More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0188 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0188  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 334 aa  675    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494723  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1704  putative high-affinity zinc uptake system protein  43.52 
 
 		 356 aa  262  6e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0200273  normal  0.0153509 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0312  periplasmic solute binding protein  44.57 
 
 		 362 aa  261  8e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3616  periplasmic solute binding protein  38.99 
 
 		 378 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0144381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  38.82 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4176  periplasmic solute binding protein  40.75 
 
 		 346 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1122  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  39.25 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.124728  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1027  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  39.25 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  39.25 
 
 		 308 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  38.82 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2384  periplasmic solute binding protein  38.92 
 
 		 351 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691591  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  37.5 
 
 		 303 aa  206  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4140  periplasmic solute binding protein  37.3 
 
 		 326 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101102 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3253  periplasmic solute binding protein  40.06 
 
 		 347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0556768 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  36.42 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3571  ABC zinc transporter, periplasmic binding protein ZnuA  38.68 
 
 		 345 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3183  periplasmic solute binding protein  33.52 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0392805  normal  0.124808 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3151  hypothetical protein  39.46 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506548 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1194  periplasmic solute binding protein  35.85 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170646 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2751  periplasmic solute binding protein  37.18 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1712  periplasmic solute binding protein  33.53 
 
 		 369 aa  153  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.333525  normal  0.532025 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1122  periplasmic solute binding protein  30 
 
 		 328 aa  149  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  29.23 
 
 		 307 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2142  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.91 
 
 		 340 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000717331  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  28.92 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2251  high-affinity zinc transporter periplasmic component  28.31 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01361  hypothetical protein  28.06 
 
 		 293 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1827  high-affinity zinc transporter periplasmic component  28.88 
 
 		 339 aa  142  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0735941  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  26.81 
 
 		 297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  27.81 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2111  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.19 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0209857  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2140  high-affinity zinc transporter periplasmic component  28.98 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000251275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2027  high-affinity zinc transporter periplasmic component  28.98 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000130529  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0275  periplasmic solute binding protein  29.05 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0842  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  27.61 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.290902  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  26.15 
 
 		 295 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2593  high-affinity zinc transporter periplasmic component  28.25 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00016843  normal  0.856449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2773  high-affinity zinc transporter periplasmic component  29.1 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000694266  hitchhiker  0.00715956 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1329  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.44 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00390701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00830  ABC transporter, periplasmic binding protein  27.83 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2087  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.94 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000165105  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01828  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.94 
 
 		 310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1783  periplasmic solute binding protein  27.94 
 
 		 328 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000935054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1775  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.94 
 
 		 310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1951  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.94 
 
 		 310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00866903  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01816  hypothetical protein  27.94 
 
 		 310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0953  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.62 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0035869  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  28.27 
 
 		 314 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0248  periplasmic solute binding protein  27.24 
 
 		 287 aa  124  3e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  28.27 
 
 		 314 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  28.27 
 
 		 314 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  28.27 
 
 		 314 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  28.27 
 
 		 314 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  27.76 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2426  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.56 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000208109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1892  periplasmic solute binding protein  27.11 
 
 		 321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00897518  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5108  periplasmic solute binding protein  26.46 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0120  periplasmic solute binding protein  25.3 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0137  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1667  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  25.68 
 
 		 297 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  27.74 
 
 		 310 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0577  periplasmic solute binding protein  25.91 
 
 		 301 aa  109  8.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.289421  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1256  high-affinity zinc transporter periplasmic component  28.98 
 
 		 372 aa  105  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000280798  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  26.42 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0135  periplasmic solute binding protein  25.08 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  27.8 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  22.46 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5268  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  24.46 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  28.12 
 
 		 345 aa  103  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  25.17 
 
 		 285 aa  103  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  25.82 
 
 		 344 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  27.87 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 		 335 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  26.85 
 
 		 328 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0937  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  23.45 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.388709  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  26.94 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  27.68 
 
 		 312 aa  97.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  25.09 
 
 		 295 aa  96.7  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  25.62 
 
 		 353 aa  96.3  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  24.68 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  27.33 
 
 		 311 aa  95.1  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  27.68 
 
 		 339 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  32.48 
 
 		 311 aa  95.1  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  22.7 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  24.57 
 
 		 368 aa  93.6  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  24.76 
 
 		 309 aa  92.8  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  24.26 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  24.65 
 
 		 323 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  27.46 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3491  periplasmic solute binding protein  28.42 
 
 		 323 aa  91.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.171763  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.57 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  31.88 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  23.62 
 
 		 322 aa  90.9  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  23.13 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.42 
 
 		 349 aa  90.1  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  23.51 
 
 		 514 aa  90.1  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  27.96 
 
 		 320 aa  90.5  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11830  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.24 
 
 		 339 aa  89.4  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00348761  normal  0.825122 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  25.27 
 
 		 326 aa  89.4  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>