More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1023 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  77.78 
 
 
855 aa  1315  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  77.61 
 
 
872 aa  1228  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  74.77 
 
 
890 aa  1246  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  71.55 
 
 
856 aa  1186  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  71.03 
 
 
856 aa  1209  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  69.66 
 
 
857 aa  1194  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  72.25 
 
 
855 aa  1159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  81.47 
 
 
865 aa  1360  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.42292e-09 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  72.25 
 
 
855 aa  1159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  65.11 
 
 
856 aa  1086  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  70.22 
 
 
858 aa  1201  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  48.43 
 
 
871 aa  702  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  53.39 
 
 
896 aa  864  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  74.71 
 
 
861 aa  1272  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  78.05 
 
 
862 aa  1260  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  74.18 
 
 
861 aa  1234  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  74.82 
 
 
861 aa  1272  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  66.04 
 
 
856 aa  1113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  100 
 
 
855 aa  1703  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  73.3 
 
 
875 aa  1254  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  42.36 
 
 
878 aa  626  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  43.38 
 
 
886 aa  622  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  43.38 
 
 
886 aa  622  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  43.04 
 
 
883 aa  616  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  38.41 
 
 
894 aa  603  1e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  38.25 
 
 
876 aa  602  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  39.11 
 
 
882 aa  584  1e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  41.11 
 
 
906 aa  582  1e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  38.53 
 
 
887 aa  584  1e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  41.6 
 
 
914 aa  578  1e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  41.18 
 
 
894 aa  577  1e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  44.44 
 
 
879 aa  576  1e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  39.95 
 
 
895 aa  568  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  38.89 
 
 
902 aa  564  1e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  41.88 
 
 
910 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  38.9 
 
 
885 aa  553  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  40.9 
 
 
881 aa  541  1e-152  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  40.41 
 
 
908 aa  541  1e-152  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  38.68 
 
 
877 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  37.17 
 
 
893 aa  538  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  38.68 
 
 
877 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  39.54 
 
 
918 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  38.79 
 
 
901 aa  524  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  42.56 
 
 
746 aa  516  1e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  37.97 
 
 
879 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  38.36 
 
 
900 aa  511  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  33.8 
 
 
874 aa  501  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  33.57 
 
 
874 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  39.05 
 
 
939 aa  498  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  44.25 
 
 
755 aa  493  1e-138  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  43.56 
 
 
722 aa  492  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  41.81 
 
 
751 aa  487  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  40.49 
 
 
727 aa  479  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.02251e-09 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  39.92 
 
 
741 aa  471  1e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  40.21 
 
 
743 aa  471  1e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  41.06 
 
 
723 aa  468  1e-130  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  38.61 
 
 
730 aa  447  1e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  38.47 
 
 
730 aa  446  1e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  39.58 
 
 
723 aa  444  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  39.5 
 
 
727 aa  440  1e-122  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  38.76 
 
 
744 aa  438  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  40.86 
 
 
748 aa  426  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  33.03 
 
 
622 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  33.02 
 
 
637 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  30.88 
 
 
646 aa  213  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  31.9 
 
 
636 aa  210  8e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  21.66 
 
 
741 aa  201  6e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.48446e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  37.98 
 
 
538 aa  199  1e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  33.46 
 
 
664 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.83 
 
 
778 aa  194  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.83 
 
 
778 aa  193  9e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2756  Mur ligase family protein  28.46 
 
 
560 aa  189  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  31.23 
 
 
584 aa  188  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  26.76 
 
 
573 aa  186  2e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4828  Mur ligase middle domain protein  39.39 
 
 
576 aa  182  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  34.37 
 
 
757 aa  171  8e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  30.02 
 
 
647 aa  169  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.22 
 
 
755 aa  168  3e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.56 
 
 
755 aa  166  2e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  37.65 
 
 
1103 aa  165  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  32.2 
 
 
328 aa  165  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0096  hypothetical protein  31.47 
 
 
441 aa  153  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.284212  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  27.08 
 
 
1086 aa  151  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  36.23 
 
 
754 aa  148  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1341  GNAT family acetyltransferase  35.4 
 
 
581 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21434  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  36.49 
 
 
585 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  37.86 
 
 
593 aa  145  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  34.54 
 
 
597 aa  145  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3965  glutathione synthase  35.1 
 
 
581 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.731928  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1749  acetyltransferase  35.1 
 
 
581 aa  144  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489963  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2956  glutathione synthase  37.04 
 
 
579 aa  144  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0363198 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  34.68 
 
 
593 aa  143  1e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13520  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  35.86 
 
 
725 aa  142  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0923131  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  35.22 
 
 
581 aa  142  4e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2054  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
594 aa  140  8e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
594 aa  140  8e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130763  normal  0.0643161 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2100  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
594 aa  140  8e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19360  GNAT family acetyltransferase  36.49 
 
 
585 aa  140  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371953  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  35.47 
 
 
571 aa  139  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34970  Acetyltransferase GNAT family  34.7 
 
 
579 aa  137  1e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>