182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5565 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  853    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  99.76 
 
 		 552 aa  848    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  53.7 
 
 		 587 aa  335  1e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  36.07 
 
 		 418 aa  196  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  34.67 
 
 		 495 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  33.64 
 
 		 639 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  34.97 
 
 		 759 aa  187  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  33.03 
 
 		 478 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  36.24 
 
 		 346 aa  182  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  33.62 
 
 		 343 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  33.22 
 
 		 364 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  34.24 
 
 		 899 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  34.15 
 
 		 388 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  34.15 
 
 		 388 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  34.15 
 
 		 388 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  31.35 
 
 		 771 aa  176  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  33.9 
 
 		 619 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  34.32 
 
 		 698 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  35.14 
 
 		 665 aa  173  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  34.01 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  30.95 
 
 		 425 aa  170  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  32.65 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  30.66 
 
 		 362 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  31.62 
 
 		 463 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  32.09 
 
 		 405 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  32.92 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  31.08 
 
 		 475 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  31.08 
 
 		 475 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  31.08 
 
 		 475 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  31.36 
 
 		 532 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  33.22 
 
 		 380 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  30.54 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  33.01 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  33.01 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  33.01 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  32.23 
 
 		 390 aa  135  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  27.43 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  27.43 
 
 		 416 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  29.82 
 
 		 666 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  28.4 
 
 		 341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  25.83 
 
 		 926 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  26.09 
 
 		 534 aa  106  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  27 
 
 		 968 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  27.55 
 
 		 811 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  27.34 
 
 		 544 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  26.89 
 
 		 439 aa  97.8  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  26.64 
 
 		 1160 aa  95.1  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  24.87 
 
 		 542 aa  90.9  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0331  hypothetical protein  26.48 
 
 		 579 aa  90.5  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  23.75 
 
 		 1132 aa  89.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1519 aa  86.7  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4286  hypothetical protein  25 
 
 		 494 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  22.14 
 
 		 617 aa  79.7  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  24.11 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  23.02 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  23.75 
 
 		 586 aa  76.3  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  22.45 
 
 		 485 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  23.02 
 
 		 497 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  22.76 
 
 		 533 aa  73.2  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3184  chromosome partitioning ATPase protein-like  24.69 
 
 		 659 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0666386  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  24.1 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  22.66 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  24.19 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  22.73 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  24.12 
 
 		 400 aa  57  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  23.25 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.48 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  22.83 
 
 		 487 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1928  flagellar biosynthesis switch protein  30.43 
 
 		 275 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.965527 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0049  putative ParA partition protein  24.51 
 
 		 261 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  20.95 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.85 
 
 		 288 aa  53.9  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  27.37 
 
 		 285 aa  53.1  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4042  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.56 
 
 		 294 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0651768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  24.36 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.92 
 
 		 275 aa  51.6  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.30922  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.65 
 
 		 291 aa  51.6  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3978  hypothetical protein  25.76 
 
 		 544 aa  50.4  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  25.4 
 
 		 387 aa  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  23.97 
 
 		 402 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.4 
 
 		 284 aa  50.1  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4754  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.97 
 
 		 302 aa  50.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.11 
 
 		 350 aa  49.7  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  20.99 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50 
 
 		 304 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  25 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  17.86 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  22.78 
 
 		 381 aa  48.9  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1356  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.7 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  23.73 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  24.71 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  20 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.7 
 
 		 296 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  24.81 
 
 		 425 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.7 
 
 		 296 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2836  chromosome partitioning ATPase  52.63 
 
 		 279 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0103983  normal  0.469261 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.43 
 
 		 295 aa  47.4  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  28.02 
 
 		 391 aa  47  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.2 
 
 		 317 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>