More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1122 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1122  periplasmic solute binding protein  100 
 
 
328 aa  667  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2142  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.92 
 
 
340 aa  237  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000717331  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2773  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.92 
 
 
321 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  6.94266e-06  hitchhiker  0.00715956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  38.71 
 
 
344 aa  228  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1827  high-affinity zinc transporter periplasmic component  39.32 
 
 
339 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0735941  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2111  high-affinity zinc transporter periplasmic component  39.2 
 
 
339 aa  225  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0209857  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3183  periplasmic solute binding protein  34.19 
 
 
371 aa  225  8e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0392805  normal  0.124808 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.74 
 
 
314 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  37.73 
 
 
308 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  38.34 
 
 
295 aa  219  4e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.74 
 
 
314 aa  219  4e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.74 
 
 
314 aa  219  4e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.74 
 
 
314 aa  219  4e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.74 
 
 
314 aa  219  4e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  37.05 
 
 
307 aa  218  8e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2384  periplasmic solute binding protein  39.17 
 
 
351 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691591  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  37.3 
 
 
307 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2140  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.54 
 
 
318 aa  217  3e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  2.51275e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2027  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.54 
 
 
318 aa  216  3e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.30529e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  36.31 
 
 
313 aa  216  5e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  37 
 
 
297 aa  216  6e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2251  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.65 
 
 
340 aa  215  7e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01361  hypothetical protein  37.54 
 
 
293 aa  214  1e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2593  high-affinity zinc transporter periplasmic component  35.05 
 
 
310 aa  212  7e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00016843  normal  0.856449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  35.96 
 
 
347 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2751  periplasmic solute binding protein  38.04 
 
 
332 aa  206  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  36.07 
 
 
303 aa  205  9e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0953  high-affinity zinc transporter periplasmic component  35.35 
 
 
310 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0035869  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1775  high-affinity zinc transporter periplasmic component  35.16 
 
 
310 aa  203  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  6.50264e-07  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01816  hypothetical protein  35.16 
 
 
310 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1951  high-affinity zinc transporter periplasmic component  35.16 
 
 
310 aa  203  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00866903  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01828  high-affinity zinc transporter periplasmic component  35.16 
 
 
310 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1783  periplasmic solute binding protein  35.16 
 
 
328 aa  203  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  9.35054e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1667  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  37.19 
 
 
297 aa  203  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1194  periplasmic solute binding protein  35.91 
 
 
329 aa  203  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.170646 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2087  high-affinity zinc transporter periplasmic component  34.95 
 
 
310 aa  201  1e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  1.65105e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  36.6 
 
 
309 aa  201  1e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4176  periplasmic solute binding protein  35.06 
 
 
346 aa  201  2e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1329  high-affinity zinc transporter periplasmic component  34.95 
 
 
352 aa  201  2e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00390701  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00830  ABC transporter, periplasmic binding protein  35.47 
 
 
297 aa  199  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2426  high-affinity zinc transporter periplasmic component  35.29 
 
 
314 aa  198  1e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000208109  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1122  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  36.65 
 
 
334 aa  195  9e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.124728  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1027  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  36.65 
 
 
334 aa  195  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5108  periplasmic solute binding protein  34.86 
 
 
302 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0135  periplasmic solute binding protein  33.75 
 
 
318 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0275  periplasmic solute binding protein  33.11 
 
 
313 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0312  periplasmic solute binding protein  33.61 
 
 
362 aa  183  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0137  periplasmic solute binding protein  33.75 
 
 
302 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0120  periplasmic solute binding protein  33.44 
 
 
302 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3253  periplasmic solute binding protein  33.81 
 
 
347 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0556768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5268  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  33.44 
 
 
311 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1892  periplasmic solute binding protein  30.96 
 
 
321 aa  163  4e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00897518  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3571  ABC zinc transporter, periplasmic binding protein ZnuA  33.14 
 
 
345 aa  163  4e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1256  high-affinity zinc transporter periplasmic component  42.86 
 
 
372 aa  157  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000280798  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0577  periplasmic solute binding protein  29.5 
 
 
301 aa  152  7e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.289421  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1712  periplasmic solute binding protein  36.97 
 
 
369 aa  147  2e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.333525  normal  0.532025 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1704  putative high-affinity zinc uptake system protein  28.05 
 
 
356 aa  146  4e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0200273  normal  0.0153509 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4140  periplasmic solute binding protein  31.39 
 
 
326 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.101102 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0188  periplasmic solute binding protein  30.59 
 
 
334 aa  141  1e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494723  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 
368 aa  136  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3151  hypothetical protein  31.64 
 
 
336 aa  134  1e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.506548 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4495  periplasmic solute binding protein  44.69 
 
 
350 aa  132  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0842  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  26.62 
 
 
282 aa  130  3e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.290902  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0248  periplasmic solute binding protein  25.71 
 
 
287 aa  122  6e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0937  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  25.49 
 
 
293 aa  122  6e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.388709  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0060  XRE family transcriptional regulator  28.66 
 
 
326 aa  122  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.741905  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  27.69 
 
 
310 aa  119  8e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 
309 aa  117  4e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  29.18 
 
 
344 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  26.73 
 
 
278 aa  115  8e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  28.17 
 
 
285 aa  111  2e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  28.2 
 
 
318 aa  110  4e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  29.49 
 
 
290 aa  110  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  28.71 
 
 
299 aa  110  5e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.11 
 
 
514 aa  109  6e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2208  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  31.29 
 
 
345 aa  109  7e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.353615  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  27.74 
 
 
339 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  28.21 
 
 
324 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  23.67 
 
 
314 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  25.81 
 
 
311 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  29.68 
 
 
290 aa  107  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  27.09 
 
 
315 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  25.24 
 
 
358 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  24.24 
 
 
328 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.88581e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  23.91 
 
 
320 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  24.83 
 
 
312 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  24.21 
 
 
313 aa  104  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  24 
 
 
345 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  27.31 
 
 
323 aa  104  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  25.65 
 
 
322 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  29.13 
 
 
296 aa  102  6e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  27.22 
 
 
323 aa  103  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  28.95 
 
 
302 aa  102  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  25.25 
 
 
292 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  24.31 
 
 
333 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  28.3 
 
 
290 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  26.62 
 
 
311 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  25.83 
 
 
316 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  26.32 
 
 
293 aa  99.8  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  21.86 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.03257e-13  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>