71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3239 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3124  short-chain fatty acid transporter family protein  87.29 
 
 		 472 aa  764    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.04212  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3807  short chain fatty acid transporter  72.13 
 
 		 474 aa  652    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.164784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2433  short chain fatty acid transporter  87.29 
 
 		 472 aa  777    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3457  short-chain fatty acid transporter  97.25 
 
 		 472 aa  885    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2733  short chain fatty acid transporter  87.29 
 
 		 472 aa  763    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33780  Short chain fatty acid transporter family protein  84.15 
 
 		 494 aa  681    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368969  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3291  hypothetical protein  85.9 
 
 		 474 aa  729    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3239  Short chain fatty acid transporter  100 
 
 		 472 aa  929    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.243579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4768  Short chain fatty acid transporter  90.89 
 
 		 472 aa  828    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2592  short chain fatty acid transporter  87.08 
 
 		 509 aa  762    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38610  hypothetical protein  85.68 
 
 		 474 aa  745    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.457227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5759  Short chain fatty acid transporter  64.12 
 
 		 482 aa  585  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0613926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4199  short chain fatty acid transporter  67.24 
 
 		 492 aa  586  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0850906  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0243  short chain fatty acid transporter  63.52 
 
 		 478 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3147  short chain fatty acid transporter  67.1 
 
 		 489 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3646  short chain fatty acid transporter  59.36 
 
 		 478 aa  555  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.030585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6880  Short chain fatty acid transporter  62.37 
 
 		 483 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0265966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2348  short chain fatty acid transporter  65.17 
 
 		 479 aa  541  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.294076 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2627  short chain fatty acid transporter  65.17 
 
 		 479 aa  542  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.764911  normal  0.061315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2304  short chain fatty acid transporter  65.17 
 
 		 479 aa  543  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856531  normal  0.0189751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4736  short chain fatty acid transporter  66.45 
 
 		 491 aa  544  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1381  Short chain fatty acid transporter  60.65 
 
 		 482 aa  526  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.789846  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0648  short chain fatty acid transporter  54.78 
 
 		 479 aa  523  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2232  short chain fatty acid transporter  53.85 
 
 		 474 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.606878  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2938  short chain fatty acid transporter  36.34 
 
 		 436 aa  233  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02150  short chain fatty acid transporter  32.74 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.795271  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2364  putative short chain fatty acid transporter  32.74 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1427  short chain fatty acid transporter  32.74 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2372  putative short chain fatty acid transporter  32.74 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.608941  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1435  short chain fatty acid transporter  32.74 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.203536  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02109  hypothetical protein  32.74 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853182  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1445  short chain fatty acid transporter  33.8 
 
 		 435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0888  short chain fatty acid transporter  33.79 
 
 		 439 aa  213  9e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01176  hypothetical Short chain fatty acid transporter  34.97 
 
 		 435 aa  212  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.680659  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3088  short chain fatty acid transporter  34.49 
 
 		 436 aa  209  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0831  hypothetical protein  32.73 
 
 		 456 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627864  normal  0.0867852 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2803  short chain fatty acid transporter  35.55 
 
 		 442 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2886  short chain fatty acid transporter  35.55 
 
 		 442 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2982  short chain fatty acid transporter  35.55 
 
 		 442 aa  205  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1677  hypothetical protein  35.32 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121429  normal  0.563194 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2249  short chain fatty acid transporter  30.26 
 
 		 440 aa  204  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4279  short chain fatty acid transporter  35.4 
 
 		 440 aa  203  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0354483  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1391  Short-chain fatty acid transporter  34.02 
 
 		 443 aa  202  9e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3747  hypothetical protein  34.96 
 
 		 450 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3052  short chain fatty acid transporter  31.78 
 
 		 457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3091  short chain fatty acid transporter  35.21 
 
 		 451 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1286  short chain fatty acid transporter  35.29 
 
 		 451 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.567744 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4221  short chain fatty acid transporter  34.96 
 
 		 440 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545369  normal  0.396779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3234  short chain fatty acid transporter  35.67 
 
 		 451 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3081  short chain fatty acid transporter  35.21 
 
 		 451 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.45839  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1201  short chain fatty acid transporter  34.25 
 
 		 447 aa  194  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3033  short chain fatty acid transporter  28.99 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.625274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3308  hypothetical protein  28.54 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3097  short-chain fatty acids transporter  28.25 
 
 		 448 aa  187  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3110  hypothetical protein  28.92 
 
 		 448 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3329  hypothetical protein  28.92 
 
 		 448 aa  186  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3356  hypothetical protein  28.92 
 
 		 448 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3000  short-chain fatty acids transporter  28.31 
 
 		 448 aa  186  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405946  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3315  hypothetical protein  28.25 
 
 		 448 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3328  hypothetical protein  28.09 
 
 		 448 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1137  short chain fatty acid transporter  30.49 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2419  short chain fatty acid transporter  30.79 
 
 		 464 aa  179  8e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3939  short chain fatty acid transporter  30.45 
 
 		 445 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.506022  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1419  short chain fatty acid transporter  31.37 
 
 		 434 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.989346 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2108  short chain fatty acid transporter  27.42 
 
 		 448 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.289141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1923  short-chain fatty acids transporter  29.48 
 
 		 455 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1689  short chain fatty acid transporter  32.14 
 
 		 471 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.316692 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1708  short chain fatty acid transporter  28.6 
 
 		 446 aa  159  9e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4680  short chain fatty acid transporter  28.24 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556803  normal  0.668538 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15960  short chain fatty acids transporter  29.82 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287757  normal  0.0635103 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3761  short chain fatty acid transporter  28.7 
 
 		 442 aa  150  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0115875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>