More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1712 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1712  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 369 aa  740    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.333525  normal  0.532025 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1194  periplasmic solute binding protein  45.16 
 
 		 329 aa  276  6e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170646 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  41.01 
 
 		 347 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  40.58 
 
 		 308 aa  263  4.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  40.62 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2384  periplasmic solute binding protein  42.94 
 
 		 351 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691591  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4176  periplasmic solute binding protein  40.45 
 
 		 346 aa  250  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  40.96 
 
 		 303 aa  245  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  38.95 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2142  high-affinity zinc transporter periplasmic component  35.24 
 
 		 340 aa  240  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000717331  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1122  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  37.61 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.124728  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1027  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  37.61 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0312  periplasmic solute binding protein  39.25 
 
 		 362 aa  225  8e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1704  putative high-affinity zinc uptake system protein  40.22 
 
 		 356 aa  225  8e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0200273  normal  0.0153509 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3183  periplasmic solute binding protein  36.21 
 
 		 371 aa  225  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0392805  normal  0.124808 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2251  high-affinity zinc transporter periplasmic component  34.56 
 
 		 340 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  33.53 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  33.53 
 
 		 314 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  33.53 
 
 		 314 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  33.53 
 
 		 314 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  33.53 
 
 		 314 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2593  high-affinity zinc transporter periplasmic component  32.06 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00016843  normal  0.856449 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1827  high-affinity zinc transporter periplasmic component  33.24 
 
 		 339 aa  213  5.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0735941  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2111  high-affinity zinc transporter periplasmic component  34.09 
 
 		 339 aa  212  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0209857  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2140  high-affinity zinc transporter periplasmic component  31.12 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000251275  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2773  high-affinity zinc transporter periplasmic component  31.79 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000694266  hitchhiker  0.00715956 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2027  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.82 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000130529  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2426  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.51 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000208109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  27.35 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  31.4 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3253  periplasmic solute binding protein  36.39 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0556768 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  31.36 
 
 		 309 aa  176  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3616  periplasmic solute binding protein  33.69 
 
 		 378 aa  176  8e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0144381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00830  ABC transporter, periplasmic binding protein  31.71 
 
 		 297 aa  176  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3571  ABC zinc transporter, periplasmic binding protein ZnuA  38.94 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  31.27 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0275  periplasmic solute binding protein  30.7 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3151  hypothetical protein  38.16 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506548 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1329  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.67 
 
 		 352 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00390701  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01828  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.67 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1783  periplasmic solute binding protein  36.67 
 
 		 328 aa  160  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000935054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1775  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.67 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2087  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.67 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000165105  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01816  hypothetical protein  36.67 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1951  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.67 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00866903  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0953  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.11 
 
 		 310 aa  159  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0035869  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0188  periplasmic solute binding protein  35.45 
 
 		 334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494723  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4140  periplasmic solute binding protein  32.84 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101102 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01361  hypothetical protein  38.24 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1122  periplasmic solute binding protein  37.5 
 
 		 328 aa  149  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  35.12 
 
 		 295 aa  145  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0842  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  25.6 
 
 		 282 aa  142  6e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.290902  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1256  high-affinity zinc transporter periplasmic component  31.82 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000280798  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1667  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  34.5 
 
 		 297 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  26.09 
 
 		 368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4495  periplasmic solute binding protein  38.89 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  26.78 
 
 		 299 aa  126  7e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.82 
 
 		 320 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0120  periplasmic solute binding protein  35.47 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5108  periplasmic solute binding protein  34.88 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0137  periplasmic solute binding protein  35.47 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5268  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  34.12 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  27.17 
 
 		 310 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0577  periplasmic solute binding protein  24.93 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.289421  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  26.57 
 
 		 358 aa  119  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  27.81 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0135  periplasmic solute binding protein  34.3 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  26.2 
 
 		 344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0248  periplasmic solute binding protein  29.83 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  24.86 
 
 		 365 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  24.85 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  21.41 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0937  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  28.81 
 
 		 293 aa  103  6e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.388709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  23.53 
 
 		 316 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  23.53 
 
 		 316 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  33.92 
 
 		 312 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  23.16 
 
 		 316 aa  102  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  23.53 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  23.25 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  23.53 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  23.25 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  23.25 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  22.38 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2751  periplasmic solute binding protein  44.54 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  19.21 
 
 		 514 aa  100  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  22.77 
 
 		 314 aa  99.8  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  30.54 
 
 		 311 aa  99.4  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  24.41 
 
 		 310 aa  99.4  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  24.35 
 
 		 296 aa  99  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  26.01 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  24.05 
 
 		 323 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  32.91 
 
 		 282 aa  97.4  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  21.81 
 
 		 316 aa  96.7  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  22.62 
 
 		 285 aa  96.7  6e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  25.28 
 
 		 311 aa  96.3  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  25.41 
 
 		 309 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  29.05 
 
 		 296 aa  94.4  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  22.07 
 
 		 313 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  28 
 
 		 469 aa  92.8  9e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2208  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  27.95 
 
 		 345 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.353615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>