More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0099 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0099  peptidase M23  100 
 
 
455 aa  892    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2563  Peptidase M23  69.28 
 
 
466 aa  592  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0130125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2288  peptidase M23B  69.51 
 
 
466 aa  592  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.103425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2245  Peptidase M23  66.52 
 
 
458 aa  578  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587035  normal  0.487877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4732  Peptidase M23  64.22 
 
 
440 aa  497  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189626  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4222  peptidase M23B  61.01 
 
 
430 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.831503  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2932  peptidase M23  50.38 
 
 
459 aa  362  9e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0644  Peptidase M23  50.49 
 
 
457 aa  353  4e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328694 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0163  Peptidase M23  47.69 
 
 
463 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0257  peptidase M23B  47 
 
 
461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0165  peptidase M23B  46.49 
 
 
448 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0567  peptidase M23B  46.48 
 
 
471 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0415  hypothetical protein  44.12 
 
 
445 aa  315  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0524  peptidase M23B  43.38 
 
 
469 aa  311  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.204903  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0448  peptidase M23B  42.47 
 
 
450 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201796  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1061  peptidase M23B  39.27 
 
 
440 aa  300  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2071  peptidase M23B  41.01 
 
 
477 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.435077  normal  0.225053 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1771  hypothetical protein  38.35 
 
 
449 aa  280  4e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1838  hypothetical protein  38.1 
 
 
449 aa  279  9e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.331225  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3015  peptidase M23B  39.95 
 
 
478 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180864  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3884  Peptidase M23  38.46 
 
 
465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0398699 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3452  peptidase M23B  39.77 
 
 
423 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106399  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4299  hypothetical protein  38.31 
 
 
491 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124311  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4208  Peptidase M23  38.79 
 
 
467 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.197588 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1473  peptidase M23B  37.86 
 
 
446 aa  209  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.758633  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0323  M23 peptidase domain-containing protein  28.11 
 
 
420 aa  189  5.999999999999999e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2795  peptidase M23B  32.46 
 
 
401 aa  173  5.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4723  peptidase M23B  32.17 
 
 
350 aa  134  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452825  normal  0.12326 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  47.1 
 
 
491 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0933  hypothetical protein  28.53 
 
 
370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0950283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2592  peptidase M23B  28.53 
 
 
370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.638957  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2546  peptidase M23B  30.06 
 
 
413 aa  110  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.532046 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0090  peptidase M23B  28.08 
 
 
367 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0628683  normal  0.786145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0380  peptidase M23B  29.1 
 
 
386 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2756  peptidase M23B  26.72 
 
 
367 aa  106  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.122209  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2982  peptidase M23B  28 
 
 
370 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.795693  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3022  Peptidase M23  28.78 
 
 
449 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.051505 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2507  peptidase M23B  26.55 
 
 
411 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0904  peptidase M23B  41.27 
 
 
392 aa  96.3  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54116  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0056  peptidase M23B  29.62 
 
 
414 aa  94.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  26.93 
 
 
388 aa  90.9  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  32.47 
 
 
387 aa  89.4  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  34.9 
 
 
372 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0575  peptidase M23B  28.31 
 
 
405 aa  88.2  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  24.35 
 
 
433 aa  87  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  37.23 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  37.23 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  35.88 
 
 
477 aa  84.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  28.15 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  36.55 
 
 
481 aa  84  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  35.77 
 
 
370 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  24.66 
 
 
412 aa  82.4  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  23.75 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  33.82 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  21.19 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  23.21 
 
 
424 aa  77.4  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  23.12 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  34.35 
 
 
382 aa  77  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  27.07 
 
 
456 aa  77  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  27.07 
 
 
456 aa  77  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  27.07 
 
 
456 aa  77  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  23.76 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  25.46 
 
 
436 aa  76.6  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  31.82 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  25.2 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  22.26 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  20.52 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  26.4 
 
 
428 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0724  peptidase M23B  29.03 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  22.67 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  25.94 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  25.63 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  25.71 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  22.48 
 
 
433 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  22.94 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  30.22 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0525  M23/M37 peptidase domain protein  33.6 
 
 
472 aa  71.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0683  Peptidase M23  33.6 
 
 
472 aa  71.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  29.55 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  24.12 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2021  Peptidase M23  33.1 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  24.58 
 
 
428 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  30.83 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  31.58 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  30.83 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  34.93 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  30.08 
 
 
434 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  30.83 
 
 
438 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  30.83 
 
 
438 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  33.57 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  30.08 
 
 
441 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  24.1 
 
 
426 aa  65.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  33.33 
 
 
432 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1443  hypothetical protein  26.54 
 
 
410 aa  65.5  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  25.36 
 
 
430 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  29.37 
 
 
424 aa  62.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1436  M24/M37 family peptidase  29.11 
 
 
369 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0228045  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  21.91 
 
 
375 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  22.39 
 
 
427 aa  60.8  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  27.56 
 
 
427 aa  61.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>