More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1991 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1991  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 249 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2950  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.35 
 
 		 250 aa  345  4e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2433  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.42 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168738  normal  0.817452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3389  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.9 
 
 		 248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3832  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.03 
 
 		 245 aa  227  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2447  cyclic nucleotide-binding protein  46.53 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2990  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.22 
 
 		 244 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2763  cyclic nucleotide-binding  43.22 
 
 		 244 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0859  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 234 aa  208  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.42 
 
 		 384 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2886  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.95 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45 
 
 		 384 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  46.15 
 
 		 376 aa  202  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6209  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0102902  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0073  cyclic nucleotide-binding  46.15 
 
 		 255 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4270  CRP/FNR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 225 aa  194  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893417 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.46 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582037  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3758  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.02 
 
 		 247 aa  192  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1427  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40 
 
 		 267 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0133  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.8 
 
 		 268 aa  184  9e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  0.0379159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3480  cyclic nucleotide-binding  41.32 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3788  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.32 
 
 		 249 aa  182  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1986  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.88 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7477  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.13 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2024  cyclic nucleotide-binding  42.98 
 
 		 259 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.996332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2301  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.98 
 
 		 259 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.63 
 
 		 246 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0738845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2686  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.08 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.038663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0772  cyclic nucleotide-binding  44.64 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4497  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.85 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140276  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0953  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6403  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1439  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 243 aa  175  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7493  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.85 
 
 		 246 aa  174  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 236 aa  174  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342582  normal  0.0135439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1835  cyclic nucleotide-binding protein  43.12 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4564  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00106309 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1485  cyclic nucleotide-binding protein  42.93 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1441  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2367  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.41 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0615204  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5417  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.66 
 
 		 298 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3805  cyclic nucleotide-binding  37.84 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4068  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2609  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2391  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6056  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4876  cyclic nucleotide-binding  37.34 
 
 		 317 aa  155  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6249  Crp/FNR family transcriptional regulator  40 
 
 		 281 aa  155  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5361  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.8 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1184  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.14 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2108  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.819689  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1230  Crp/FNR family transcriptional regulator  40 
 
 		 263 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8765  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.09 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.474033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6130  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.09 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4786  cyclic nucleotide-binding protein  37.73 
 
 		 243 aa  142  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3616  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.48 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3486  putative signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 243 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173486 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0604  cyclic nucleotide-binding protein  36.75 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1953  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4036  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 315 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0955  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3741  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.36 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3499  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 286 aa  118  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1854  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.191124  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0189  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 235 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0266  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 253 aa  115  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3367  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0414  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.766284  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0357  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2400  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0375093 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3844  cyclic nucleotide-binding protein  32.47 
 
 		 242 aa  112  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0196  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0367027  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0532  cyclic nucleotide-binding protein  31.25 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4040  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1734  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  hitchhiker  0.000773544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5658  cyclic nucleotide-binding protein  30.49 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5597  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.46 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0675352  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0997  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.21 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.63 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal  0.182435 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4822  cyclic nucleotide-binding protein  30.93 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5989  transcriptional regulator CRP family  32.98 
 
 		 257 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2201  transcriptional regulator  30.88 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.586423 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2705  cyclic nucleotide-binding protein  31.47 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.64 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.523077  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2575  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1153  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.61 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3568  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.11 
 
 		 242 aa  93.6  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0983  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2934  cyclic nucleotide-binding protein  31.12 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1275  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1787  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.75 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3865  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0447  transcriptional regulator  27.46 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00494896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0490  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.01 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0654  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0394  cyclic nucleotide-binding protein  26.15 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0638348  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0647  nitrogen fixation regulation protein fixk  25.45 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1993  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  22.48 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.238952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>