66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0795 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0795  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 315 aa  643    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.851329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0278  O-antigen length determinant protein  71.33 
 
 		 325 aa  457  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3191  chain length determinant protein  53.97 
 
 		 329 aa  353  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1384  lipopolysaccharide biosynthesis  52.49 
 
 		 324 aa  346  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00868672 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3033  lipopolysaccharide biosynthesis protein  51.94 
 
 		 320 aa  345  7e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1400  lipopolysaccharide biosynthesis protein  51.97 
 
 		 324 aa  345  8e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1397  lipopolysaccharide biosynthesis protein  56.15 
 
 		 325 aa  342  4e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00688  hypothetical protein  55.95 
 
 		 320 aa  342  5e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1471  lipopolysaccharide biosynthesis protein  52.49 
 
 		 328 aa  338  7e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.782719  normal  0.412759 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1317  lipopolysaccharide biosynthesis  52.65 
 
 		 328 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1653  lipopolysaccharide biosynthesis protein  52.17 
 
 		 321 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0595159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0764  lipopolysaccharide biosynthesis  53.95 
 
 		 307 aa  335  5e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0283751  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2541  lipopolysaccharide biosynthesis  51.66 
 
 		 329 aa  335  5e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2891  lipopolysaccharide biosynthesis protein  54.15 
 
 		 325 aa  332  6e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2841  lipopolysaccharide biosynthesis  52.48 
 
 		 326 aa  331  8e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500509  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2902  lipopolysaccharide biosynthesis protein  51.19 
 
 		 324 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1376  lipopolysaccharide biosynthesis  53.6 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648353  hitchhiker  0.00000667322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2262  chain length determinant protein  52.81 
 
 		 327 aa  323  3e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0523506  decreased coverage  0.000488654 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2669  lipopolysaccharide biosynthesis  50.64 
 
 		 324 aa  296  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2090  chain length determinant family protein  50.67 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.77217  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2975  chain length determinant family protein  46.1 
 
 		 317 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2132  chain length determinant protein  39.8 
 
 		 340 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.104216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0472  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.05 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.61 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  31.82 
 
 		 721 aa  56.6  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  23.83 
 
 		 409 aa  56.2  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.716445  hitchhiker  0.000227002 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1511  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 422 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  32.71 
 
 		 716 aa  53.9  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0419  chain length determinant protein  50 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.554474  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.39 
 
 		 463 aa  50.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1855  capsule polysaccharide export protein, putative  21.92 
 
 		 406 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722635  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3789  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.59 
 
 		 407 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0889  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 		 415 aa  47  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0643  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.5 
 
 		 398 aa  47.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  30.69 
 
 		 723 aa  46.6  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1630  lipopolysaccharide biosynthesis protein  44.68 
 
 		 326 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0203783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2960  chain length determinant protein  44.68 
 
 		 325 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000740001 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01915  hypothetical protein  44.68 
 
 		 326 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1033  chain length determinant protein  44.68 
 
 		 326 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.205095 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1205  chain length determinant protein  44.68 
 
 		 344 aa  45.8  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.747059  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01929  regulator of length of O-antigen component of lipopolysaccharide chains  44.68 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00543  hypothetical protein  29.21 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.589908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 		 384 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00554  regulator of length of O-antigen component of lipopolysaccharide chains  29.21 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0315  chain length determinant protein-like protein  42.55 
 
 		 347 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0608  ferric enterobactin transport protein FepE  29.21 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2318  chain length determinant protein  44.68 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1615  lipopolysaccharide biosynthesis protein  44.68 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.626955  normal  0.791839 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  42.86 
 
 		 723 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0673  ferric enterobactin transport protein FepE  29.21 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0490  ferric enterobactin transport protein FepE  28.09 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2258  chain length determinant protein  46.51 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0308231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4936  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.41 
 
 		 362 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0428435  normal  0.874346 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0747  ferric enterobactin transport protein FepE  35.71 
 
 		 378 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3039  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.09 
 
 		 377 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.443281  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0638  ferric enterobactin transport protein FepE  28.09 
 
 		 377 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  40.74 
 
 		 724 aa  43.5  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0642  ferric enterobactin transport protein FepE  35.71 
 
 		 378 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.412553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0685  ferric enterobactin transport protein FepE  35.71 
 
 		 378 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0628  ferric enterobactin transport protein FepE  35.71 
 
 		 378 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3057  ferric enterobactin transport protein FepE  28.09 
 
 		 377 aa  43.5  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0701  ferric enterobactin transport protein FepE  35.71 
 
 		 378 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2417  chain length determinant protein  46.51 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0117622 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2204  chain length determinant protein  46.51 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2305  chain length determinant protein  46.51 
 
 		 325 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0412425 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2307  chain length determinant protein  46.51 
 
 		 327 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0598886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>