More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0577 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0577  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 301 aa  619  1e-176  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.289421  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  31.17 
 
 		 308 aa  155  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  29.84 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2593  high-affinity zinc transporter periplasmic component  31.27 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00016843  normal  0.856449 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0953  high-affinity zinc transporter periplasmic component  31.27 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0035869  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  30.28 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.98 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.98 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1329  high-affinity zinc transporter periplasmic component  31.27 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00390701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.98 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.98 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.98 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2087  high-affinity zinc transporter periplasmic component  31.27 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000165105  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  30.59 
 
 		 344 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1783  periplasmic solute binding protein  30.93 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000935054  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2384  periplasmic solute binding protein  30.13 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691591  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2027  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.56 
 
 		 318 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000130529  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01828  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.93 
 
 		 310 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1775  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.93 
 
 		 310 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01816  hypothetical protein  30.93 
 
 		 310 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1951  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.93 
 
 		 310 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00866903  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2773  high-affinity zinc transporter periplasmic component  31.25 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000694266  hitchhiker  0.00715956 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2140  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.23 
 
 		 318 aa  142  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000251275  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2751  periplasmic solute binding protein  29.62 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1194  periplasmic solute binding protein  28.53 
 
 		 329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170646 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0120  periplasmic solute binding protein  31.82 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2426  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.8 
 
 		 314 aa  139  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000208109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0275  periplasmic solute binding protein  31.37 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0137  periplasmic solute binding protein  31.49 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  31.46 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1667  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  31.13 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2111  high-affinity zinc transporter periplasmic component  29.91 
 
 		 339 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0209857  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1122  periplasmic solute binding protein  28.88 
 
 		 328 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1827  high-affinity zinc transporter periplasmic component  29.5 
 
 		 339 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0735941  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2142  high-affinity zinc transporter periplasmic component  29.65 
 
 		 340 aa  135  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000717331  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  28.81 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  29.8 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00830  ABC transporter, periplasmic binding protein  29.51 
 
 		 297 aa  133  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5108  periplasmic solute binding protein  28.94 
 
 		 302 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2251  high-affinity zinc transporter periplasmic component  31.6 
 
 		 340 aa  132  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1704  putative high-affinity zinc uptake system protein  26.35 
 
 		 356 aa  132  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0200273  normal  0.0153509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0135  periplasmic solute binding protein  30.84 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  28.29 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5268  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  29.61 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  27.63 
 
 		 307 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1027  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  27.91 
 
 		 334 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1122  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  27.91 
 
 		 334 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.124728  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4176  periplasmic solute binding protein  26.92 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01361  hypothetical protein  27.36 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  26.3 
 
 		 347 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0312  periplasmic solute binding protein  26.1 
 
 		 362 aa  115  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  28.67 
 
 		 300 aa  113  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  27.01 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0248  periplasmic solute binding protein  24.25 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0842  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  24.3 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.290902  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3616  periplasmic solute binding protein  31.95 
 
 		 378 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0144381 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  24.44 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  26.33 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1892  periplasmic solute binding protein  24.68 
 
 		 321 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00897518  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4140  periplasmic solute binding protein  25.84 
 
 		 326 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3183  periplasmic solute binding protein  30.06 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0392805  normal  0.124808 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  26.06 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0188  periplasmic solute binding protein  24.7 
 
 		 334 aa  95.9  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494723  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  26.64 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  26.16 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  25.95 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  23.22 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  23.74 
 
 		 514 aa  93.2  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1712  periplasmic solute binding protein  32.94 
 
 		 369 aa  92.4  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.333525  normal  0.532025 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3151  hypothetical protein  26.03 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506548 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1256  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.39 
 
 		 372 aa  92  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000280798  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  26.89 
 
 		 365 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  26.03 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3571  ABC zinc transporter, periplasmic binding protein ZnuA  25.3 
 
 		 345 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3253  periplasmic solute binding protein  25.74 
 
 		 347 aa  89  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0556768 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  23.84 
 
 		 302 aa  89  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  27 
 
 		 310 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  26.95 
 
 		 276 aa  89  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.2 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  24.43 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  26.16 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  27 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  26.15 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  25.42 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  25.82 
 
 		 292 aa  87  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  24.82 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  24.82 
 
 		 285 aa  86.7  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  28.63 
 
 		 328 aa  85.9  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  27.54 
 
 		 333 aa  85.9  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  24.57 
 
 		 300 aa  85.5  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  24.75 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  28.06 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.06 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  28.06 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  28.42 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  25.74 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  25.49 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  24.11 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>