63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1239 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1239  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  251  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0798004 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  70.34 
 
 		 249 aa  159  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  69.64 
 
 		 249 aa  155  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  75.42 
 
 		 249 aa  153  8e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  73.73 
 
 		 249 aa  152  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  61.86 
 
 		 249 aa  143  9e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  69.64 
 
 		 249 aa  139  9e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  45.54 
 
 		 250 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  43.48 
 
 		 255 aa  103  9e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  48.65 
 
 		 264 aa  101  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  45.69 
 
 		 264 aa  98.2  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  38.98 
 
 		 254 aa  90.5  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  39.25 
 
 		 260 aa  86.7  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  40.91 
 
 		 281 aa  84.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  40.74 
 
 		 270 aa  80.9  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  39.29 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  34.51 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  39.05 
 
 		 289 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  37.4 
 
 		 253 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  37.4 
 
 		 253 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  36.59 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  35.45 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  39.45 
 
 		 273 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  36.61 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  35.96 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  37.07 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 270 aa  68.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  35.59 
 
 		 255 aa  68.2  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  33.94 
 
 		 284 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0945  ABC transporter related  33.02 
 
 		 665 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  36.11 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  43.18 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  43.18 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0948  ABC-2 type transporter  33.01 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0389515  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0950  ABC-2 type transporter  33.01 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0899  ABC transporter, inner membrane subunit  32.04 
 
 		 287 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208954  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  33.96 
 
 		 256 aa  62  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1789  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 		 261 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  31.86 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 		 256 aa  54.3  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 		 251 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  24.55 
 
 		 256 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 		 278 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 260 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  25.23 
 
 		 256 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  30.85 
 
 		 278 aa  47  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  31.3 
 
 		 277 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  24.76 
 
 		 261 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  31.11 
 
 		 242 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  31.91 
 
 		 278 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  34.94 
 
 		 256 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  35.23 
 
 		 275 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  33.77 
 
 		 252 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  28 
 
 		 284 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.73 
 
 		 271 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 285 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  32.81 
 
 		 259 aa  41.2  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3928  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 256 aa  41.2  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  22.92 
 
 		 266 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  30.97 
 
 		 246 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  39.22 
 
 		 257 aa  40  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>