More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0037 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 255 aa  497  1e-140  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  48.18 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  47.15 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  48.16 
 
 		 250 aa  239  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  46.34 
 
 		 249 aa  229  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  46.31 
 
 		 249 aa  223  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  47.15 
 
 		 249 aa  222  6e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  46.75 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  45.53 
 
 		 249 aa  205  7e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  46.55 
 
 		 264 aa  195  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  41.3 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  45.07 
 
 		 253 aa  188  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  43.67 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  42.02 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  41.13 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  40.34 
 
 		 256 aa  165  8e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  40.34 
 
 		 256 aa  164  9e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  37.6 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  35.77 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.15 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  40.17 
 
 		 284 aa  158  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.15 
 
 		 253 aa  158  8e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.68 
 
 		 255 aa  158  8e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.74 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  35.66 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  41.59 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  38.14 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  37.76 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  36.6 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  30.92 
 
 		 270 aa  128  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  38.99 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  33.05 
 
 		 278 aa  125  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  34.09 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  30.77 
 
 		 261 aa  118  9e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  32.58 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  34.87 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  33.03 
 
 		 276 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  31.5 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  29.26 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  36.41 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  27.11 
 
 		 289 aa  109  5e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  29.72 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  26.86 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  30.92 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2668  putative ABC-2 type transporter  28.68 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.149875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1239  hypothetical protein  43.48 
 
 		 126 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0798004 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5008  ABC-2 type transporter  30.29 
 
 		 290 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  33.97 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1789  ABC-2 type transporter  35.48 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0899  ABC transporter, inner membrane subunit  31.78 
 
 		 287 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208954  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 		 256 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5312  ABC-2 type transporter  29.88 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  29.38 
 
 		 270 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2845  ABC-2 type transporter  27.94 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 280 aa  97.4  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0948  ABC-2 type transporter  30.84 
 
 		 287 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0389515  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  27.83 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0950  ABC-2 type transporter  31.31 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  32.37 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0945  ABC transporter related  31.34 
 
 		 665 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  26.64 
 
 		 242 aa  93.6  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1281  ABC transporter, permease protein  27.19 
 
 		 267 aa  92.4  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 		 272 aa  92.4  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 		 290 aa  92.4  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  30.04 
 
 		 284 aa  92  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 280 aa  92  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  29.95 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  30.24 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3036  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 		 295 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 297 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  27.12 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  28.22 
 
 		 293 aa  89  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1258  ABC-2 type transporter  30.58 
 
 		 366 aa  86.7  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.793324  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  25.84 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 277 aa  85.1  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 286 aa  85.1  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  29.11 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  30.59 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2716  ABC-2 type transporter  27.7 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722099  normal  0.404026 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  33.51 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  24.8 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  27.16 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0613  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0091  ABC transporter  28.75 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  33.16 
 
 		 339 aa  82.4  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  32.64 
 
 		 360 aa  82  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  29.66 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  28.79 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>