More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1526 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  100 
 
 		 228 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  85.96 
 
 		 228 aa  411  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  85.96 
 
 		 228 aa  411  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  62.28 
 
 		 225 aa  287  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  59.91 
 
 		 225 aa  276  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  56.89 
 
 		 221 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  55.66 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3592  carbonate dehydratase  53.59 
 
 		 220 aa  238  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  54.33 
 
 		 214 aa  235  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  52.38 
 
 		 216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0340  carbonate dehydratase  52.83 
 
 		 214 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2792  carbonic anhydrase  51.67 
 
 		 216 aa  228  5e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  52.91 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  54.37 
 
 		 213 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  50 
 
 		 213 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  53.4 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  50 
 
 		 215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  52.15 
 
 		 218 aa  211  5.999999999999999e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  51.69 
 
 		 214 aa  210  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1829  carbonic anhydrase, putative  48.79 
 
 		 213 aa  206  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.486223  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  49.76 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0351  Carbonate dehydratase  48.11 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1187  carbonate dehydratase  47.2 
 
 		 242 aa  195  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.980271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  46.88 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  42.03 
 
 		 210 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  43.54 
 
 		 213 aa  178  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  44.61 
 
 		 255 aa  177  9e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1165  carbonate dehydratase  45.89 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.623319  normal  0.0416937 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  46.12 
 
 		 210 aa  175  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  47.29 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  41.18 
 
 		 209 aa  164  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  41.18 
 
 		 209 aa  164  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0240  carbonate dehydratase  41.67 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615218  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  40.58 
 
 		 214 aa  161  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0227  carbonate dehydratase  37.13 
 
 		 206 aa  161  8.000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000228085  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1969  carbonic anhydrase  37.13 
 
 		 206 aa  161  8.000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  43.63 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2705  carbonate dehydratase  39.53 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1282  carbonate dehydratase  43.2 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.95303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2491  carbonate dehydratase  40 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.235188 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  42.25 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0108  carbonate dehydratase  37.62 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.032472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3457  carbonate dehydratase  38.03 
 
 		 216 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  38.29 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  37.83 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0036  carbonate dehydratase  38.86 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1377  carbonic anhydrase  39.42 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0045  carbonate dehydratase  39.42 
 
 		 214 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3236  carbonate anhydratase  38.32 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  40.59 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  34.43 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8182  Zn carbonic anhydrase  42.55 
 
 		 185 aa  142  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249674  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  41.33 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  39.8 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  38.34 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  36.36 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  39.59 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  34.12 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  39.62 
 
 		 244 aa  138  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  35.94 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  35.94 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  37.56 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  35.94 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  37.56 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  37.5 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  34.31 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4590  carbonate dehydratase  34.14 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1665  carbonic anhydrase  37.38 
 
 		 238 aa  132  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  33.65 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  34.48 
 
 		 222 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  36.51 
 
 		 200 aa  131  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  36.32 
 
 		 225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  38.1 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  34.47 
 
 		 216 aa  124  9e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  36.45 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  36.45 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  35.78 
 
 		 251 aa  121  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  36.45 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  35.44 
 
 		 217 aa  118  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 242 aa  118  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  33.66 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  37.21 
 
 		 787 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  33.66 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  33.82 
 
 		 239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  33.82 
 
 		 239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  33.82 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  34.76 
 
 		 225 aa  114  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1824  carbonate dehydratase  31 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000671505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  34.03 
 
 		 739 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1281  carbonate dehydratase  33.16 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  33.5 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  35.19 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0986  carbonate dehydratase  35.57 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0207878  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 239 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  32.35 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  32.04 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  30.56 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  32.35 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  30.88 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 211 aa  108  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>