More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_2355 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  100 
 
 
509 aa  1009    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.5 
 
 
500 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.53 
 
 
505 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.51 
 
 
448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  31.05 
 
 
517 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.58 
 
 
432 aa  160  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.69 
 
 
419 aa  151  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  30.27 
 
 
335 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.29 
 
 
404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.52 
 
 
419 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29 
 
 
428 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  31.78 
 
 
500 aa  144  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.59 
 
 
419 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  30.61 
 
 
489 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.77 
 
 
504 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  30.56 
 
 
417 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  31.35 
 
 
329 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  31.78 
 
 
400 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.02 
 
 
430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  28.64 
 
 
411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  34.37 
 
 
493 aa  134  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.787622 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  29.22 
 
 
407 aa  134  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.98 
 
 
416 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.85 
 
 
471 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.67 
 
 
432 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  29.62 
 
 
405 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  28.24 
 
 
449 aa  126  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2865  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.09 
 
 
478 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0716848 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  27.47 
 
 
424 aa  124  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  25.79 
 
 
432 aa  123  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  27.46 
 
 
464 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  0.000000000906287 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.62 
 
 
448 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  29.78 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.3 
 
 
453 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  32.52 
 
 
390 aa  122  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  29.78 
 
 
408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.42 
 
 
430 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  28.07 
 
 
403 aa  121  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  25.55 
 
 
372 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  28.3 
 
 
394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  25.33 
 
 
372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  26.52 
 
 
456 aa  121  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  28.01 
 
 
429 aa  121  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  26.23 
 
 
372 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  26.8 
 
 
371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.8 
 
 
371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  26.8 
 
 
371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  25.55 
 
 
372 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  26.8 
 
 
371 aa  120  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  26.8 
 
 
371 aa  120  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  26.8 
 
 
371 aa  120  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  26.8 
 
 
371 aa  120  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.42 
 
 
462 aa  120  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  28.14 
 
 
429 aa  120  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  29.11 
 
 
328 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  29.11 
 
 
328 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  25.55 
 
 
372 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  26.8 
 
 
371 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  32.68 
 
 
345 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  30.93 
 
 
331 aa  119  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  26.8 
 
 
371 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.33 
 
 
453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  27.29 
 
 
370 aa  118  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  27.29 
 
 
370 aa  118  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  27.29 
 
 
370 aa  118  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0553  secretion protein HlyD  31.89 
 
 
450 aa  116  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.5 
 
 
409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1719  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.86 
 
 
517 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0477  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  27.64 
 
 
415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  30.27 
 
 
344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  28.66 
 
 
444 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.22 
 
 
430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3060  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.6 
 
 
424 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  29.07 
 
 
442 aa  113  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.25 
 
 
487 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0919  AcrA/AcrE family efflux protein  28.46 
 
 
377 aa  113  9e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  27.12 
 
 
489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  27.66 
 
 
402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.01 
 
 
487 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2041  secretion protein HlyD  27.95 
 
 
398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  25.27 
 
 
455 aa  111  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  31.23 
 
 
335 aa  111  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  28.24 
 
 
388 aa  111  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.45 
 
 
430 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0836  macrolide efflux protein MacA  24.89 
 
 
435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  27.14 
 
 
426 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  28.33 
 
 
430 aa  110  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2186  macrolide efflux protein MacA  24.89 
 
 
428 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0927  macrolide efflux protein MacA  24.95 
 
 
399 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.5 
 
 
467 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2972  secretion protein HlyD  28.4 
 
 
429 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  27.52 
 
 
413 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  31.15 
 
 
328 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.78 
 
 
410 aa  110  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  29.49 
 
 
371 aa  109  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  27.29 
 
 
405 aa  109  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  33.22 
 
 
332 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3323  secretion protein HlyD  29.09 
 
 
459 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.98 
 
 
414 aa  109  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  32.65 
 
 
337 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>