More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0312 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0312  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 362 aa  723    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1704  putative high-affinity zinc uptake system protein  67.4 
 
 		 356 aa  460  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0200273  normal  0.0153509 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4176  periplasmic solute binding protein  41.76 
 
 		 346 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1122  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  43.85 
 
 		 334 aa  281  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.124728  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1027  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  43.85 
 
 		 334 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  42.08 
 
 		 347 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  42.58 
 
 		 344 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3616  periplasmic solute binding protein  42.22 
 
 		 378 aa  256  6e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0144381 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2384  periplasmic solute binding protein  42.65 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691591  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  42.14 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  40.82 
 
 		 308 aa  246  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0188  periplasmic solute binding protein  42.39 
 
 		 334 aa  235  9e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494723  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3183  periplasmic solute binding protein  36.68 
 
 		 371 aa  229  6e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0392805  normal  0.124808 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  35.26 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3253  periplasmic solute binding protein  40.48 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0556768 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3571  ABC zinc transporter, periplasmic binding protein ZnuA  40.82 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2142  high-affinity zinc transporter periplasmic component  31.58 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000717331  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4140  periplasmic solute binding protein  36.44 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101102 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2251  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.28 
 
 		 340 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2593  high-affinity zinc transporter periplasmic component  29.68 
 
 		 310 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00016843  normal  0.856449 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  29.59 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  29.59 
 
 		 314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  29.59 
 
 		 314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  29.59 
 
 		 314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  29.59 
 
 		 314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  29.61 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  29.89 
 
 		 307 aa  156  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  29.44 
 
 		 309 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2111  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.98 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0209857  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  27.9 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0275  periplasmic solute binding protein  28.93 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1194  periplasmic solute binding protein  45.45 
 
 		 329 aa  149  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170646 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1827  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.73 
 
 		 339 aa  149  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0735941  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2087  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.38 
 
 		 310 aa  149  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000165105  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2140  high-affinity zinc transporter periplasmic component  28.7 
 
 		 318 aa  149  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000251275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2027  high-affinity zinc transporter periplasmic component  28.7 
 
 		 318 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000130529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1329  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.67 
 
 		 352 aa  146  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00390701  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01828  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.09 
 
 		 310 aa  146  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1951  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.09 
 
 		 310 aa  146  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00866903  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01816  hypothetical protein  27.09 
 
 		 310 aa  146  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1775  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.09 
 
 		 310 aa  146  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1783  periplasmic solute binding protein  27.09 
 
 		 328 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000935054  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0953  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.95 
 
 		 310 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0035869  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2773  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.55 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000694266  hitchhiker  0.00715956 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1712  periplasmic solute binding protein  42.94 
 
 		 369 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.333525  normal  0.532025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00830  ABC transporter, periplasmic binding protein  29.56 
 
 		 297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2426  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.3 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000208109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  29.51 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0577  periplasmic solute binding protein  26.39 
 
 		 301 aa  123  6e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.289421  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  34.73 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01361  hypothetical protein  34.13 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  29.5 
 
 		 358 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3151  hypothetical protein  41.67 
 
 		 336 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506548 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0842  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  32.61 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.290902  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  23.7 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.27 
 
 		 347 aa  100  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0135  periplasmic solute binding protein  31.76 
 
 		 318 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5268  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  32.94 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  25.56 
 
 		 313 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  26.2 
 
 		 311 aa  96.7  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.82 
 
 		 323 aa  96.3  8e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1256  high-affinity zinc transporter periplasmic component  28.9 
 
 		 372 aa  96.3  8e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000280798  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  24.61 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0937  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  29.94 
 
 		 293 aa  95.1  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.388709  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  29.26 
 
 		 346 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5108  periplasmic solute binding protein  31.18 
 
 		 302 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0248  periplasmic solute binding protein  29.89 
 
 		 287 aa  94  4e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  23.39 
 
 		 295 aa  93.6  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  24.12 
 
 		 333 aa  93.2  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  25.16 
 
 		 294 aa  92.4  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  33.74 
 
 		 324 aa  92  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  24.12 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  24.16 
 
 		 320 aa  90.9  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  32.91 
 
 		 311 aa  90.1  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  30.51 
 
 		 312 aa  89.7  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1667  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  32.14 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2208  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  29.34 
 
 		 345 aa  87  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.353615  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  31.48 
 
 		 331 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  26.84 
 
 		 309 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  25.24 
 
 		 307 aa  85.9  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  21.68 
 
 		 318 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  26.79 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0120  periplasmic solute binding protein  29.21 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  31.65 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0137  periplasmic solute binding protein  29.21 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  22.22 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  30.05 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4768  periplasmic solute binding protein  32.2 
 
 		 509 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474869  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1011  periplasmic solute binding protein  29.05 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.932798  normal  0.91735 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  29.76 
 
 		 282 aa  82  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  28.66 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  33.1 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  32.19 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  22.75 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  28.65 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  30.99 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  32.39 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  24.44 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  24.58 
 
 		 514 aa  79.3  0.00000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>