96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1708 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1708  short chain fatty acid transporter  100 
 
 		 446 aa  875    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1137  short chain fatty acid transporter  60.09 
 
 		 462 aa  549  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534367 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0888  short chain fatty acid transporter  52.16 
 
 		 439 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3097  short-chain fatty acids transporter  49.78 
 
 		 448 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3033  short chain fatty acid transporter  49.78 
 
 		 448 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.625274  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3052  short chain fatty acid transporter  50.68 
 
 		 457 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3308  hypothetical protein  49.21 
 
 		 448 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3110  hypothetical protein  49.55 
 
 		 448 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3000  short-chain fatty acids transporter  49.55 
 
 		 448 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405946  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3315  hypothetical protein  49.55 
 
 		 448 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2108  short chain fatty acid transporter  49.66 
 
 		 448 aa  435  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.289141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3328  hypothetical protein  49.55 
 
 		 448 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3329  hypothetical protein  49.55 
 
 		 448 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3356  hypothetical protein  49.55 
 
 		 448 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2249  short chain fatty acid transporter  47.98 
 
 		 440 aa  408  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1445  short chain fatty acid transporter  46.26 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2938  short chain fatty acid transporter  46.5 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01176  hypothetical Short chain fatty acid transporter  47.62 
 
 		 435 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.680659  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1391  Short-chain fatty acid transporter  48.22 
 
 		 443 aa  388  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2803  short chain fatty acid transporter  48.32 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2886  short chain fatty acid transporter  48.77 
 
 		 442 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2982  short chain fatty acid transporter  48.77 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3088  short chain fatty acid transporter  47.87 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3091  short chain fatty acid transporter  47.48 
 
 		 451 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3081  short chain fatty acid transporter  48.03 
 
 		 451 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.45839  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3234  short chain fatty acid transporter  48.03 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1286  short chain fatty acid transporter  47.48 
 
 		 451 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.567744 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1201  short chain fatty acid transporter  48.01 
 
 		 447 aa  371  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2364  putative short chain fatty acid transporter  42.22 
 
 		 440 aa  362  6e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02109  hypothetical protein  42.22 
 
 		 440 aa  362  6e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1427  short chain fatty acid transporter  42.22 
 
 		 440 aa  362  6e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2372  putative short chain fatty acid transporter  42.22 
 
 		 440 aa  362  6e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.608941  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02150  short chain fatty acid transporter  42.22 
 
 		 440 aa  362  6e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.795271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1435  short chain fatty acid transporter  42.22 
 
 		 440 aa  362  6e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.203536  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1677  hypothetical protein  43.33 
 
 		 440 aa  342  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121429  normal  0.563194 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4279  short chain fatty acid transporter  43.11 
 
 		 440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0354483  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3747  hypothetical protein  42.63 
 
 		 450 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0831  hypothetical protein  43.91 
 
 		 456 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627864  normal  0.0867852 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4221  short chain fatty acid transporter  42.67 
 
 		 440 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545369  normal  0.396779 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4680  short chain fatty acid transporter  39.41 
 
 		 445 aa  316  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556803  normal  0.668538 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1419  short chain fatty acid transporter  41.29 
 
 		 434 aa  313  4.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.989346 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3939  short chain fatty acid transporter  40.27 
 
 		 445 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.506022  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3761  short chain fatty acid transporter  39.59 
 
 		 442 aa  293  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0115875 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1923  short-chain fatty acids transporter  41.43 
 
 		 455 aa  292  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2419  short chain fatty acid transporter  37.79 
 
 		 464 aa  278  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15960  short chain fatty acids transporter  40.95 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287757  normal  0.0635103 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1381  Short chain fatty acid transporter  31.31 
 
 		 482 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.789846  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3807  short chain fatty acid transporter  30.89 
 
 		 474 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.164784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3646  short chain fatty acid transporter  28.76 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.030585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0648  short chain fatty acid transporter  29.71 
 
 		 479 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1689  short chain fatty acid transporter  28.08 
 
 		 471 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.316692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3147  short chain fatty acid transporter  31.31 
 
 		 489 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3457  short-chain fatty acid transporter  28.15 
 
 		 472 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5759  Short chain fatty acid transporter  29.55 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0613926  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2232  short chain fatty acid transporter  29.38 
 
 		 474 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.606878  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0243  short chain fatty acid transporter  29.48 
 
 		 478 aa  158  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2433  short chain fatty acid transporter  28.5 
 
 		 472 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4199  short chain fatty acid transporter  31.59 
 
 		 492 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0850906  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4768  Short chain fatty acid transporter  28.99 
 
 		 472 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3239  Short chain fatty acid transporter  28.41 
 
 		 472 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.243579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3124  short-chain fatty acid transporter family protein  28.97 
 
 		 472 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.04212  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2627  short chain fatty acid transporter  32.7 
 
 		 479 aa  152  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.764911  normal  0.061315 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6880  Short chain fatty acid transporter  30.05 
 
 		 483 aa  152  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0265966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2733  short chain fatty acid transporter  28.97 
 
 		 472 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4736  short chain fatty acid transporter  31.69 
 
 		 491 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2592  short chain fatty acid transporter  28.97 
 
 		 509 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2348  short chain fatty acid transporter  32.7 
 
 		 479 aa  150  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.294076 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2304  short chain fatty acid transporter  32.7 
 
 		 479 aa  150  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856531  normal  0.0189751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38610  hypothetical protein  29.95 
 
 		 474 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.457227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3291  hypothetical protein  29.73 
 
 		 474 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33780  Short chain fatty acid transporter family protein  27.29 
 
 		 494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368969  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2668  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  34.95 
 
 		 460 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1005  hypothetical protein  40.74 
 
 		 502 aa  46.6  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1853  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  38.18 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000744962  normal  0.0199441 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2674  hypothetical protein  26.9 
 
 		 513 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000012139  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02183  hypothetical protein  26.9 
 
 		 506 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000257833  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4261  C4-dicarboxylate anaerobic carrier-like protein  40 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3438  hypothetical protein  26.9 
 
 		 513 aa  45.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02223  predicted inner membrane protein  26.9 
 
 		 506 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000247482  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1354  hypothetical protein  26.9 
 
 		 492 aa  44.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000651661  normal  0.856488 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1358  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  26.9 
 
 		 492 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126812  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2448  hypothetical protein  26.9 
 
 		 513 aa  45.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000669935  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2592  hypothetical protein  26.9 
 
 		 513 aa  45.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000045044  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3120  AbgT putative transporter  41.18 
 
 		 520 aa  44.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2454  hypothetical protein  26.9 
 
 		 513 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3673  AbgT putative transporter  25.48 
 
 		 518 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0064  AbgT putative transporter  39.62 
 
 		 518 aa  44.7  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000877421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2480  hypothetical protein  35.29 
 
 		 506 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.434803  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2525  hypothetical protein  35.29 
 
 		 506 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.449872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1678  hypothetical protein  30.69 
 
 		 514 aa  44.3  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113687  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2580  hypothetical protein  35.29 
 
 		 506 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2568  hypothetical protein  35.29 
 
 		 506 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.801671 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2688  hypothetical protein  35.29 
 
 		 506 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.831014 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3423  transporter  41.82 
 
 		 515 aa  43.9  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1143  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  39.22 
 
 		 484 aa  43.1  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.171784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3449  transporter  39.22 
 
 		 512 aa  43.1  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>