More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0732 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  100 
 
 
178 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  43.53 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  38.71 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1605  GrpE protein  38.56 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0303276  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  39.05 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  35.87 
 
 
192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  40.12 
 
 
210 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  33.33 
 
 
190 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  42.42 
 
 
198 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  36.81 
 
 
181 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  39.24 
 
 
225 aa  99.8  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  41.04 
 
 
189 aa  98.2  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  34.76 
 
 
226 aa  98.2  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  41.54 
 
 
192 aa  97.8  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  41.54 
 
 
192 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  37.76 
 
 
204 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  39.26 
 
 
199 aa  96.3  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  40.46 
 
 
208 aa  95.5  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  40.77 
 
 
198 aa  95.5  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  33.15 
 
 
221 aa  95.9  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  40 
 
 
191 aa  95.5  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  38.73 
 
 
210 aa  95.1  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  39.13 
 
 
244 aa  94.7  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  31.38 
 
 
213 aa  94.7  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  38.56 
 
 
202 aa  94.4  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  33.77 
 
 
175 aa  94  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  36.67 
 
 
231 aa  93.6  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  38.36 
 
 
172 aa  94  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  39.13 
 
 
260 aa  93.6  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  33.33 
 
 
282 aa  92.8  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  39.73 
 
 
172 aa  93.2  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  32.12 
 
 
217 aa  93.2  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 
195 aa  92.8  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  40.31 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  40.31 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  40.31 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  40.31 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  40.31 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  40.31 
 
 
188 aa  92  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  40.31 
 
 
188 aa  92  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  40.31 
 
 
188 aa  92  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  41.45 
 
 
171 aa  91.3  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  36.84 
 
 
197 aa  90.1  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  33.99 
 
 
248 aa  90.1  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  32.24 
 
 
225 aa  90.5  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  36.3 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  33.33 
 
 
223 aa  90.5  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  29.94 
 
 
206 aa  90.5  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  35.66 
 
 
194 aa  90.5  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4475  GrpE protein  36.49 
 
 
224 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323495  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  39.39 
 
 
186 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  34.25 
 
 
186 aa  90.1  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  36.57 
 
 
274 aa  90.1  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  35.17 
 
 
181 aa  89  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  33.7 
 
 
225 aa  89.4  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  38.97 
 
 
242 aa  88.6  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  35.56 
 
 
210 aa  88.6  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  38.56 
 
 
200 aa  88.2  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  35.16 
 
 
200 aa  88.2  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  38.56 
 
 
172 aa  87.8  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  37.91 
 
 
172 aa  87.8  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  32.3 
 
 
224 aa  87.4  9e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  37.12 
 
 
188 aa  87  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  35.29 
 
 
208 aa  87  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  34.78 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  30 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  37.33 
 
 
201 aa  86.3  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  35.59 
 
 
181 aa  85.9  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  30.49 
 
 
208 aa  85.5  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  30.49 
 
 
208 aa  85.5  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1347  GrpE protein  41.67 
 
 
150 aa  84.7  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.966336  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  35.12 
 
 
187 aa  84.7  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0764  GrpE protein  33.52 
 
 
187 aa  84.7  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  32.61 
 
 
246 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  35.4 
 
 
204 aa  84.7  7e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  34.33 
 
 
200 aa  84.3  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  36.15 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  30.77 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  36.77 
 
 
175 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  35.07 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  34.62 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  32.61 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  36.53 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  34.78 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  32.12 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  32.75 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  31.06 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  34.44 
 
 
185 aa  82  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  30.32 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  34.12 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  31.95 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  37.59 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  37.25 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  36.57 
 
 
197 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  36.49 
 
 
199 aa  81.3  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>