More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0883 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
305 aa  613  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.27 
 
 
301 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485351  normal  0.187232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.58 
 
 
301 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.499107  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2400  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  53.9 
 
 
300 aa  345  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.239524  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.12 
 
 
302 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0276286  normal  0.845621 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.63 
 
 
302 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.473055  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.68 
 
 
304 aa  308  6.999999999999999e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9199  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  48.59 
 
 
290 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.99 
 
 
298 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0514652  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2082  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  46.15 
 
 
313 aa  288  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.785308  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.04 
 
 
314 aa  285  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.44 
 
 
318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.184378 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.94 
 
 
295 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.89 
 
 
295 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101772  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1940  sugar ABC transporter permease  48.01 
 
 
310 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22990  putative permease of ABC sugar transporter  48.01 
 
 
310 aa  272  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.155335 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1957  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  47.75 
 
 
299 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104929  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.85 
 
 
309 aa  263  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20816  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.76 
 
 
309 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0310559  hitchhiker  0.000856592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.22 
 
 
302 aa  259  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.125531  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.11 
 
 
292 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.98 
 
 
319 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.183894  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.98 
 
 
319 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.510445 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.98 
 
 
309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.25 
 
 
295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.184749 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4369  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.62 
 
 
302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.276416  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.83 
 
 
289 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.56 
 
 
298 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0692  sugar ABC transporter, permease protein, putative  42.61 
 
 
349 aa  249  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.0072223  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0647  putative sugar ABC transporter, permease protein  42.61 
 
 
349 aa  249  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.98 
 
 
292 aa  249  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.163293  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3084  ABC transporter, membrane permease  46.26 
 
 
312 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0784  carbohydrate ABC transporter permease  46.26 
 
 
312 aa  248  9e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142967  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2616  carbohydrate ABC transporter permease  46.26 
 
 
312 aa  248  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1033  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3050  carbohydrate ABC transporter permease  46.26 
 
 
312 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1996  carbohydrate ABC transporter permease  46.26 
 
 
312 aa  248  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.62 
 
 
312 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.66 
 
 
293 aa  248  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0253995  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0969  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.62 
 
 
312 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2996  carbohydrate ABC transporter permease  46.26 
 
 
312 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.847023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1114  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.97 
 
 
302 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 
317 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.135276  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 
317 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573592  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.55 
 
 
302 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1293  glucose ABC transporter, permease protein, putative  42.23 
 
 
302 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.62 
 
 
292 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0829  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.91 
 
 
312 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278344  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.2 
 
 
302 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0841  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.91 
 
 
292 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.2 
 
 
302 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00469845  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4072  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  46.26 
 
 
312 aa  245  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0117098  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.92 
 
 
302 aa  244  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.227216  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.72 
 
 
294 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.28 
 
 
302 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1554  ABC transporter, membrane permease  45.55 
 
 
357 aa  242  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.07 
 
 
313 aa  242  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373339  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44 
 
 
290 aa  241  7.999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.33 
 
 
293 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.778407  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.44 
 
 
312 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213749  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 
317 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3450  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  46.44 
 
 
312 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000968646  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 
317 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.11 
 
 
288 aa  221  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0059104  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
295 aa  195  8.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.58 
 
 
330 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.817571  normal  0.701036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
330 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.848651  normal  0.375032 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.7 
 
 
335 aa  159  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
307 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.372981  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
323 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7938  ABC transporter (permease)  33.21 
 
 
295 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
323 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
306 aa  151  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
298 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857292  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
317 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.9 
 
 
329 aa  135  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145825  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
321 aa  132  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.824924  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.64 
 
 
319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6025  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 
305 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584937  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.67 
 
 
307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.76 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.93 
 
 
328 aa  129  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2010  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  29.1 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360583  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0388505  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
305 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.825826  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
305 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5738  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  29.17 
 
 
302 aa  126  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
290 aa  125  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.68 
 
 
291 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.3 
 
 
294 aa  124  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558297  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.04 
 
 
294 aa  123  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
348 aa  122  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.519073 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  30.48 
 
 
317 aa  121  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.45 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115668  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.84 
 
 
314 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59424  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.22 
 
 
316 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.45 
 
 
328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.18 
 
 
310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>