71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2364 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1435  short chain fatty acid transporter  100 
 
 		 440 aa  880    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.203536  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02109  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  880    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853182  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02150  short chain fatty acid transporter  100 
 
 		 440 aa  880    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.795271  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2364  putative short chain fatty acid transporter  100 
 
 		 440 aa  880    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1427  short chain fatty acid transporter  100 
 
 		 440 aa  880    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2372  putative short chain fatty acid transporter  100 
 
 		 440 aa  880    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.608941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4221  short chain fatty acid transporter  67.05 
 
 		 440 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545369  normal  0.396779 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4279  short chain fatty acid transporter  67.05 
 
 		 440 aa  598  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0354483  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3747  hypothetical protein  66.82 
 
 		 450 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0831  hypothetical protein  66.29 
 
 		 456 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627864  normal  0.0867852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1677  hypothetical protein  66.59 
 
 		 440 aa  595  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121429  normal  0.563194 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2249  short chain fatty acid transporter  48.64 
 
 		 440 aa  459  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0888  short chain fatty acid transporter  49.88 
 
 		 439 aa  451  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3052  short chain fatty acid transporter  48.43 
 
 		 457 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1391  Short-chain fatty acid transporter  45.17 
 
 		 443 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3315  hypothetical protein  46.05 
 
 		 448 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3308  hypothetical protein  46.28 
 
 		 448 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1201  short chain fatty acid transporter  45.09 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3097  short-chain fatty acids transporter  46.28 
 
 		 448 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3033  short chain fatty acid transporter  46.74 
 
 		 448 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.625274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3328  hypothetical protein  46.05 
 
 		 448 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3329  hypothetical protein  46.05 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2982  short chain fatty acid transporter  45.6 
 
 		 442 aa  391  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3110  hypothetical protein  46.05 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2886  short chain fatty acid transporter  45.37 
 
 		 442 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3000  short-chain fatty acids transporter  46.28 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3356  hypothetical protein  46.05 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2803  short chain fatty acid transporter  45.15 
 
 		 442 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3081  short chain fatty acid transporter  43.61 
 
 		 451 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.45839  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3088  short chain fatty acid transporter  44.55 
 
 		 436 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2938  short chain fatty acid transporter  44.29 
 
 		 436 aa  385  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1286  short chain fatty acid transporter  43.71 
 
 		 451 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.567744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1137  short chain fatty acid transporter  46.38 
 
 		 462 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3091  short chain fatty acid transporter  43.71 
 
 		 451 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3234  short chain fatty acid transporter  43.14 
 
 		 451 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2108  short chain fatty acid transporter  44.85 
 
 		 448 aa  378  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.289141  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1445  short chain fatty acid transporter  42.17 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01176  hypothetical Short chain fatty acid transporter  45.14 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.680659  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1708  short chain fatty acid transporter  43.05 
 
 		 446 aa  355  1e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4680  short chain fatty acid transporter  38.67 
 
 		 445 aa  341  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556803  normal  0.668538 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3939  short chain fatty acid transporter  41.28 
 
 		 445 aa  324  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.506022  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3761  short chain fatty acid transporter  39.36 
 
 		 442 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0115875 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1419  short chain fatty acid transporter  41.59 
 
 		 434 aa  317  3e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.989346 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1923  short-chain fatty acids transporter  38.89 
 
 		 455 aa  309  5e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2419  short chain fatty acid transporter  38.5 
 
 		 464 aa  293  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15960  short chain fatty acids transporter  40.19 
 
 		 441 aa  281  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287757  normal  0.0635103 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1381  Short chain fatty acid transporter  32.76 
 
 		 482 aa  222  9e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.789846  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1689  short chain fatty acid transporter  31.72 
 
 		 471 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.316692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3807  short chain fatty acid transporter  33.26 
 
 		 474 aa  212  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.164784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2433  short chain fatty acid transporter  32.73 
 
 		 472 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4199  short chain fatty acid transporter  33.94 
 
 		 492 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0850906  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3457  short-chain fatty acid transporter  31.99 
 
 		 472 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0648  short chain fatty acid transporter  31 
 
 		 479 aa  199  7e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4768  Short chain fatty acid transporter  32.81 
 
 		 472 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2232  short chain fatty acid transporter  33.72 
 
 		 474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.606878  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3124  short-chain fatty acid transporter family protein  33.18 
 
 		 472 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.04212  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3239  Short chain fatty acid transporter  32.06 
 
 		 472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.243579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2733  short chain fatty acid transporter  33.18 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2592  short chain fatty acid transporter  33.79 
 
 		 509 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5759  Short chain fatty acid transporter  32.35 
 
 		 482 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0613926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3147  short chain fatty acid transporter  33.41 
 
 		 489 aa  196  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6880  Short chain fatty acid transporter  32.57 
 
 		 483 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0265966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3646  short chain fatty acid transporter  32.65 
 
 		 478 aa  190  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.030585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0243  short chain fatty acid transporter  32.39 
 
 		 478 aa  189  9e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2627  short chain fatty acid transporter  33.18 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.764911  normal  0.061315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2304  short chain fatty acid transporter  32.51 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856531  normal  0.0189751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2348  short chain fatty acid transporter  33.18 
 
 		 479 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.294076 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38610  hypothetical protein  33.18 
 
 		 474 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.457227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3291  hypothetical protein  32.96 
 
 		 474 aa  183  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4736  short chain fatty acid transporter  32.58 
 
 		 491 aa  179  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33780  Short chain fatty acid transporter family protein  30.82 
 
 		 494 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>