47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1169 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1169  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  188  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0784464 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  52.17 
 
 		 319 aa  102  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  46.67 
 
 		 330 aa  96.7  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  49.45 
 
 		 330 aa  95.1  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  48.35 
 
 		 330 aa  91.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  48.39 
 
 		 331 aa  91.3  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  46.81 
 
 		 333 aa  90.9  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.56 
 
 		 331 aa  90.1  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  45.05 
 
 		 330 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.56 
 
 		 331 aa  86.3  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.96 
 
 		 330 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  42.86 
 
 		 331 aa  85.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  46.67 
 
 		 331 aa  85.5  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  40.66 
 
 		 330 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  40.66 
 
 		 333 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.66 
 
 		 330 aa  83.6  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  43.48 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  39.56 
 
 		 333 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.62 
 
 		 331 aa  81.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.22 
 
 		 321 aa  81.3  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  47.25 
 
 		 330 aa  79  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0665  CRISPR-associated protein Cas1  45 
 
 		 322 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100069  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0903  CRISPR-associated protein Cas1  42.35 
 
 		 334 aa  74.7  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.019611  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  38.04 
 
 		 326 aa  73.9  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.78 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.77 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  41.3 
 
 		 330 aa  67  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  36.28 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  37.78 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  46.15 
 
 		 384 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  32.56 
 
 		 330 aa  60.1  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3000  CRISPR-associated protein Cas1  32.56 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0143403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  33.75 
 
 		 331 aa  57.4  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.37 
 
 		 329 aa  57.4  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.53 
 
 		 328 aa  57  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1803  hypothetical protein  32.56 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  30.23 
 
 		 330 aa  54.3  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.58 
 
 		 338 aa  52  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1287  CRISPR-associated protein Cas1  33.68 
 
 		 332 aa  50.8  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0188131  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0915  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.63 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00714947  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1019  CRISPR-associated protein Cas1  25 
 
 		 321 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  31.34 
 
 		 325 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  31.34 
 
 		 325 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  32.84 
 
 		 325 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.22 
 
 		 326 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  30.53 
 
 		 325 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1425  CRISPR-associated protein Cas1  28.42 
 
 		 332 aa  40.8  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00327845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>