93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1419 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1419  short chain fatty acid transporter  100 
 
 
434 aa  866    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.989346 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0888  short chain fatty acid transporter  44.93 
 
 
439 aa  370  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2249  short chain fatty acid transporter  45.06 
 
 
440 aa  358  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2938  short chain fatty acid transporter  40.6 
 
 
436 aa  346  4e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01176  hypothetical Short chain fatty acid transporter  44.21 
 
 
435 aa  345  7e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.680659  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3088  short chain fatty acid transporter  45.05 
 
 
436 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1445  short chain fatty acid transporter  43.13 
 
 
435 aa  344  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1391  Short-chain fatty acid transporter  43.82 
 
 
443 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2886  short chain fatty acid transporter  43.93 
 
 
442 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2982  short chain fatty acid transporter  43.46 
 
 
442 aa  330  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2803  short chain fatty acid transporter  44.1 
 
 
442 aa  329  6e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3234  short chain fatty acid transporter  43.58 
 
 
451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3081  short chain fatty acid transporter  43.15 
 
 
451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.45839  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2372  putative short chain fatty acid transporter  41.59 
 
 
440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.608941  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1427  short chain fatty acid transporter  41.59 
 
 
440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2364  putative short chain fatty acid transporter  41.59 
 
 
440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3091  short chain fatty acid transporter  43.12 
 
 
451 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3052  short chain fatty acid transporter  41.07 
 
 
457 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1286  short chain fatty acid transporter  43.12 
 
 
451 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.567744 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02150  short chain fatty acid transporter  41.59 
 
 
440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.795271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1435  short chain fatty acid transporter  41.59 
 
 
440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.203536  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02109  hypothetical protein  41.59 
 
 
440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853182  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1677  hypothetical protein  41.36 
 
 
440 aa  325  7e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121429  normal  0.563194 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1201  short chain fatty acid transporter  43.19 
 
 
447 aa  324  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4279  short chain fatty acid transporter  41.14 
 
 
440 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0354483  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4221  short chain fatty acid transporter  40.91 
 
 
440 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545369  normal  0.396779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1137  short chain fatty acid transporter  42.47 
 
 
462 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.534367 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3747  hypothetical protein  40.45 
 
 
450 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243526  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1708  short chain fatty acid transporter  41.29 
 
 
446 aa  314  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3097  short-chain fatty acids transporter  39.91 
 
 
448 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3000  short-chain fatty acids transporter  39.91 
 
 
448 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3329  hypothetical protein  39.91 
 
 
448 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3110  hypothetical protein  39.91 
 
 
448 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3356  hypothetical protein  39.91 
 
 
448 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3328  hypothetical protein  39.69 
 
 
448 aa  306  7e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3033  short chain fatty acid transporter  39.42 
 
 
448 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.625274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3315  hypothetical protein  39.69 
 
 
448 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3308  hypothetical protein  40.04 
 
 
448 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0831  hypothetical protein  40.73 
 
 
456 aa  299  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627864  normal  0.0867852 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2108  short chain fatty acid transporter  39.59 
 
 
448 aa  295  8e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.289141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1923  short-chain fatty acids transporter  41.84 
 
 
455 aa  295  9e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4680  short chain fatty acid transporter  36.34 
 
 
445 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556803  normal  0.668538 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15960  short chain fatty acids transporter  38.43 
 
 
441 aa  278  1e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287757  normal  0.0635103 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3939  short chain fatty acid transporter  37.47 
 
 
445 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.506022  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3761  short chain fatty acid transporter  36.84 
 
 
442 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0115875 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2419  short chain fatty acid transporter  37.58 
 
 
464 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3807  short chain fatty acid transporter  34.04 
 
 
474 aa  206  7e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.164784  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1381  Short chain fatty acid transporter  33.18 
 
 
482 aa  193  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.789846  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0648  short chain fatty acid transporter  31.75 
 
 
479 aa  187  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1689  short chain fatty acid transporter  29.98 
 
 
471 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.316692 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5759  Short chain fatty acid transporter  32.02 
 
 
482 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0613926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4199  short chain fatty acid transporter  33.75 
 
 
492 aa  179  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0850906  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4768  Short chain fatty acid transporter  32.05 
 
 
472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3457  short-chain fatty acid transporter  30.12 
 
 
472 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3239  Short chain fatty acid transporter  30.66 
 
 
472 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.243579  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3147  short chain fatty acid transporter  31.04 
 
 
489 aa  169  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2304  short chain fatty acid transporter  31.58 
 
 
479 aa  168  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856531  normal  0.0189751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4736  short chain fatty acid transporter  30.73 
 
 
491 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2232  short chain fatty acid transporter  29.67 
 
 
474 aa  166  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.606878  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0243  short chain fatty acid transporter  31.69 
 
 
478 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2433  short chain fatty acid transporter  30.11 
 
 
472 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2627  short chain fatty acid transporter  31.75 
 
 
479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.764911  normal  0.061315 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3646  short chain fatty acid transporter  30.93 
 
 
478 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.030585  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2348  short chain fatty acid transporter  31.75 
 
 
479 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.294076 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38610  hypothetical protein  30.3 
 
 
474 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.457227  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2592  short chain fatty acid transporter  29.81 
 
 
509 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3124  short-chain fatty acid transporter family protein  29.59 
 
 
472 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.04212  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6880  Short chain fatty acid transporter  29.77 
 
 
483 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0265966  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2733  short chain fatty acid transporter  29.59 
 
 
472 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3291  hypothetical protein  29.77 
 
 
474 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33780  Short chain fatty acid transporter family protein  31.74 
 
 
494 aa  139  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368969  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0018  AbgT putative transporter  37.88 
 
 
511 aa  47.8  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0064  AbgT putative transporter  42.59 
 
 
518 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000877421  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2674  hypothetical protein  23.81 
 
 
513 aa  47  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000012139  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2328  efflux pump component MtrF  25.46 
 
 
516 aa  47  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.25696  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1354  hypothetical protein  24 
 
 
492 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000651661  normal  0.856488 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2448  hypothetical protein  24 
 
 
513 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000669935  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02223  predicted inner membrane protein  24 
 
 
506 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000247482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02183  hypothetical protein  24 
 
 
506 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000257833  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2592  hypothetical protein  24 
 
 
513 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000045044  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1358  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  24 
 
 
492 aa  46.6  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126812  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1143  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  47.06 
 
 
484 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.171784  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01760  hypothetical protein  32.26 
 
 
500 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2454  hypothetical protein  24 
 
 
513 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219916  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3438  hypothetical protein  24 
 
 
513 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1005  hypothetical protein  41.43 
 
 
502 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1985  hypothetical protein  35.53 
 
 
481 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1853  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  30.3 
 
 
461 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000744962  normal  0.0199441 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2048  hypothetical protein  35.53 
 
 
481 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0776324  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2000  hypothetical protein  35.53 
 
 
481 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0420164  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1145  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  37.14 
 
 
464 aa  43.9  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.400945  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2339  hypothetical protein  34.21 
 
 
481 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00278972  normal  0.0466746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4261  C4-dicarboxylate anaerobic carrier-like protein  38.18 
 
 
460 aa  43.1  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>