79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_15960 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_15960  short chain fatty acids transporter  100 
 
 		 441 aa  858    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287757  normal  0.0635103 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0888  short chain fatty acid transporter  44.72 
 
 		 439 aa  350  4e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2249  short chain fatty acid transporter  42.86 
 
 		 440 aa  328  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3052  short chain fatty acid transporter  42.21 
 
 		 457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1445  short chain fatty acid transporter  41.19 
 
 		 435 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2938  short chain fatty acid transporter  41.67 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1391  Short-chain fatty acid transporter  41 
 
 		 443 aa  300  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1137  short chain fatty acid transporter  43.37 
 
 		 462 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534367 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01176  hypothetical Short chain fatty acid transporter  41.61 
 
 		 435 aa  297  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.680659  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1435  short chain fatty acid transporter  40.19 
 
 		 440 aa  296  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.203536  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2372  putative short chain fatty acid transporter  40.19 
 
 		 440 aa  296  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.608941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1427  short chain fatty acid transporter  40.19 
 
 		 440 aa  296  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2364  putative short chain fatty acid transporter  40.19 
 
 		 440 aa  296  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02150  short chain fatty acid transporter  40.19 
 
 		 440 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.795271  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02109  hypothetical protein  40.19 
 
 		 440 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853182  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3088  short chain fatty acid transporter  41.16 
 
 		 436 aa  292  6e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2982  short chain fatty acid transporter  40.64 
 
 		 442 aa  289  6e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2886  short chain fatty acid transporter  40.64 
 
 		 442 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3356  hypothetical protein  39.14 
 
 		 448 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3110  hypothetical protein  39.14 
 
 		 448 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3329  hypothetical protein  39.14 
 
 		 448 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3234  short chain fatty acid transporter  40.53 
 
 		 451 aa  286  7e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1677  hypothetical protein  42.14 
 
 		 440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121429  normal  0.563194 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3033  short chain fatty acid transporter  39.14 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.625274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1923  short-chain fatty acids transporter  39.21 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4279  short chain fatty acid transporter  41.97 
 
 		 440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0354483  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3097  short-chain fatty acids transporter  38.91 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3091  short chain fatty acid transporter  40.94 
 
 		 451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3000  short-chain fatty acids transporter  38.91 
 
 		 448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1286  short chain fatty acid transporter  40.53 
 
 		 451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.567744 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3081  short chain fatty acid transporter  40.94 
 
 		 451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.45839  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2803  short chain fatty acid transporter  40.09 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3747  hypothetical protein  42.14 
 
 		 450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4221  short chain fatty acid transporter  42.14 
 
 		 440 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545369  normal  0.396779 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3328  hypothetical protein  38.91 
 
 		 448 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3308  hypothetical protein  38.69 
 
 		 448 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3315  hypothetical protein  38.69 
 
 		 448 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1201  short chain fatty acid transporter  40.63 
 
 		 447 aa  280  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1419  short chain fatty acid transporter  38.62 
 
 		 434 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.989346 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2108  short chain fatty acid transporter  38.01 
 
 		 448 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.289141  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4680  short chain fatty acid transporter  34.3 
 
 		 445 aa  269  8.999999999999999e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556803  normal  0.668538 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0831  hypothetical protein  39.81 
 
 		 456 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627864  normal  0.0867852 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1708  short chain fatty acid transporter  40.95 
 
 		 446 aa  266  5e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3761  short chain fatty acid transporter  35.48 
 
 		 442 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0115875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3939  short chain fatty acid transporter  35.52 
 
 		 445 aa  259  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.506022  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2419  short chain fatty acid transporter  34.72 
 
 		 464 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1689  short chain fatty acid transporter  32.52 
 
 		 471 aa  212  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.316692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3807  short chain fatty acid transporter  32.79 
 
 		 474 aa  184  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.164784  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3457  short-chain fatty acid transporter  28.74 
 
 		 472 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5759  Short chain fatty acid transporter  29.91 
 
 		 482 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0613926  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4768  Short chain fatty acid transporter  28.51 
 
 		 472 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2433  short chain fatty acid transporter  28.57 
 
 		 472 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0648  short chain fatty acid transporter  29.3 
 
 		 479 aa  153  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3239  Short chain fatty acid transporter  28.7 
 
 		 472 aa  153  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.243579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3646  short chain fatty acid transporter  29.35 
 
 		 478 aa  153  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.030585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2232  short chain fatty acid transporter  31.21 
 
 		 474 aa  152  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.606878  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38610  hypothetical protein  29.59 
 
 		 474 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.457227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2733  short chain fatty acid transporter  29.51 
 
 		 472 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3124  short-chain fatty acid transporter family protein  29.51 
 
 		 472 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.04212  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2592  short chain fatty acid transporter  29.51 
 
 		 509 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3147  short chain fatty acid transporter  30.58 
 
 		 489 aa  149  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3291  hypothetical protein  29.25 
 
 		 474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0243  short chain fatty acid transporter  30.63 
 
 		 478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2304  short chain fatty acid transporter  29.85 
 
 		 479 aa  143  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856531  normal  0.0189751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4199  short chain fatty acid transporter  30.05 
 
 		 492 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0850906  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2627  short chain fatty acid transporter  30.9 
 
 		 479 aa  142  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.764911  normal  0.061315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4736  short chain fatty acid transporter  29.08 
 
 		 491 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2348  short chain fatty acid transporter  30.9 
 
 		 479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.294076 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6880  Short chain fatty acid transporter  30.07 
 
 		 483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0265966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33780  Short chain fatty acid transporter family protein  30.29 
 
 		 494 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368969  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1381  Short chain fatty acid transporter  27.27 
 
 		 482 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.789846  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1143  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  45.1 
 
 		 484 aa  47  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.171784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2668  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  30.77 
 
 		 460 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0199  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  39.66 
 
 		 505 aa  44.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4261  C4-dicarboxylate anaerobic carrier-like protein  36.36 
 
 		 460 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1005  hypothetical protein  42.03 
 
 		 502 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1853  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  38.46 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000744962  normal  0.0199441 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01760  hypothetical protein  45.1 
 
 		 500 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000044  membrane protein  39.66 
 
 		 491 aa  43.1  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>