97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3052 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3052  short chain fatty acid transporter  100 
 
 		 457 aa  912    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0888  short chain fatty acid transporter  60.49 
 
 		 439 aa  548  1e-155  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2249  short chain fatty acid transporter  59.69 
 
 		 440 aa  540  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1137  short chain fatty acid transporter  53.83 
 
 		 462 aa  498  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534367 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3308  hypothetical protein  55.02 
 
 		 448 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3097  short-chain fatty acids transporter  54.79 
 
 		 448 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3356  hypothetical protein  54.79 
 
 		 448 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3000  short-chain fatty acids transporter  54.79 
 
 		 448 aa  490  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3110  hypothetical protein  54.79 
 
 		 448 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3315  hypothetical protein  54.79 
 
 		 448 aa  489  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3329  hypothetical protein  54.79 
 
 		 448 aa  490  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3033  short chain fatty acid transporter  54.79 
 
 		 448 aa  491  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.625274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3328  hypothetical protein  54.57 
 
 		 448 aa  488  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2108  short chain fatty acid transporter  53.88 
 
 		 448 aa  476  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.289141  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1391  Short-chain fatty acid transporter  53.01 
 
 		 443 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3088  short chain fatty acid transporter  54.36 
 
 		 436 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1445  short chain fatty acid transporter  52.49 
 
 		 435 aa  462  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2938  short chain fatty acid transporter  53.15 
 
 		 436 aa  463  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01176  hypothetical Short chain fatty acid transporter  54.07 
 
 		 435 aa  462  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.680659  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1201  short chain fatty acid transporter  53.73 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3234  short chain fatty acid transporter  53.04 
 
 		 451 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3091  short chain fatty acid transporter  53.48 
 
 		 451 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3081  short chain fatty acid transporter  53.48 
 
 		 451 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.45839  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1286  short chain fatty acid transporter  53.04 
 
 		 451 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.567744 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2886  short chain fatty acid transporter  53.42 
 
 		 442 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2982  short chain fatty acid transporter  52.88 
 
 		 442 aa  456  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1677  hypothetical protein  52.68 
 
 		 440 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121429  normal  0.563194 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2803  short chain fatty acid transporter  52.88 
 
 		 442 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3747  hypothetical protein  51.79 
 
 		 450 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4221  short chain fatty acid transporter  51.79 
 
 		 440 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545369  normal  0.396779 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4279  short chain fatty acid transporter  52.01 
 
 		 440 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0354483  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1427  short chain fatty acid transporter  48.43 
 
 		 440 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1435  short chain fatty acid transporter  48.43 
 
 		 440 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.203536  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02109  hypothetical protein  48.43 
 
 		 440 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2364  putative short chain fatty acid transporter  48.43 
 
 		 440 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02150  short chain fatty acid transporter  48.43 
 
 		 440 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.795271  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2372  putative short chain fatty acid transporter  48.43 
 
 		 440 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.608941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1708  short chain fatty acid transporter  50.23 
 
 		 446 aa  430  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0831  hypothetical protein  48.21 
 
 		 456 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627864  normal  0.0867852 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4680  short chain fatty acid transporter  43.37 
 
 		 445 aa  349  5e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556803  normal  0.668538 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1923  short-chain fatty acids transporter  42.19 
 
 		 455 aa  338  8e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3939  short chain fatty acid transporter  42.04 
 
 		 445 aa  332  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.506022  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3761  short chain fatty acid transporter  40.09 
 
 		 442 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0115875 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1419  short chain fatty acid transporter  40.85 
 
 		 434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.989346 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2419  short chain fatty acid transporter  39.69 
 
 		 464 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15960  short chain fatty acids transporter  42.21 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287757  normal  0.0635103 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1689  short chain fatty acid transporter  33.12 
 
 		 471 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.316692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3807  short chain fatty acid transporter  34.42 
 
 		 474 aa  222  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.164784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1381  Short chain fatty acid transporter  32.12 
 
 		 482 aa  208  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.789846  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0243  short chain fatty acid transporter  31.15 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3147  short chain fatty acid transporter  32.81 
 
 		 489 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3457  short-chain fatty acid transporter  31.54 
 
 		 472 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0648  short chain fatty acid transporter  31.17 
 
 		 479 aa  196  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5759  Short chain fatty acid transporter  33.77 
 
 		 482 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0613926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4199  short chain fatty acid transporter  32.21 
 
 		 492 aa  192  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0850906  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3239  Short chain fatty acid transporter  31.07 
 
 		 472 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.243579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4768  Short chain fatty acid transporter  32.4 
 
 		 472 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4736  short chain fatty acid transporter  32.52 
 
 		 491 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2232  short chain fatty acid transporter  31.16 
 
 		 474 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.606878  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2627  short chain fatty acid transporter  33.99 
 
 		 479 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.764911  normal  0.061315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2433  short chain fatty acid transporter  30.81 
 
 		 472 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2348  short chain fatty acid transporter  33.99 
 
 		 479 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.294076 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2304  short chain fatty acid transporter  33.66 
 
 		 479 aa  183  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856531  normal  0.0189751 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3646  short chain fatty acid transporter  29.65 
 
 		 478 aa  180  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.030585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38610  hypothetical protein  32.79 
 
 		 474 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.457227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6880  Short chain fatty acid transporter  30.2 
 
 		 483 aa  176  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0265966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3291  hypothetical protein  32.56 
 
 		 474 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3124  short-chain fatty acid transporter family protein  29.86 
 
 		 472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.04212  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2592  short chain fatty acid transporter  29.86 
 
 		 509 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2733  short chain fatty acid transporter  29.86 
 
 		 472 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33780  Short chain fatty acid transporter family protein  31.07 
 
 		 494 aa  160  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1354  hypothetical protein  31.2 
 
 		 492 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000651661  normal  0.856488 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2674  hypothetical protein  31.2 
 
 		 513 aa  53.1  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000012139  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1358  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  31.2 
 
 		 492 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126812  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02223  predicted inner membrane protein  31.2 
 
 		 506 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000247482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3438  hypothetical protein  31.2 
 
 		 513 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02183  hypothetical protein  31.2 
 
 		 506 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000257833  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2454  hypothetical protein  31.2 
 
 		 513 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2592  hypothetical protein  31.2 
 
 		 513 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000045044  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2448  hypothetical protein  31.2 
 
 		 513 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000669935  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2480  hypothetical protein  29.84 
 
 		 506 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.434803  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2688  hypothetical protein  29.84 
 
 		 506 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.831014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2580  hypothetical protein  29.84 
 
 		 506 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2525  hypothetical protein  29.84 
 
 		 506 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.449872 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2568  hypothetical protein  29.84 
 
 		 506 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.801671 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1005  hypothetical protein  25.32 
 
 		 502 aa  47.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2668  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  24.53 
 
 		 460 aa  46.6  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1853  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  36.23 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000744962  normal  0.0199441 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0028  AbgT putative transporter  35.94 
 
 		 512 aa  45.1  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.790153  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0018  AbgT putative transporter  38.33 
 
 		 511 aa  45.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1143  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  41.18 
 
 		 484 aa  45.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.171784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0815  hypothetical protein  41.94 
 
 		 462 aa  44.7  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000488544  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4261  C4-dicarboxylate anaerobic carrier-like protein  43.75 
 
 		 460 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0064  AbgT putative transporter  40.32 
 
 		 518 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000877421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2048  hypothetical protein  34.92 
 
 		 481 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0776324  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1985  hypothetical protein  34.92 
 
 		 481 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2328  efflux pump component MtrF  34.57 
 
 		 516 aa  43.1  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.25696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>