254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1142 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
445 aa  922    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  31.67 
 
 
464 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.9 
 
 
444 aa  180  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  30.54 
 
 
452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  28.03 
 
 
430 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  30.34 
 
 
440 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  29.73 
 
 
433 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  26.94 
 
 
443 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.75 
 
 
433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.86 
 
 
433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  30.61 
 
 
468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.37 
 
 
432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  29.39 
 
 
452 aa  160  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  28.86 
 
 
457 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  28.86 
 
 
457 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  29.88 
 
 
444 aa  159  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  30.19 
 
 
432 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  29.51 
 
 
442 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  31.6 
 
 
472 aa  158  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.37 
 
 
453 aa  155  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  29.09 
 
 
432 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  31.13 
 
 
455 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  30.32 
 
 
437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.72 
 
 
440 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  29.23 
 
 
438 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  30 
 
 
454 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  28.42 
 
 
474 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.29 
 
 
456 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  29.29 
 
 
456 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.29 
 
 
456 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  31.25 
 
 
432 aa  149  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  29.29 
 
 
481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  30.54 
 
 
436 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  28.01 
 
 
442 aa  147  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.43 
 
 
435 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.33 
 
 
447 aa  146  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  26.1 
 
 
436 aa  146  8.000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  29.67 
 
 
462 aa  145  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  29.02 
 
 
461 aa  143  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.85 
 
 
437 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.67 
 
 
472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.61 
 
 
463 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  28.42 
 
 
444 aa  137  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  27.8 
 
 
476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.96 
 
 
433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  30.49 
 
 
438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  26.11 
 
 
431 aa  130  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  30.53 
 
 
438 aa  130  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  25.7 
 
 
431 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  30.57 
 
 
438 aa  120  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.39 
 
 
441 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  23.86 
 
 
425 aa  109  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  35.77 
 
 
481 aa  75.1  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  31.21 
 
 
434 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  30.15 
 
 
475 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  33.1 
 
 
478 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.03 
 
 
490 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  24.29 
 
 
473 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  31.69 
 
 
471 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  31.69 
 
 
478 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  31.69 
 
 
478 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  31.69 
 
 
478 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  31.69 
 
 
468 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  30.49 
 
 
478 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  30.49 
 
 
471 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  29.88 
 
 
478 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  32.95 
 
 
441 aa  65.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  33.06 
 
 
574 aa  65.1  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  31.25 
 
 
438 aa  63.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  27.74 
 
 
761 aa  63.5  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.19 
 
 
429 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.12 
 
 
469 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  28.12 
 
 
452 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.12 
 
 
469 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.12 
 
 
469 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  27.6 
 
 
452 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  32.61 
 
 
436 aa  61.2  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  28.24 
 
 
469 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.68 
 
 
469 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09066  D-lactate dehydrogenase (cytochrome) (AFU_orthologue; AFUA_7G02560)  33.88 
 
 
601 aa  60.1  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.86 
 
 
459 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  23.13 
 
 
425 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  30 
 
 
441 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.23 
 
 
469 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0777  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.33 
 
 
482 aa  57.4  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1985  FAD linked oxidase-like  31.65 
 
 
465 aa  57  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845932  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  28.93 
 
 
437 aa  57.4  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86747  mitochondrial enzyme D-lactate ferricytochrome c oxidoreductase  28.68 
 
 
587 aa  57  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.180539  normal  0.534514 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08317  D-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17520)  30.87 
 
 
560 aa  56.6  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  27.43 
 
 
462 aa  56.6  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1468  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.29 
 
 
484 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827957 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  30.2 
 
 
471 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  27.17 
 
 
432 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  30.97 
 
 
472 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  20.46 
 
 
448 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.57 
 
 
461 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.71 
 
 
473 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  28.25 
 
 
469 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  30.2 
 
 
471 aa  55.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6649  FAD linked oxidase domain protein  26.32 
 
 
471 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477858  normal  0.81174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>