More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2684 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  100 
 
 		 195 aa  393  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  75.68 
 
 		 186 aa  292  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  43.01 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  44.32 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.75 
 
 		 206 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  44.86 
 
 		 192 aa  142  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  44.32 
 
 		 184 aa  141  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.76 
 
 		 189 aa  141  8e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  40.22 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.16 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.16 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  39.79 
 
 		 190 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  41.27 
 
 		 184 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.47 
 
 		 190 aa  138  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.63 
 
 		 190 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  41.27 
 
 		 189 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.11 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.11 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  44.62 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  44.62 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  44.62 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  44.62 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  44.62 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  44.62 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  44.62 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  44.21 
 
 		 264 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.36 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.74 
 
 		 190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  41.58 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  38.74 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  43.16 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.39 
 
 		 204 aa  131  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  40.74 
 
 		 184 aa  131  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  40.54 
 
 		 184 aa  131  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  38.95 
 
 		 183 aa  130  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.46 
 
 		 191 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  40.41 
 
 		 190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  40.86 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.32 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  44.33 
 
 		 189 aa  125  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  39.25 
 
 		 190 aa  124  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  38.59 
 
 		 213 aa  124  7e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.02 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.62 
 
 		 184 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.25 
 
 		 189 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  42.41 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.11 
 
 		 205 aa  123  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.62 
 
 		 184 aa  123  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.44 
 
 		 184 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.33 
 
 		 201 aa  121  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.1 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  39.34 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.62 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.16 
 
 		 183 aa  117  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  37.63 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  40.74 
 
 		 203 aa  114  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.08 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.42 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.42 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.78 
 
 		 190 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  33.17 
 
 		 194 aa  104  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.2 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.22 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.04 
 
 		 184 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  38.74 
 
 		 196 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  31.53 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  31.53 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  38.22 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  39.57 
 
 		 135 aa  98.2  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  33.66 
 
 		 199 aa  97.8  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  39.29 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  36.76 
 
 		 178 aa  96.3  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.4 
 
 		 160 aa  94.4  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  33.79 
 
 		 200 aa  90.9  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  36.06 
 
 		 204 aa  90.5  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  30.54 
 
 		 200 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  29.52 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  33.33 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  29.52 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  32.02 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  32.02 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  30 
 
 		 200 aa  88.6  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  35.86 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  30.23 
 
 		 201 aa  88.6  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  33.79 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  33.81 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  29.52 
 
 		 200 aa  87.8  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  34.48 
 
 		 200 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  31.53 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  31.03 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  42.27 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  33.57 
 
 		 206 aa  85.9  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  32.02 
 
 		 200 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4139  flavoprotein WrbA  32.21 
 
 		 198 aa  85.1  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000384114  unclonable  0.00000000000397831 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  35.17 
 
 		 200 aa  85.1  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  29.61 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  36.81 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  33.01 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  29.53 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  31.03 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>