77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1445 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01176  hypothetical Short chain fatty acid transporter  81.38 
 
 		 435 aa  701    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.680659  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1445  short chain fatty acid transporter  100 
 
 		 435 aa  855    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3088  short chain fatty acid transporter  73.09 
 
 		 436 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1391  Short-chain fatty acid transporter  71.4 
 
 		 443 aa  600  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2938  short chain fatty acid transporter  68.58 
 
 		 436 aa  600  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2982  short chain fatty acid transporter  72.11 
 
 		 442 aa  592  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2886  short chain fatty acid transporter  72.34 
 
 		 442 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1201  short chain fatty acid transporter  71.52 
 
 		 447 aa  588  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3234  short chain fatty acid transporter  71.33 
 
 		 451 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1286  short chain fatty acid transporter  71.11 
 
 		 451 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.567744 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2803  short chain fatty acid transporter  72.11 
 
 		 442 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3091  short chain fatty acid transporter  71.11 
 
 		 451 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3081  short chain fatty acid transporter  71.18 
 
 		 451 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.45839  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0888  short chain fatty acid transporter  58.47 
 
 		 439 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3052  short chain fatty acid transporter  52.49 
 
 		 457 aa  462  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2249  short chain fatty acid transporter  51.5 
 
 		 440 aa  462  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1137  short chain fatty acid transporter  47.51 
 
 		 462 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534367 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3356  hypothetical protein  46.1 
 
 		 448 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3329  hypothetical protein  46.1 
 
 		 448 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3315  hypothetical protein  45.76 
 
 		 448 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3033  short chain fatty acid transporter  46.21 
 
 		 448 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.625274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3308  hypothetical protein  45.98 
 
 		 448 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2108  short chain fatty acid transporter  44.87 
 
 		 448 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.289141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3110  hypothetical protein  46.1 
 
 		 448 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3097  short-chain fatty acids transporter  45.54 
 
 		 448 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3000  short-chain fatty acids transporter  45.88 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3328  hypothetical protein  45.88 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1708  short chain fatty acid transporter  46.26 
 
 		 446 aa  388  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1677  hypothetical protein  45.83 
 
 		 440 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121429  normal  0.563194 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3747  hypothetical protein  44.68 
 
 		 450 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4279  short chain fatty acid transporter  45.85 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0354483  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4221  short chain fatty acid transporter  44.91 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545369  normal  0.396779 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1435  short chain fatty acid transporter  42.17 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.203536  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02109  hypothetical protein  42.17 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2364  putative short chain fatty acid transporter  42.17 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1427  short chain fatty acid transporter  42.17 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2372  putative short chain fatty acid transporter  42.17 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.608941  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02150  short chain fatty acid transporter  42.17 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.795271  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4680  short chain fatty acid transporter  42.4 
 
 		 445 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556803  normal  0.668538 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0831  hypothetical protein  42.29 
 
 		 456 aa  349  6e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627864  normal  0.0867852 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1923  short-chain fatty acids transporter  42.95 
 
 		 455 aa  349  7e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3939  short chain fatty acid transporter  41 
 
 		 445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.506022  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1419  short chain fatty acid transporter  42.89 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.989346 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3761  short chain fatty acid transporter  41.44 
 
 		 442 aa  333  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0115875 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15960  short chain fatty acids transporter  41.19 
 
 		 441 aa  292  6e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287757  normal  0.0635103 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2419  short chain fatty acid transporter  34.64 
 
 		 464 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3807  short chain fatty acid transporter  35.28 
 
 		 474 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.164784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0648  short chain fatty acid transporter  32.81 
 
 		 479 aa  217  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1689  short chain fatty acid transporter  32.81 
 
 		 471 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.316692 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5759  Short chain fatty acid transporter  34.15 
 
 		 482 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0613926  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3646  short chain fatty acid transporter  32.5 
 
 		 478 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.030585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1381  Short chain fatty acid transporter  33.11 
 
 		 482 aa  211  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.789846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3147  short chain fatty acid transporter  35.31 
 
 		 489 aa  210  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3457  short-chain fatty acid transporter  32.88 
 
 		 472 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4736  short chain fatty acid transporter  34.62 
 
 		 491 aa  201  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6880  Short chain fatty acid transporter  32.66 
 
 		 483 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0265966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4768  Short chain fatty acid transporter  32.79 
 
 		 472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3239  Short chain fatty acid transporter  32.57 
 
 		 472 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.243579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2433  short chain fatty acid transporter  31.68 
 
 		 472 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2304  short chain fatty acid transporter  33.18 
 
 		 479 aa  192  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856531  normal  0.0189751 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0243  short chain fatty acid transporter  32.35 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3124  short-chain fatty acid transporter family protein  32.23 
 
 		 472 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.04212  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2348  short chain fatty acid transporter  33.93 
 
 		 479 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.294076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2733  short chain fatty acid transporter  32.39 
 
 		 472 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2627  short chain fatty acid transporter  33.11 
 
 		 479 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.764911  normal  0.061315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2592  short chain fatty acid transporter  32.08 
 
 		 509 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4199  short chain fatty acid transporter  32.23 
 
 		 492 aa  189  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0850906  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2232  short chain fatty acid transporter  31.92 
 
 		 474 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.606878  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38610  hypothetical protein  34.03 
 
 		 474 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.457227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33780  Short chain fatty acid transporter family protein  32.65 
 
 		 494 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368969  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3291  hypothetical protein  33.33 
 
 		 474 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01760  hypothetical protein  27.89 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1143  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  26.5 
 
 		 484 aa  47.4  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.171784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0064  AbgT putative transporter  41.27 
 
 		 518 aa  47  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000877421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1853  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  26.39 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000744962  normal  0.0199441 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0018  AbgT putative transporter  28.57 
 
 		 511 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2668  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  42.11 
 
 		 460 aa  43.9  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>