71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4680 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4680  short chain fatty acid transporter  100 
 
 		 445 aa  888    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556803  normal  0.668538 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3761  short chain fatty acid transporter  74.15 
 
 		 442 aa  636    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0115875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3939  short chain fatty acid transporter  73.08 
 
 		 445 aa  622  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.506022  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2249  short chain fatty acid transporter  44.09 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1391  Short-chain fatty acid transporter  44.27 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2803  short chain fatty acid transporter  44.37 
 
 		 442 aa  359  5e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2982  short chain fatty acid transporter  44.37 
 
 		 442 aa  359  6e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0888  short chain fatty acid transporter  42.3 
 
 		 439 aa  359  6e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2886  short chain fatty acid transporter  43.6 
 
 		 442 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3088  short chain fatty acid transporter  43.15 
 
 		 436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3081  short chain fatty acid transporter  44.03 
 
 		 451 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.45839  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1445  short chain fatty acid transporter  42.4 
 
 		 435 aa  350  3e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3091  short chain fatty acid transporter  43.9 
 
 		 451 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3052  short chain fatty acid transporter  43.37 
 
 		 457 aa  349  5e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1286  short chain fatty acid transporter  43.9 
 
 		 451 aa  349  7e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.567744 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2938  short chain fatty acid transporter  43.09 
 
 		 436 aa  348  9e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3234  short chain fatty acid transporter  43.58 
 
 		 451 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1201  short chain fatty acid transporter  43.78 
 
 		 447 aa  342  7e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1427  short chain fatty acid transporter  38.67 
 
 		 440 aa  341  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1435  short chain fatty acid transporter  38.67 
 
 		 440 aa  341  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.203536  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02109  hypothetical protein  38.67 
 
 		 440 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2372  putative short chain fatty acid transporter  38.67 
 
 		 440 aa  341  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.608941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2364  putative short chain fatty acid transporter  38.67 
 
 		 440 aa  341  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02150  short chain fatty acid transporter  38.67 
 
 		 440 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.795271  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4279  short chain fatty acid transporter  40.63 
 
 		 440 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0354483  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1677  hypothetical protein  40.32 
 
 		 440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121429  normal  0.563194 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01176  hypothetical Short chain fatty acid transporter  41.11 
 
 		 435 aa  340  4e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.680659  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3747  hypothetical protein  40.32 
 
 		 450 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4221  short chain fatty acid transporter  40.32 
 
 		 440 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545369  normal  0.396779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1137  short chain fatty acid transporter  40.41 
 
 		 462 aa  317  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534367 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1708  short chain fatty acid transporter  39.41 
 
 		 446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3097  short-chain fatty acids transporter  37.5 
 
 		 448 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3033  short chain fatty acid transporter  37.73 
 
 		 448 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.625274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3315  hypothetical protein  37.27 
 
 		 448 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3110  hypothetical protein  37.27 
 
 		 448 aa  306  6e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3356  hypothetical protein  37.27 
 
 		 448 aa  306  6e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3329  hypothetical protein  37.27 
 
 		 448 aa  306  6e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3328  hypothetical protein  37.27 
 
 		 448 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3000  short-chain fatty acids transporter  37.27 
 
 		 448 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3308  hypothetical protein  36.82 
 
 		 448 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0831  hypothetical protein  36.43 
 
 		 456 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627864  normal  0.0867852 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2108  short chain fatty acid transporter  38.02 
 
 		 448 aa  300  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.289141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1923  short-chain fatty acids transporter  35.91 
 
 		 455 aa  290  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1419  short chain fatty acid transporter  36.11 
 
 		 434 aa  273  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.989346 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15960  short chain fatty acids transporter  34.3 
 
 		 441 aa  257  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287757  normal  0.0635103 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2419  short chain fatty acid transporter  33.63 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1689  short chain fatty acid transporter  31.96 
 
 		 471 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.316692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3807  short chain fatty acid transporter  30 
 
 		 474 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.164784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1381  Short chain fatty acid transporter  30.32 
 
 		 482 aa  169  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.789846  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3646  short chain fatty acid transporter  28.54 
 
 		 478 aa  168  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.030585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5759  Short chain fatty acid transporter  29.91 
 
 		 482 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0613926  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2232  short chain fatty acid transporter  28.83 
 
 		 474 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.606878  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0648  short chain fatty acid transporter  26.77 
 
 		 479 aa  157  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3147  short chain fatty acid transporter  28.05 
 
 		 489 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4199  short chain fatty acid transporter  28.79 
 
 		 492 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0850906  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3239  Short chain fatty acid transporter  27.31 
 
 		 472 aa  153  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.243579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3457  short-chain fatty acid transporter  27.08 
 
 		 472 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4768  Short chain fatty acid transporter  26.96 
 
 		 472 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6880  Short chain fatty acid transporter  27.98 
 
 		 483 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0265966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2627  short chain fatty acid transporter  27.56 
 
 		 479 aa  151  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.764911  normal  0.061315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2348  short chain fatty acid transporter  27.56 
 
 		 479 aa  150  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.294076 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2433  short chain fatty acid transporter  29.1 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2304  short chain fatty acid transporter  28.44 
 
 		 479 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856531  normal  0.0189751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4736  short chain fatty acid transporter  28.34 
 
 		 491 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3124  short-chain fatty acid transporter family protein  27.57 
 
 		 472 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.04212  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2733  short chain fatty acid transporter  27.34 
 
 		 472 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2592  short chain fatty acid transporter  27.57 
 
 		 509 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0243  short chain fatty acid transporter  26.76 
 
 		 478 aa  142  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38610  hypothetical protein  28.83 
 
 		 474 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.457227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3291  hypothetical protein  29.2 
 
 		 474 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33780  Short chain fatty acid transporter family protein  32 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>