  44.91 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.274172  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  40.69 
 
 		 180 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  30.81 
 
 		 176 aa  96.3  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 		 199 aa  95.9  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  36.84 
 
 		 194 aa  95.9  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 180 aa  95.9  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 180 aa  95.9  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 		 190 aa  95.9  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  31.46 
 
 		 180 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1665  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 203 aa  94.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0528877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  36.32 
 
 		 194 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 196 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.36 
 
 		 196 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 		 183 aa  93.2  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  92.4  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 		 183 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 		 194 aa  92  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 196 aa  91.7  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 192 aa  91.7  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 		 204 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 		 183 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  30.11 
 
 		 176 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 		 180 aa  90.5  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 179 aa  90.5  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  34.9 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  35.23 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.81 
 
 		 196 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  32.93 
 
 		 194 aa  89.7  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  34.81 
 
 		 196 aa  88.6  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.81 
 
 		 196 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>